时间又闪回到飞机坠毁的那天。815航班的尾舱部分坠落在海中，正如一开始一样，幸存者们乱作一团，他们中有伯纳德、丽比、辛迪、埃克和安娜·露西娅等23人。刚刚安顿下来后他们受到了“其他人”的攻击。一天夜里，埃克杀死了两个陌生人，处事果断的安娜被推举为他们的首领。他们意识到自己并不是岛上唯一的人群，之后又有三位身体最强壮的成员失踪。

第二次袭击紧接而至，小孩子们被掠走，安娜紧追不放，杀死了对方一人。通过一张名单她断定他们中有内奸，她怀疑是经常离群索居而且没人认识的内森。在她逼问内森时，他被古德温杀死，内森其实并不是内奸。安娜指出古德温才是“其他人”中的一个，他最终死在安娜手上。安娜向幸存者宣布他们安全了，此时埃克也打破了40天来的沉默。

至此剧情的两条线索开始交汇。安娜等人收到了法国女人的无线电讯号，伯纳德回应，确认了他们一行人的身份。迈克、振（Jin）和索伊被扔进了洞里，“其他人”抓走了辛迪。最终安娜等人在丛林遇到了沙隆，误以为是敌人将其开枪射杀。

安娜·露茜亚试图接近被击中的沙隆时，近乎疯狂的萨伊德向她冲过来。对他来说在这个岛上，沙隆就是一切的希望。所以当她死在他的怀里，他一心只想替她报仇。埃克制服萨伊德后，安娜将其打昏并拿走了他的手枪，她明确表示她仍是他们的头儿。

萨伊德醒来后要求他们给自己松绑，他的思想被复仇的念头完全占据。迈克和振（Jin）强烈要求带索伊一起回营地；伯纳德急切地想与罗斯团聚。下令暂缓前进的安娜，领导地位变得岌岌可危。埃克背起神智不清的索伊离开，他告诉安娜这么做是为了自己。伯纳德和丽比无法理解对安娜的决定，之后他也离开了。众叛亲离的安娜让迈克返回他的营地，拿一些食物和衣物的补养来，她要证明没有他们自己会生活得更好。振（Jin）带领剩下的人赶去和杰克他们会合，只留下了安娜和萨伊德。萨伊德冷静地问安娜是否打算杀死他，他承认，如果他处在她的位置也会和她一样，但她的行为导致了超出极端的后果。安娜解开了萨伊德，把枪扔进他的脚下，让他实现自己的复仇愿望，杀了自己。萨伊德会杀死她吗？

振（Jin）和顺（Sun）终于团聚，享受着久违的亲密时光，两人的爱情开始复苏。正在丛林中摘取果实的凯特，意外地在清晨的薄雾中看见一匹神奇的黑马，她简直不敢相信自己的眼睛。

索伊因为血液感染仍然昏迷不醒，杰克检查了他的伤时，他喊出凯特的名字，并说“我爱她”，杰克正一头雾水，凯特急切自告奋勇要求照顾索伊。杰克参加了营地为沙隆举行了葬礼，萨伊德向爱人告别时，在场的每个人眼睛都湿了。

在照顾索伊的凯特遇到了极度恐怖事件，把她吓得魂飞魄散，洛克和杰克回来时发现索伊身边无人照料，电脑也处于极度危险的零指示数。

凯特在对杰克和索伊的感情中挣扎不已的同时，杰克向极度需要朋友的安娜伸出了帮助的双手。米歇尔发现了电脑中一些新的内容，也许正是她夺回儿子的关键所在。

埃克听说圣母玛丽亚的塑像后，反应异常激烈，他打破了其中一尊让克莱尔看里面装的是什么。克莱尔不愿再与瘾君子查理讲话，但他谎称自己不知道塑像里藏有海洛因。他们的谈话被埃克打断，他要求他们带他去塑像被发现的地方，飞机坠毁的地方，原来走私毒品的正是他。

(闪回)埃克还是小男孩，在尼日利亚的家乡，为了救弟弟耶米(Yemi)，被征召入伍，长大后成为毒贩，而耶米成为一位牧师。埃柯买下300个圣母玛丽亚的塑像用来藏毒，准备走私出国，耶米拒绝与他合作，但埃克软硬兼施，答应用赚来的钱帮助村里的穷人，并威胁耶米要烧掉教堂。耶米企图阻止埃克登机却中枪并被拖上飞机，埃克反被拉下，面对赶来的军部，他冒名顶替了耶米的牧师身份。

埃克和查理来到飞机坠毁的地方，通过十字架辨认出耶米的尸体。埃克为死者祈祷后放火烧掉了飞机和里面的所有东西，只留下一尊塑像给查理，作为打破那一个的报答。

与此同时，新加入者安顿下来后，洛克觉得应加强安全管理，把所有的枪都锁起来，但迈克另有想法，他想学射击。尽管洛克知道他想去找沃尔特，最终还是拒绝了他的要求。

查理回到营地，向克莱尔发誓他绝不会碰毒品，当天夜里他却偷偷溜进丛林深处，把他的塑像和其他几尊藏在一处。

(闪回)一对父女慕名来找杰克，杰克不顾父亲的反对，同意为上了年纪的病人动手术。接触中他与病人的女儿加布丽拉熟悉起来，父亲却警告他与之保持距离。病人最终死在手术台上，杰克自责不已，更对加布丽拉产生双重歉疚，他向妻子萨拉说出真相，却被告知她已经有了外遇。

迈克带着从军械库搞来的枪出去寻找沃尔特，杰克和洛克一同前往，索伊围随而来，要向开枪打自己的人寻仇，凯特要求同行被杰克赶了回去。三人在丛林中看见一张熟悉的面孔，正是打伤索伊掳走沃尔特的男子。男子命令杰克等人缴械投降，回到来的地方去，并开枪打伤索伊的耳朵以示警告。男人告诉杰克，沃尔特很好，但是迈克永远找不到他们，因为他还有许多后援。

杰克仍然拒绝放下武器，这时男人打出王牌——落入他们手中的凯特，无奈之下，杰克只得屈服，换回凯特的命。凯特为自己的过失感到内疚，想道歉却遭到杰克的冷遇。满心郁闷的杰克显然不愿如此轻易放弃，他请教安娜，组建一支军队要多长时间。

(闪回)小时候的查理在圣诞节的早上收到了一架全新钢琴，还来不及高兴的他很快发现礼物是有代价的，母亲希望兄弟二人在乐坛上能够出人头地。查理在岛上陷入令人绝望的孤独中，十分想念克莱尔和她的宝宝，但她似乎并不在意他，和洛克相处得十分融洽。

赫利开始采取行动想吸引丽比的注意。同时，索伊和凯特开始意识到杰克与安娜·露西娅的接触越来越频繁，这让他们两人的感觉都很不舒服。查理产生幻觉，克莱尔的儿子阿朗处于危险中，是他救了孩子。抱着婴儿的查理他试图向克莱尔和其他人解释，他只是想救孩子，却招致她更大的不信任。

查理向洛克示好，希望他站在自己的一边，却遭到拒绝，无奈之下，查理只得去找埃克，意外受到他一番话的启发，决心挽救自己爱的人。洛克认为查理在吸毒，暗中跟踪他来到毒品藏匿的地点，他的误解让查理赎罪的希望化为泡影。

查理为了摆脱众叛亲离的困境，决心使出最后一招，但这可能会付出他的生命为代价。