天心参加院士考试，却差点把监考官气的窒息。眼看监考官就要一命呜呼，天心当机立断，折断毛笔，在众目睽睽之下，一把将笔管插进监考官的喉头…天心虽然救了考官，却因为救人手法太过于惊世骇俗，被轰出了太医院！首席太医冷泉下令，天心终生不得再参加太医院医士征选！ 在天心被轰出太医院的同一时间，朱历皇帝要六部尚书跟他席地而坐，一起吃烧饼，聊朝事。于是朱历为了探查民情，出宫去了！ 但李保川的「宝贝」在宫中遭窃，东厂总动员，锁街封路。眼看天心快被抓走，朱历刚好路过，帮天心主持公道。一人单挑众东厂官兵，可怜的是天心、小石头，到处逃窜。 此时一旁的酒楼上。飞贼哲三，欣赏着这场街头恶斗，他身边的包袱，就是李保川的宝贝。 太师府千金大小姐赵湘凝出门，却遇到天心、小石头。 天心打翻了字画摊的墨汁，染黑双手，不小心跟湘凝在巷口对撞，两只手手牢实地压在湘凝的胸前！天心趁乱逃走、留下快气疯的湘凝。 在哲三的帮忙下，天心、朱历终于逃脱。朱历也得知天心参加太医院征选的事，两人留下好的印象，一直是个男人婆的天心，心里对朱历居然起了小反应。 天心已经被湘凝盯上了。湘凝趁着天心、小石头出门的时候，将天心抓走了。

哲三在缠斗中受了重伤，逃进了阉割房。虽然过追捕，但却又阴错阳差、被当成未净身的准太监，在受伤无力抵抗下、被五花大绑上了手术台。但没想到执刀的张师父因为伤风向天心求诊，忘了吃药不能喝酒。张师父头昏眼花、下刀失了准，哲三保住了命根子。不过因为身受重伤、无力逃跑。最危险的地方就是最安全的地方，于是哲三将计就计，假冒太监，躲入皇宫。 天心刚闯祸，马上被大娘下令禁足，在猪肉摊旁严加看守，忽然市集来了大批官兵，颁来圣旨，宣天心进太医院当实习院士。天心、大娘两人面面相觑、不明原因。 天心为了要进太医院，答应了大娘三个要求「非病不理、非民不亲、男装入宫」，这才了了天心多年来的心愿，进了太医院。 天心在太医院受到冷泉为难，成了清洁工，忙了一天的天心，居然在洗澡的时候跟哲三「坦诚相见」。哲三为了蒙混过关，慌称自己是皇上的「密探」，两人互相承诺不说出彼此的秘密。哲三也因为这次，对天心一见倾心。 朱历要保川整饬东厂贪官污吏，捉拿飞贼，交给赵甫嵩处理。保川搬出太后，还找来朱历的表妹云莺来，企图牵制朱历，母命难违，朱历只好带着她去玩。但朱历不知道，其实云莺别有目的…

朱历硬着头皮陪表妹放风筝。云莺对朱历示好，朱历多次想要逃跑不成，于是扯断风筝线，飞到太医院围墙边的树上！嘿嘿、风筝没了，这下可解脱了。但没想到云莺仗着太后撑腰、硬是要皇上上去捡风筝。 朱历想要救出哲三天心，却无法违抗太后命令，前来道别。哲三为救天心，私下向朱历坦白他飞贼的身份。朱历心生一计…

行刑当日，天心、哲三还不见朱历来搭救，心想大势已去，忽然这时李保川接到了封信，马上下令，放了天心、哲三两人。 忽然朱历、哲三同时醒来，原来刚刚是装醉，朱历跟哲三找出黄金瓮后，向哲三献计，要飞贼哲三故意暴露行踪，还要哲三死去… 与哲三商讨过后的朱历，回去经过了湖边，忽然发现女装的天心。朱历一回去，发现天心穿着男装，坐在家里。天心说那是他早逝的双胞胎妹妹，朱历是看见鬼了？ 隔天，哲三引来李保川、赵甫嵩前来抓人，哲三一路逃到了悬崖边，就在走投无路的时候忽然往下一跳。只见黄金瓮跟哲三的尸首跟着深谷的溪水流去。而悬崖边的凹洞里朱历正拉着哲三的手，颇有英雄惜英雄的味道。当然刚刚掉下去的尸首，也只是假人一具。

保川要天心治疗太后的厌食症，如果治不好，就砍了天心的脑袋。但其实太后根本没病，只是缺乏运动而已。 天心三人一出宫，发现附近酒楼传来吵闹声。原来是湘凝在酒楼吃饭，但是钱不小心被扒了，付不出钱，于是跟店家起了争执。天心帮湘凝解围，没想到湘凝一路跟着天心回家，守在天心家门口。 天心生火要湘凝过来烘衣取暖，但湘凝就是不要。天心起了顽皮心，装MAN调戏湘凝，逗着湘凝。天心发现，湘凝想要自在的过生活，不愿意听爹的话选妃。天心于是带着湘凝回去吃饭。

大娘提醒天心，最近因为选妃，没事情就别回来了。原来天心的户卡上记的还是女儿，这时湘凝、哲三吵了起来。哲三故意激讽湘凝。湘凝气不过，砸的天心家乱七八糟，遭来一顿斥骂，湘凝觉得没面子，负气离开。天心喝令哲三马上跟出去看着湘凝。哲三这才知道，原来她是太师府的大小姐。 天心为了救娘出来，决定以女装现身。果不其然，大娘被放出了东厂大牢，知道是天心所救。当大娘看见天心时，吓了一大跳。原来天心办丑出现，以为这样不但可以救出大娘，还可以避免被官兵挑中，可以不进宫选妃。却没想到弄巧成拙，这次选妃专挑长的怪、长的丑的恐龙妹，天心也因此又被抓进宫选妃去了。