龙一郎垮台后，龙吾一人做黑客篡改了所有证据，把罪行全部加到龙一郎身上，这样他就可以成为至高统治者。金山为了查找由娜父亲的下落，依然周旋在龙吾左右，因为这也是做为警察的使命。由娜此时却变得形迹可疑，一方面她爱着金山，另一方面却怀揣着不为人知的巨大秘密。金山籍由掉落在“神狗”船中的项链也同时质疑由娜，但他又不愿去承认这份疑心。矛盾间，金山的同事发现由娜和“神狗”的宋在起，这更证明了由娜的可疑。金山终于暴露了身份，他被围困，而其中正有由娜。

由娜原来是宋的女儿，宋即是崔允浩，他们隐埋真实身份，在“神狗”活动了二十年。就在由娜举枪要杀金山的时候，金山被金永在救下，金永在告诉金山自己也是卧底警察，金山信任中带着一丝迷惑。由娜被命令要删除金山的资料，这样金山就永远无法恢复真实身份。矛盾间，宋代替由娜按下了删除键，由娜其实从心底还是爱着金山。一连串神秘事件又发生了，警察局的管理官被杀，金山被认做嫌疑人遭到通辑，由娜的妹妹又收到电子邮件，知道了姐姐和父亲是“神狗”的成员，由娜以为是金山告诉了妹妹，他们变得相互怀疑，却不知幕后更有他们不知的东西等着他们。

就在金山与由娜反目成仇之际，宋出现了，枪声引来了警察，金山与由娜开始了逃亡之旅。在宋的安排下，由娜返回韩国，金山为追查由娜的行踪也来到韩国，在金永在的帮助下，金山发现了一个奇怪的事实，由娜1982年前的记录是一片空白，而那年正是金山父亲被害身亡的时候。通过调查，金山发现由娜姐妹并不是宋的亲生女儿，而宋才是真正杀害自己父亲的凶手。、

通过金山的帮助，由娜终于忆起当年她的父母也是在那次袭击中丧生的，而凶手正是宋。由娜姐妹与金山从小就有过小小的交集，但是强大的刺激让由娜失忆，宋于是伪装成好人扶养由娜姐妹，以期将来利用她们，而由娜一直以来也把宋当成亲生父亲。宋手中握有由娜编写的足以使日本经济瘫痪的程序，但是尚未完全结束，同时他又把程序输入龙吾的计算机让警方误以为是龙吾所为，龙吾最终被捕，而宋再次逃脱。

由娜决定自首，而一份保存在伊崎处的机密文件终于让金山恢复了警察身份，众人都不由感慨万分。由娜将被遣返韩国，却不料在去往机场的路上发生变故，混迹警察内部的龙吾手下绑架了由娜，由娜被威胁完成程序。就在危急时刻，金永在不顾一切解救了由娜，为了保护由娜被龙吾打成重伤，死在了随后赶来的金山面前。再说宋独自闭关在风间大厦的密室中测试程序，终于被他测试成功。金山从风间龙一郎处打听到宋的所在，他只身前往，经过激烈的心理交战宋终于放弃了程序的启动，就在宋把程序交给金山的刹那，龙一郎突然出现(他从狱中潜逃出来了)，击毙了宋，然后对准金山，开枪射中了他，金山痛苦的倒下，就在龙一郎最后得逞之际，龙吾突然出现刺死了龙一郎，父子俩拥抱着跌倒在地上。