由佐分利引发的西医诊所骚动事件，看上去以仁自己主动离开医学所而收场。然而医学所里仍然还有一部分医生，不把仁的医术放在眼里，就连一直佩服仁的医术并一直持着他的洪庵等也受到这种思潮的影响。某一天仁得知茶馆老板的女儿茜，不慎将油泼在身上造成大面积的烫伤，立即和关一起赶到茜的家里。看了伤势后仁判断必须做皮肤移植手术，并拜托洪庵提供大量的青霉素注射液。洪庵接受了这个要求但是他也向仁提出，做手术时希望让他的朋友在场观看。于是在洪庵和他的那个叫滨口的朋友的注视下，仁开始为茜做皮肤移植手术。手术进行的非常顺利，一直注视着手术的滨口看到这样精湛的医术，掩饰不住自己吃惊的神色。但是此后等待仁他们的却是让人意想不到的事情。

1867年（庆应3年）秋天，天皇重新掌握政权，即历史当中的“大政奉还”，而坂本龙马也是开始了日夜奔走。另一方面，南方仁在对于龙马的事情一直都是非常地在意的同时，也对即将面临着生产、目前正身处在“仁友堂”当中的野风的身体状况非常地担心。而橘咲为了野风的事情也是开始四处奔波，到处寻找合适的产婆，为了能够给野风的生育奉献出自己的一份力量而每天坚持不懈地努力。然而，橘恭太郎却是不断地从幕府的上役那里接到命令，要求继续对龙马的动向进行调查……

有一天，仁在进行了诊断之后得知，野风肚子当中的孩子为“逆生儿”，如果就这样不采取任何的措施而将其生出来的话会非常地危险。于是，仁在“仁友堂”众多好友的协助之下，试图通过“整胎术”和“针灸”等方法将其肚子里的胎儿还原，不过在把野风的身体放在第一位进行了深思熟虑之后，仁最终作出了一个重要的决定……

一直期盼着能够让这个国家得到重生的坂本龙马，他的夙愿“大政奉还”终于是得以实现，这一历史事件也是标志着持续了长达二百六十多年的江户幕府时代的结束。而南方仁也是在此时回忆起，自己在现代的恋人友永未来曾经告诉过他“坂本龙马在自己的生日那天死去”的这一史实，如今距离他遭到暗杀的日子仅仅只剩下一个月左右的时间了。下定决心一定要通过自己的力量拯救龙马的仁，与橘咲、佐分利祐辅等人一同出发前往龙马所在的京都。而另一方面，橘恭太郎却又从上役那里接到了一项命令……

虽然仁他们一心想要尽快地见到龙马，但是即使他们找遍了整个京都的市中心，依然还是找不到龙马的身影。就这样，他们迎来了龙马的生日11月15日这一天的到来。仁最终究竟能否成功地改变历史！？而龙马最终的命运又将会如何呢……！？

?已经被遗忘的头痛病袭来，仁突然意识丧失。几天后仁苏醒过来后回想自己跨越时空的过程，想到那个身份不明的患者….仍然是一个解不开的谜。为野风赎身的事已经决定了，在野风的强烈要求下仁要给野风做最后一次诊察。他与笑一起来到吉原处，然而要帮野风赎身的潘医生也在座。仁在诊察的过程中感觉到野风的身体里发生了某种微妙的变化，她的身体发生了和仁那留在现代的恋人未来一样的病变，然而此时的仁没有办法将这样的事实传达给她。并且笑对仁的感情也是一天比一天强烈，然而又没有办法向仁提出有关自己婚事的话题，已经被摆在桌面上的这一事实。痛苦之中笑下决心将自己的全部想法去找某个人进行商谈。 就在这时发生了对仁和龙马二人的命运具有极大冲击性的事件！

（大结局）

?仁正准备帮助突然遭到刺客袭击的龙马，结果和龙马一起跌落悬崖。然而当仁苏醒过来时到处也没有龙马的身影。于是跨越时空的记忆完全苏醒了…那天，被送来的身份不明的患者应该就是龙马。滕海舟他们到处奔走进行搜查，但是依然找不到龙马的居所。某一天佐分利来到仁的身边，将自己调查的有关乳腺癌的资料交给仁，并说如果发现有怀疑为乳腺癌的患者，希望能够进行调查。仁被佐分利的热情所打动，决定要再一次为野风进行治疗。然而仁考虑到野风还存在赎身的事和恋人未来的事情等，面对已经有明显的乳腺癌征兆的野风，只是含糊的说不知道是不是恶性的，因此还不能最后下决心为她实施手术。另外关于笑的婚姻话题正在稳步顺利的进行着，这一天终于迎来了迎亲的日子然而......