成琳和学谦半夜贴标语，学谦被贾贵抓住。于世勋赶到宪兵队的时候，学谦已经被打得不成人形，高木表示只要学谦把组织名单交出来，就放了学谦。学谦骂于世勋是日本人的狗，于世勋生气的拿出腰带抽打学谦，学谦晕了过去。菊花听到消息之后焦急不已，绞尽脑汁想要把学谦救出来，成琳把学谦进了宪兵队的事情告诉了文三块，求文三块想个办法救学谦，文三块想到一个妙计，他亲自配了一副假死药，想要通过这招浑水摸鱼骗过日本人。于世勋跟高木提出，学谦很听菊花的话，让菊花来学谦一定有效，高木答应了。由于焦二爷不跟日本人合作，日本人将焦二爷的产业全面查封，焦二爷发誓一定要给日本人点颜色看看。菊花和于世勋来到牢里探望学谦，菊花看到学谦惨状心痛不已，借着给学谦喂饭的空挡，菊花将纸条和假死药塞到了学谦的手里，半夜学谦吃下了假死药。 第二天早起，于世勋故意和学谦产生冲突，学谦假死药发作，日本人以为学谦死了，同意于世勋领回尸体，好好安葬。于世勋和菊花带着学谦来到郊外，文三块等人在暗处接应，于世勋放走了学谦。日本人持续给文三块施压，文三块始终不为所动，高木想要对文三块不利，被于世勋劝阻了下来。日本人发令，全北平将时钟调快一个小时变为日本时间，文三块不肯，贾贵警告文三块如果再不拨钟，就要对文三块不利。

当晚，文三块交代后事，就算死也不肯向日本人妥协，全家为文三块的安危担忧不已。早餐后，丁紫玉将迷药放在茶壶中骗文三块喝下，文三块醒来发现自己被绑了起来，恼怒不已。成元把钟拨快了一个小时，刚好被成琳看到，成琳赶来将文三块松绑，刚好碰上贾贵来检查钟表，文三块再次表明自己立场，贾贵把文三块带走了。丁紫玉求菊花想办法救文三块，菊花答应了。当晚，菊花求于世勋救文三块，于世勋束手无策。高木给了文三块三天时间考虑，如果他同意当院长，就放了文三块。焦二爷召集弟兄们，组织抗日活动，一时间北平城不少日本兵被杀，日本人很是愤怒，下令一定要找到幕后黑手。菊花来到三块堂，让丁紫玉从病人的角度说动文三块，为老百姓看病。紫玉来到牢房探视文三块，用老百姓的生命来劝说文三块，文三块终于答应了，但是提出要开一个就职庆典。就职庆典当天，文三块按照中国时间来到现场，对大家讲明为什么自己会出来当院长，并且表示穷人看病不仅不收诊金还送药费，老百姓拍手称快。

就职庆典之后，大伙聚在三块堂，对文三块的演说拍手称快。文三块从看病必收三块大洋，到现在免费治病还赠药，有了很大的转变，众人问起了当年收三块钱的原因，文三块这才将缘由娓娓道来——当年自己的父亲悬壶济世，常常给病人义诊，然而自己生病，却少了三块钱药钱，病死了。从此之后，文三块立下规矩，治病一定要收三块大洋。后来文三块遇到了张宗翰等人，被大家感动，才慢慢转变。焦二爷的反日活动愈演愈烈，日本人的警惕越来越严密了。高木怀疑焦二爷和暗杀组织有关，叫于世勋密切关注焦二爷。于世勋劝告焦二爷不要再跟日本人对着干，但同时也跟焦二爷表明心迹，自己是绝对不会出卖焦二爷的，焦二爷听到这番话，顿感安慰。北平爆发瘟疫，海东升作为日本方面的医疗顾问回到北平，日本人下令，瘟疫病人不需救治，集中拉到城外消毒，名为消毒实际就是活埋。日本人来中医院抓病人，老百姓都不敢出门就医，文三块收拾出家中后院偷偷救治病人。绿袖和丁福天回到北平，丁福天和日本人交往密切，绿袖非常担心。徐掌柜被当做瘟疫病人带到郊外消毒，文三块焦二爷得知消息之后伤心不已，文三块发誓一定要将瘟疫治好。文三块找到高木，探讨治疗瘟疫的办法，碰见了久违了的海东升。文三块表示自己有防止瘟疫的特效药，要求高木同意自己给病人治疗，高木没有同意。

吉野为了文三块的事情头痛不已，贾贵向吉野献计，要吉野扶持张宗翰成为另一个医院的院长，这样一来就可以把文三块的嚣张气焰打消下去。贾贵来动员张宗翰，吃了钉子。连续两次过后，高木主动来请张宗翰，张宗翰并没有买账，回去后，高木叫来贾贵，询问张宗翰的家庭情况，要贾贵从张宗翰的亲人方面入手。张宗翰的侄子国良被日本宪兵队抓走，高木拿国良的三根手指威胁张宗翰，张宗翰在宪兵队领回了伤痕累累的国良，心痛不已，一边是血肉亲情，一边是国家大义，张宗翰很是为难。成元想要将事情告诉给文三块，张宗翰担心文三块惹麻烦，拒绝了。为了不做汉奸，张宗翰决定今后不再行医，日本人知道之后，将国良和馨月捆了起来，用他们的生命威胁张宗翰，张宗翰仍然不为所动，高木将二人放了，三人抱头痛哭。高木听说张宗翰对皇帝很是忠诚，用皇上的圣旨压制张宗翰，张宗翰深感皇命难违，主动找到高木司令官，答应了和日本人合作的请求。

当晚，张宗翰写下遗书，穿上了自己最重视的朝服，为了不违背自己不做汉奸的原则，饮下毒药自尽了。张宗翰的死给了文三块很大的打击，焦二爷听说之后发誓一定要给日本人好看。学谦乔装打扮，又一次回到了北平。文三块仍然为瘟疫的事情奔波，收治了很多的病人，眼看事情就要露馅了，成元建议给日本人下毒，让日本人也染上瘟疫，文三块开始着手给日本人下毒的事情。听说文三块收留瘟疫病人，贾贵带着人来搜查，文三块将病人偷偷藏入药房之中，日本人毫无收获，悻悻而去。日本人查得紧，焦二爷和文三块开始着手送病人出城的事情，病人乔装成要饭的被日本人发现，全军覆没。成琳和组织上的人接头，才发现跟自己接头的人正是学谦。高木发现死了的乞丐都是焦二爷的手下，对焦二爷和文三块密切关注了起来，文三块苦于没有办法给日本人下药，成琳提出她有办法。成琳找到了给日本兵当厨子的林师傅，软硬兼施，林师傅无奈之下同意给日本人下药。 文三块准备给日本人下药，怕日本人拿家人威胁，用调虎离山之际将门口盯梢的人调走，全家人趁这个功夫全部转移。日本士兵毒发，海东升建议高木请文三块给军人看病，高木同意了。文三块同意给日本人治病，前提条件是高木同意他医治所有的瘟疫病人，高木想要用文家人威胁，却发现文家只剩下文三块一人。

文三块发现高木咳嗽，断定他过几天必有大病，高木并不相信。丁福天和绿袖来到警备所劝服文三块，希望文三块能够为家里人着想，给日本人治病，文三块表示自己实在无法忍受日本人的暴行，就算舍生取义也在所不惜。丁福天表示让文三块先答应日本人，自己会全力劝服高木，让百姓拥有就医权。文三块发觉丁福天和日本人交往过密，丁福天表示自己确实在和日本人合作，但是他合作的目的是为了救老百姓，文三块表示难以理解丁福天的汉奸行为。贾贵从车掌柜手上拿到一张治疗痢疾的祖传秘方，呈给了高木。高木有了秘方，认为文三块无用，放走文三块，目的是引出文三块收留病人的证据。文三块一回家，高木就带着人搜查三块堂，将文三块抓走，想要枪毙文三块，没想到车掌柜的秘方加重了士兵的病情，车掌柜也被抓了起来。成琳和学谦二人终于成功的将病人送出了城。高木表示，只要文三块肯给日本人治病，就放了车掌柜，于世勋劝说文三块，文三块不甘心，明明眼看着老百姓就有救了，文三块陷入了巨大的矛盾当中。高木拿车母的性命要挟，文三块终于同于救治日本人，车掌柜回到家，伤重不治身亡。成林告诉文三块，日本人要去根据地扫荡，文三块用一副药将日本人送到了游击队的枪口下。