在埃及一所大学演讲的Mohinder得到了一个工作机会，提供他这个工作的人拥有把物体变成黄金的能力。Claire父女隐姓埋名开始了新的生活。洪都拉斯，一对兄妹正在逃避追踪，他们妹找了人蛇，企图偷渡到美国，他们的命运又将如何呢？

Hiro穿梭时空回到1671年的日本，利用时间停止的能力带走了一个拿着圣剑的武士，但他并非剑圣，正在Hiro为自己可能已经改变历史而感到恐慌时，铸剑师的女儿又在此时出现了……

Matt用了读心术顺利通过警察考试，得到了新的警徽。Molly最近噩梦不断，Molly画得的图更是让人惊心。Ando拿着报纸去见 Hiro的父亲，Hiro的父亲打开报纸，一张他的照片翩然落下，照片中他的脸上已经被印上了那个反复出现的标记，他说自己活不到24小时。

Nathan为Peter的死而颓废，他也收到了和Hiro父亲同样的照片。Bennet一家的晚餐，被一个电话打扰了，打电话的人居然是远在开罗的Mohinder，到底他们设了怎样的圈套，又抱着什么目的呢？

Claire的新同学拥有飞行的能力，并且知道Claire与众不同。失去记忆的Peter被缩在集装箱里面，他连自己是谁都不知道。

蜥蜴

皮特被那三个想偷MP3播放器的人囚禁了起来。那三个人没有偷到MP3无法向上面的老大交货，老大派人来想抢走三个小偷其中一个的妹妹。皮特运用超能力击退了他们，但小偷不仅一点不感激，还用一个装着记录着皮特身份资料的盒子威胁皮特帮他们再偷一批货物好让他们交差。

克莱尔永远都无法抑制对自己拥有的超能力的好奇。她在生物课上的发言使得她的那位男同学又缠上了她。看过老师在课堂上演示的蜥蜴腿再生录像以后，克莱尔回到家剪断了自己的脚趾，几秒钟后脚趾又长回来了，不妙的是这一幕刚好被她的同学看到。

马特在调查中村谋杀案的时候传讯了佩丽的母亲，佩丽的母亲察觉到马特有读心的能力。佩丽到警察局来保释母亲的时候，他母亲突然开始发狂，平静下来以后手上握着一张自己的照片，上面被标上了那个神秘的符号。

莫希德接受了公司的工作，前往海地救一个被病毒感染的人(第一季中的海地人)。莫希德给海地人注入自己血清救好了他，最后却被洗脑。

逃难的兄妹准备偷渡到墨西哥，找到他们以前的一个朋友帮忙。但在偷渡的过程中玛雅不受控制的能力又开始发挥作用，差点害死了他们的朋友。

中村回到古代日本代替剑圣完成了他的使命，并说服了剑圣戒酒创造属于自己的历史，却发现剑圣有和克莱尔一样的能力。

痊愈后的海地人回到克莱尔父亲的身边，准备去找到伊萨克所有的画。

本集最大的看点就是赛拉(Sylar)的回归，可是我们的恶魔王子非但没有从上一季的剑伤中恢复过来，而且失去了所有的超能力，包括他窃取其他超能力的学习能力。彼得(Peter)因为那个存有他的身份及过去的木盒为黑帮卖命，抢劫了赌球中心的运钞车，并在叛徒的枪口下救得小头目的性命。但我们也看到了彼得身上存在的阴暗一面，这也让他选择了回避自己的过去。中村宽帮助剑圣回归了正统历史，同样因爱上了铸剑师的女儿而放弃了回归现代。莫欣德 (Mohinde)又回到了茉莉(Moli)的身边，而且组织给他设置的实验室居然是在预言画家的家中，他帮助本内特(眼镜男)找到了最后一幅画的内容。

DL已经死了，尼基(Niki)患上了海地人一样的病，她将麦加寄养在陌生人的家中，向组织求医。克莱尔(Clair)延续上一集的“蜥蜴”脚趾甲事件继续和Wist纠缠，而Wist也向她展示了飞翔能力，原来他们都是超能力者。Wist脖子上的伤口和莫欣德发现的图画内容让克莱儿一家陷入阴影的笼罩之中。

善良的陌生人

上一集末，克莱尔的养父知道了第八幅画中的内容——他被杀死，画的阴暗处克莱尔与一位男子在拥吻。因此他知道只有阻止克莱尔约会，才能阻止这件事情的发生。当养父暗示克莱尔这个时候不应该交男友时，克莱尔答应了。但是爱情的力量是伟大的，在贝弗利山上的浪漫一夜后，克莱尔决定暗地约会。

玛娅一行还在奔往美国的路上，途中他们遇到一个晕倒在地的男子——赛拉！塞拉发现Maya和她弟弟的能力后，又开始酝酿阴谋了。

这一集，出现了一个新的能力者，是麦加所寄养的那户人家中的大女儿，她只要看一眼，就可以学会她想学的东西。

马特来到内森的家中，找到了那两张碎照片的完整版。马特惊讶的发现，在他十三岁时就离开他的父亲竟然也在照片中。他让茉莉帮忙找到他的爸爸，谁知茉莉一看到照片就惊叫了起来，原来马特的爸爸就是一直出现在茉莉梦中那个人。茉莉最后还是决定要帮助马特，刚找到就被他爸爸发现了，茉莉陷入了昏迷中……

作战抑或逃遁

上一集最后，茉莉被马特的父亲用超能力困在了梦境中，情况非常危险。这一集一开始，马特就和内森一起找到了马特的父亲，却被其欺骗，困在了可怕的幻境中。弥迦帮助莫妮卡发现了自己的能力，莫妮卡开始进行有针对性地训练，她希望能够做一番事业。

远在爱尔兰的彼得仍然沉浸在爱河里，但是好景不长，公司派出了一个狠角——拥有电能力的艾勒来找彼得。艾勒一出场就杀死了彼得情人的大哥，看来后面免不了有场恶仗。

莫欣德发现茉莉的身体正在衰竭，万般无奈之下只好求助公司，公司答应照顾好茉莉，但要求莫欣德继续执行任务。

中村继续在古时代的日本帮助剑圣，这一集中，他们即将开始对抗白胡子军团。

线索

彼得与女友决定一起到加拿大蒙特利尔把事情弄清楚。他们来到了彼得画中的地方，一进去就发现了一张留给彼得的字条，上面说世界正处于危险中，彼得抱着女友，心中非常希望知道未来到底发生了什么，结果他就身体内的时空转移能力让他俩到了2008年6月14日的纽约，这时的纽约早已是空城。

克莱尔希望能加入啦啦队，但是啦啦队队长黛比却故意刁难，不让她加入。克莱尔的男友帮她出了主意，两人联手让黛比当众出丑，结果黛比被撤掉了啦啦队队长的职位，克莱尔顺利进入啦啦队。

贝内特先生与海地人来到了莫斯科，找到了伊凡，用消除他的记忆威胁他，从他那里逼供出了那八幅预言画的所在地。最后贝内特更是狠毒的把伊凡枪杀。

在古时候的日本，中村宽所爱的女人发现了之前救她的人都是中村，他们俩在森林里拥吻，却被剑圣撞见，剑圣一怒之下投靠了白胡子阵营。

莫欣德不肯帮助公司在人体试验病毒，本想离开公司，但是公司突然转变态度，向莫欣德道歉，以新的计划来诱使他留下来。结果却派了妮基与他合作，其实是想用妮基来试探莫欣德的忠诚。

赛拉与两兄妹来到了美国边境处，碰到了当地巡检人员，赛拉一直用言语怂恿着玛雅，让她杀死了所有的巡检人员，还是的兄妹俩关系恶化。