玉珠涉嫌杀害淑兰淑兰屍体被发现，玉珠成嫌疑犯，展杰上门拘捕她。宋慈为淑兰验屍时发展她死前曾被奸污，案件有可疑。时高云轩巡视松山县，并带回离开已久的子龙，子龙被云轩提拔为司理，宋慈恭喜他，但子龙反应冷淡。云轩请子龙复验淑兰屍体，子龙推翻宋慈的判断，发现屍身上有榉树汁，假意做成被打伤的伤痕。宋慈表明并没涂上榉树汁伪造证据，以洗玉珠杀人嫌疑，云轩建议宋慈应避嫌，不应再调查这宗命案。宋慈再三问玉珠案发当日所发生的事，玉珠想起曾遇上孙婆婆，但众人往树林寻人时，郤找不到孙婆婆和她的木屋，宋慈更觉可疑。久别重逢，子龙一反常态对众人非常冷淡，更指责展杰没替玉珠验打斗伤痕。丹凤喜滋滋去找子龙，但子龙只是冷淡打发她，丹凤失望。子龙带人到玉珠家搜查，发现孙婆婆给玉珠所换的衣衫，衫上更染有血液，玉珠被收监。宋慈为玉珠辩护，反指孙婆婆身份有可疑，似是一个大圈套，一切有幕後高人指挥策划。後宋慈在纸扎铺调查时遇上刺客攻击，手部受伤。丹凤与香姑发觉云轩行动有可疑，逐加以跟踪，竟发现云轩往城郊与紫霞郡主会面，幕後主?开始现形。玉珠在狱中意志消沈，为免连累宋慈，叫宋慈取消婚约，但宋慈拒绝，并安慰她说一定会找出真凶，还她清白。

子龙指证宋慈杀人宋慈求见郡主，查问她回松山县的原因，郡主淡然说只为悼念国楝死忌。宋慈推断郡主可能是幕後主?，特意约子龙会面，向他表明一连串命案是冲著自己而来，子龙只是敌人利用来报仇的棋子。子龙听後不服，反驳宋慈是妒忌他飞黄腾达，胡说八道只想打击他的自信。宋慈无奈，决定想办法对付郡主。宋慈叫玉珠假意向郡主求情，借机试探，但未能问出端倪。全县村民都怀疑玉珠是凶手，玉珠担心，宋慈不断安慰，叫她不要轻言放弃。玉珠借机会撮合展杰与如梦，展杰感激。展坚见如梦心地善良，为孤儿请命不遗馀力，终於放下成见，接纳如梦。七叔在常满粥找香姑辟邪，对丹凤说见到淑兰死前与玉珠同往紫竹林，丹凤大喜，并通知宋慈找到证人。宋慈立即去牛头山找七叔，但找到的只是七叔的屍体，时云轩手下丁副将率领展坚到来，力指宋慈杀害七叔，宋慈百词莫辩。展杰往紫竹林搜查时遇上玉珠，更发现玉珠的削竹刀和竹筒，证据对玉珠不利。公堂上，子龙指证玉珠是杀人凶手，宋慈为她辩护并加以否认，子龙反指是宋慈助玉珠杀淑兰，更杀七叔灭口，因宋慈熟悉屍体结构，深明医理，可杀人於无形。宋慈听後怒极，逐找少将军伯豪来当证人，证明自己无杀七叔。宋慈洗脱嫌疑，但玉珠郤苦无证据以示清白，须被收监，众人担心不已。

宋慈与玉珠被判死刑丹凤质问子龙为何冤枉玉珠是凶手，子龙反向丹凤表白，谓心系於她，渴望与她分享现时成就，丹凤不知所措，子龙竟迷晕丹凤成其好事。玉珠在狱中受尽酷刑，宋慈不忍，逐对子龙保证只要他能替玉珠翻案，可把官位让给他。子龙再验屍找出新证据，要求云轩代为引见郡主。子龙以新证据跟郡主交易，要求取代宋慈当提点刑狱司，郡主则要宋慈的人头。子龙答应宋慈与他合作，二人找到沾有毒液的银针与竹筒，翻案有望。公堂之上，子龙出卖宋慈谓杀七叔的凶器上有宋慈指纹，宋慈早料到他有此一著，反咬子龙一口。子龙恐吓丹凤不与他合作出卖玉珠，她与香姑便有危险，丹凤无奈答应。

丹凤替十皇爷传口讯约宋慈在渡头见面，另一边厢，黑衣人劫走狱中的玉珠，并送她到渡头找宋慈，时云轩到指宋慈劫狱杀人。公堂之上，丹凤拒替宋慈作证，结果二人被判处斩。宋慈要求在狱中与玉珠成婚，被郡主阻止。处斩当日，十皇爷与伯豪劫法场不果。当子龙献上宋慈人头给郡主，展坚到谓宋慈身上有毒不能接触，郡主与子龙中毒，时宋慈和玉珠出现，迫使郡主讲出真相。郡主临终前以刀刺宋慈，玉珠为救他而代挡一刀，性命危在旦夕。宋慈认为自己是天煞孤星会克死玉珠，毅然离开，玉珠康复後决意上路找宋慈，两人能否相遇，改变命运呢?