袁世凯释放汪精卫收他为义子，武昌城被冯国璋放火焚烧，武昌沦陷，轰轰烈烈的辛亥革命陷入了南北对峙的局面。孙中山乘船回国，在座舱内，孙中山和胡汉民、廖仲凯商议南北议和之事；船到吴淞口岸，黄兴、汪精卫、陈璧君和各界群众前去码头迎接孙中山。在孙中山住处，孙中山与黄兴、汪精卫、廖仲凯、胡汉民、宋教仁等各位国民党要员交谈，并阐明自己观点，革命不达目的，根本无议和之言。十六年前被孙中山接生的孩子区小妹和她的姑姑历尽千辛，终于与孙中山相认，并被收留，安置在卫队，从此跟随孙中山参加革命。中华民国第一任大总统选举的那天夜晚，在上海宋嘉树公馆内，孙中山正在与宋嘉树畅想未来的共和国应该实行怎样的国体，并带领国人为了实现自己理想永远向前时，刚得到消息的宋蔼龄、区小妹等点燃鞭炮，祝贺孙中山当选中华民国临时大总统。

1912年1月1日南京总统府大礼堂内举行庄严的总统就职典礼，各省代表及军政长官与宋嘉树夫妇和宋家子女参加隆重的就职典礼。孙中山在礼堂内庄严宣誓，全体代表和观礼者掌声雷动，总统府门前烟花四处，人们雀跃欢呼。北京袁世凯总理大臣府，袁世凯、段祺瑞、冯国璋等北洋军阀密谋要誓死抵抗孙中山就任大总统。孙中山在总统府内为国库筹款而紧张的忙碌着，并和黄兴等人去军医院慰问伤兵，见到了副院长陈璧君。章太炎因为主张不同，对黄兴有成见，孙中山积极调解；孙中山与宋嘉树亲切交谈，他们为国家政局的前途感到担忧，陈其美、蒋介石为排除党内异已分子，密谋暗杀了章太炎的同伙陶成章。刘师复和战友为了革命速成，暗杀袁世凯，失败后伐幸逃脱。面对南北僵局，为了早日结束清朝统治，孙中山提出五项条件，如果袁世凯答应了，即履行诺言，将总统之位让给袁世凯。当年在伦敦为清政府效力曾诱捕过孙中山的邓廷铿，十六年后再次见到孙中山，感到无比愧恨，愧疚之下，自杀身亡。

孙科从美国学成归来，投身革命事业。公元1911年2月12日，统治中国达267年之久的清王朝终于宣布退位了，从此，中国结束了几千年漫长的封建社会进入到一个新的时代。南京总统府办公室，孙中山召集黄兴、胡汉民、汪精卫、廖仲凯等交谈，孙中山提出大清皇帝已退位，我必须实行自己的诺言，辞去大总统职务，推荐袁世凯为第二任临时大总统。孙中山与宋蔼龄交谈，讲到辞去大总统后的个人志向，谈到广东人事变更，孙中山坚决反对自己的史长孙眉担任广东大都督一职。孙眉因没有当上广东大都督，来南京总统府和孙中山发火，孙中山晓之以情，动之于礼地劝说大哥，孙眉就是不理解，愤然离去。为了削弱袁世凯在北京的封建军阀势力，孙中山主张在南京建立政府，叫袁世凯到南京宣誓就职，曹锟的部下反对袁世凯到南京就职，发动了兵变，孙中山为了避免百姓遭受生灵涂炭，决定同意建都北京。宋蔼龄向孙中山报告，内阁人选名单中实权部门全被袁世凯的亲信占据；孙中山决定回乡祭祖。

1912年5月下旬，孙中山回到家乡看望乡亲父老，并到陆皓东坟前祭拜，孙中山回首往事，感慨万千；并向兄长孙眉赔礼。兄弟二人冰释前嫌、和好如初。孙中山去澳门看望陈粹芬，陈粹芳已人去楼空，只留下一封信给孙中山。在回家的渡口，见到了陈粹芬收养的女儿。由于袁世凯只要从共和所得到的实权，而不要共和所主张的民主，孙中山非常气愤，于1912年7月回到上海同盟会本部，因陈其美、蔡元培、宋教仁等纷纷从袁世凯内阁辞职，内阁里已没有牵制袁世凯的力量了，孙中山决定去北京与袁世凯共商国策。1912年8月下旬孙中山与袁世凯在总统府会晤，共商国家大计。1913年2月，孙中山夫妇和宋嘉树夫妇起程前往日本考察铁路。袁世凯把坚决维护临时约法的宋教仁看成心腹大患，1913年3月20日，袁世凯派刺客暗杀了宋教仁，公开破坏临时约法，反对共和，孙中山听到宋教仁被害的消息，急忙赶回上海，召集黄兴等共商讨伐袁事宜；由于内部出现反对意见，袁世凯得以可乘之机，国民党坐失良机，二次革命虽在全国发动，却仅仅坚持了四十八天，就以惨败告终。孙中山、黄兴等一批革命党人再次流亡海外，回首苦难深重的祖国，孙中山不得不开始了他更加深刻的人生思索。

袁世凯得知孙中山等人逃亡日本，一面献媚日本政府以求抓捕孙中山，一面对革命党人开出巨额悬赏捉拿，并派人去日本刺杀孙中山。宋庆龄大学毕业，从美国来到日本。见到从小就崇拜的孙中山心情不好，就天真的讲故事来振奋孙中山的精神。宋霭龄给宋庆龄讲这几年的经历，宋庆龄对姐姐能在孙中山身边工作羡慕不已。宋嘉树带宋庆龄到浅草寺拜祭时，道出对霭龄似乎爱上孙中山的担心，宋庆龄不以为然，买了许多风铃送给孙中山。1914年2月26日，袁世凯为灭暗杀宋教仁事件之口在府中设宴，用毒药害死赵秉钧。孙中山召开国民党改组大会。会间，孙中山总结了以往失败的经验教训，提出严格组织纪律，党员必须服从首领的命令。黄兴表现出不满。会后，庆龄兴高采烈地整理记录，霭龄则对黄兴等不同意见表示担心。国民党内部骨干对孙中山的提议出现分歧，大家请黄兴出面劝阻孙中山。不想两人意见不一，出现激烈争吵，黄兴一怒出走。黄兴要赴美养病，孙中山把酒为他饯行。席间，孙中山写下“安危他日中须仗，甘苦来时要共尝”。宋嘉树为了阻止霭龄对孙中山的感情发展，决定将霭龄嫁给孔祥熙，霭龄迫于压力同意成婚。宋庆龄正式成为孙中山的秘书。孙中山第一次接见蒋介石，孙中山命他回上海发展力量，准备起义。庆龄为姐姐送行，霭龄提醒她要和孙中山保持距离，以免产生感情。

1915年2月，袁世凯为了达到称帝的目的，向日本政府求助，日本政府便借机提出“二十一条”作为交换条件。孙中山在国内的一片声讨之中发现李大钊的文章和自己很有共鸣。梅屋庄吉请孙中山到自己家中，交给他黄兴托人从美国转来的蔡锷将军提供的有关“二十一条”内幕和推翻袁世凯打算的密码电报。宋庆龄为孙中山翻译电报，胡汉民看着两人忽然觉得他们关系不一般。孙中山收到哥哥孙眉去世的电报，深为不能回国奔丧而感到痛心，胡汉民、陈其美和廖钟恺等人商议如何阻止宋庆龄和孙中山的感情发展。胡汉民来找宋庆龄谈，碰壁而回。宋嘉树收到廖仲恺的信，立刻发信称自己病重，让庆龄回上海。宋庆龄留信出走。孙中山急忙去追，在火车站孙中山追到宋庆龄，心灵的撞击使两人拥抱在一起。1915年5月9日，袁世凯签署了丧权辱国的“二十一条”，全国掀起了反日倒袁的群众抗议浪潮。胡汉民和朱执信来说劝孙中山，请他不要和宋庆龄发展感情。这反而使孙中山在内心更加确定了对宋庆龄的感情。