霍香从李南风口中得知，将霍家满门抄斩的圣旨可能是假的，霍香答应李南风在事情没查清前不杀皇上。秦简让皇上穿上自己的衣服，端茶倒水，必恭必敬。皇上怀疑他知道自己的身份，秦简求皇上要逼他离开京城，成全他与阿秀的婚事。小竹屋内，承九少爷得了一种怪病，且病情越来严重，如再找不到良方秘药，恐怕过不到秋天，梁伯焦急万分，不知华佗药谱在那里。秀容回到寝宫，看到皇上穿著秦简的衣服回来，误以为是秦简，扑了上去，并说很想念秦简，令皇上妒火中烧，指责阿秀在外偷情，且将阿秀给秦简的信拿了出来，初一与秀容恍然大悟，在宫外自己的家里一定是真娘娘。丞相带霍香来到按照当年霍家大院仿造的霍神医家，表示要寻得霍家后人，纪念霍神医的恩德。　

在丞相设计下，霍香在梁伯面前承认是霍家后代，并深信丞相，托其查出传圣旨的人，丞相借机询问霍香华佗药谱的下落。李南风告戒霍香，要看清是非。秀容知娘娘和秦简一起感到不放心，而初一也要想找娘娘，两人化装成太监，溜出宫外。为断秦简与秀容的关系，皇上下旨将丞相之妹梁凤许配给秦简，秦简接旨后遂决定逃婚。丞相为得霍香的信任，把传旨将霍家满门抄斩的吴非交给了霍香。秦简带着朱秀容|萧璃一起逃婚，皇上获悉，命李南风去追。初一与秀容回到家，却被朱母反锁在家，半夜两人逃出。梁凤带着五丑追赶秦简与萧璃，为救萧璃，秦简身受重伤，危难时已跑掉的萧璃赶回将秦简救走。霍香跟着李南风来到郊外，寻找秦简，按照皇上的旨意将秦简带回去，与梁凤结婚。萧璃将秦简救往小茅屋，生命垂危，声声叫着阿秀，令萧璃感慨万分。

秦简昏迷不醒，朱秀容|萧璃只好以口给秦简药，此景恰被秀容、初一看见，秀容醋意大发，大骂两人后离去。而李南风与霍香也寻到此，南风请娘娘回宫，萧璃却说自己是卖烧饼的，霍香见萧璃对秦简的温柔，也误认为是秀容，李南风只好让他们离开。秀容遇上梁凤等人，梁凤认定她是娘娘，欲杀之。李南风、霍香赶到，吓走了梁凤等人。宫中元老白望之又劝皇上生太子，否则皇上三十五岁前，不能册封太子，就须退位让贤。皇上要秀容生个太子，秀容、霍香费了不少唇舌，才令皇上明白，有一个跟秀容长得一样的萧璃。虽然弄清谁是真娘娘，但皇上已深爱直谏的秀容。萧璃、初一细心照顾受伤的秦简，秦简表示待其复原后，就送萧璃回宫，然而真娘良已不想回宫。

秀容劝霍香直接询问皇上霍家之事，皇上承认圣旨的大印是自己的，但对内容全不知情，皇上答应会彻查。皇上找梁伯对证，梁伯表示没有见过此圣旨，梁伯为表清白，陪皇上到尚书省，经查却是一份假圣旨。皇上气得大发雷霆，不过同时醒悟自己不理朝政，害得霍家无辜丧命。秀容提醒皇上，宫里只有丞相权力最大，故嫌疑亦是最大。皇上派李南风暗查此事，被丞相虚情假意蒙蔽的霍香，不信假圣旨是丞相下的。皇上被白望教唆，大清早跑去帮秀容做烧饼，惜被秀容教训。秀容朴实的做人道理，又让皇上茅塞顿开，回到御书房，即召梁伯命寻找真娘娘。梁凤见皇上宠爱秀容，往找哥哥商量，却遭到痛斥。恼怒下，梁凤戳穿梁伯的野心，想让自己的儿子承九继承皇位。身患重病的承九一直把梁伯当成叔叔，不知自己是亲生父的一颗棋子。

各州府接到圣旨，寻一名叫朱秀容|萧璃的女子，假冒娘娘寻到后就地处斩。秀容找白望之，称自己再见不到娘亲与舅舅就要出宫。白望之与皇上接到告，秀容要出家为尼，两人赶到护国寺，情急下白望之急忙回到朱母处，叫朱母快去救秀容，然而朱母坚信秀容不会出家。梁伯获悉一切，则迅速将朱母、周昌接到了娘娘的静安宫。秀容终在静安宫见到了娘与舅舅。初一、萧璃在船上照顾受伤的秦简，吴非找到在船上的娘娘，初一为保娘娘性命，投河自尽。霍香来到丞相府，告之有人假传圣旨，要丞相帮忙调查，梁伯引出霍家遭满门抄斩是由华佗药谱而起，而霍香却说从未见过华佗药谱，临走时霍香见一枚印有初一及璃字的金钗。

大家觉得初一可能出事，霍香求李南风去查金钗的事，应天府张大人来向李南风报，他们接到皇上密旨，要将娘娘朱秀容|萧璃杀死。皇上命南风务必将密旨追回，李南风去质问丞相，为何要篡改圣旨杀娘娘。霍香来到丞相府后山采药，无意间见到不能见光的承九，忆起父亲霍神医临死前的告诫，若见到一个患销魂蚀骨症的人，绝不能救他。早朝，众文武百官询问皇上娘娘是否怀上龙种，否则，就将退位。不料，此时娘娘丫鬟来报：「娘娘怀孕了」。静安宫，秀容、霍香正忙着做假肚子。秦简、萧璃逃到一小屋，钱大娘收留了他们，深夜，他们被梦游的钱大娘吵醒，却发现当年陈留郡太守贺庸的绝笔信，信中揭露了当年丞相假造圣旨，将神医霍家满门抄斩的真相。娘娘怀孕，白望之忙碌非常，又送补药及补品。梁凤找来太医，命其将堕胎药放入秀容的补汤里。