眼见屠进杀戮太深，为解救武林，柳飘飘和毕凡将所有功力传给段飞，然段飞得各高人功力，依然无法突破如来神掌。心头还如千斤重，反复思量九式如来，全是杀人招式，加上一时间无法融合各人功力，苦不堪言。雪华心疼不已。 另一方面，柳飘飘为帮毕孤报仇，决定与毕凡前往烟霞山庄，趁屠进不在山庄，希望可以救出碧云，然后结合「双飞」之力，或许可以与天残神功一决高下。雪华，雪娟得知，随同二人连夜潜入山庄，一番打斗后，救出碧云。 母女见面自然痛哭一场。碧云悔恨不已，一切皆因自己而起。柳飘飘安慰，合二人之力对抗屠进，二人虽知不能打败屠进，但只要能减其威胁，也叫对师父有交待。同时希望给足够的时间让段飞突破如来神掌。柳，碧云两人多年恩怨化解，和好如初。众人计划如何杀屠进，雪娟不忍见到如此结局，不愿屠进再杀人，更不想父母相残，希望可以唤起父亲的良知，于是找到屠进，希望屠进能洗心革面，一家人重归于好。 屠进终为雪娟着想，道出只要龙段飞自废武功，少了威胁，便可以息事宁人，雪娟开心把消息带回，怎料原来屠进跟踪雪娟找到众人下落。此时段飞体内各人真气再次作崇，不能动弹，为救段飞，碧云、柳飘飘毅然联手，毕凡的五指弹，无定飞环和九索飞玲力战屠进。陆小瑜等趁机带同段飞，雪华，雪娟等人。最后柳飘飘，毕凡皆被重创，碧云救两人离去，力敌屠进，终为其所擒，碧云以为必死无疑，屠进指目标一日未达成，终不会让碧云死，竟狠心废其武功。 而段飞等得知消息后，悲愤莫名，雪娟更是内疚不已，认为是自己害了众人。而此时段飞因无法控制体内真气，手无束鸡之力，武功尽失如同废人一般。段飞眼见那么多的人为自己而牺牲性命，他开始感到惘然，开始怀疑自己是否解救武林的人选，或许自己的死才是真正的化解方法。

段飞留书，悄然离开陆小瑜等人，准备找屠进一拼死活。陆小瑜发现，大惊，急追段飞。然段飞心意已决，他不想再有人为自己而死，要用自己的性命化解这场恩怨。陆小瑜为之气结，痛骂段飞，最后兄弟二人竟大打出手，雪华等三人望之，惨然。段飞终于醒悟，兄弟抱头落泪。段飞对天起誓，绝不辜众望。 蓝天之下，众人继续逃亡，苦不堪言。 然段飞与众人皆坚信可以找到三百年前「冼残阳」兄弟的起源。依照智能死前的指引，遂按图索冀，最后找到了一个偏远的小村落，村人与世无争，仿若是世外桃园，与外边的杀戮世界迥异，段飞等人对于这种生活羡慕不已，然而村中没有人知道如来神掌的传说。段飞等再度失望。 时听到童谣：「路遥遥，天迢迢，狂沙掩闭残阳笑，如风来去人渺渺……」，段飞细问之下，终从一个说书人的口中得知天残神功和如来神掌的整个故事。当年创出天残神功的「贺问」，「贺天」两兄弟横扫天下，后贺问因杀戮太重，为阻止贺天。在天残神功之上创出如来神掌，决定挑战向天，来一场生死决。绝岭之上，如来本胜一筹，但贺问为让弟弟贺天醒悟所做之事，终死在天残神功之下。贺天得意之时，惊然发现如来神掌心法原来千变万化，知道真正结果应该是自己输得惨烈，悔悟后连同所着的天残神功秘籍跳崖自尽。自始天残神功和如来神掌便消失人世。直至火云邪神有缘入得古墓山，看到心法，终其一生功力，也只能悟出九式如来！段飞及雪华、雪娟决定找寻藏着心法的山洞，同时段飞渐渐控制住体内真气，功力大增，在打败屠进一事上终于露出曙光。 段飞等开始寻找隐藏如来神掌秘密的地点，但多日均不得要领，心急如焚。此时屠进已找到了小村落，扬言三日之内不交出段飞和雪华，村中上下全杀个干净。段飞决定只身对抗屠进，要陆小瑜等带村民离去，陆小瑜，红袖，雪娟，雪华皆不肯，要段飞带村民走，继续寻找山洞。段飞安慰各人，若上天要其解救武林，他必不会死。决定只身应战。

决战前夕，雪华要随段飞同去，但段飞拒绝。雪华是义父邪神的女儿，不想其有不测，最后目送陆小瑜，雪华等带着村民向后山逃去。段飞只身前往应战，然而雪华不忍离去中途折返，与段飞一同来到了屠进的面前。 雪华仍望屠进可以放下心中怨恨，化干戈，始终认为屠进是自己的父亲。屠进根本听不进去，与段飞，雪华大打出手。段飞，雪华处处留情，而屠进招招狠毒，而段飞以万佛朝宗再次对抗屠进，一时间地动山摇，引发地震，后段飞和雪华双双跌下山崖，山崖下为急流。陆小瑜与红袖，雪娟赶回，雪娟见状，愤然要义灭亲，然被屠进打倒在地上，屠进终如愿以偿，随后开心而去。 雪娟伤心绝望，欲以死代父还债，为陆小瑜阻止，他不相信段飞如此短命，即使死也要找到其尸体。同红袖，雪娟冒着九死一生的危险，下山崖寻找段飞和雪华。 而段飞和雪华跌落山崖，并没死而双双被冲上岸边，并发现一倒塌的山洞入口。段飞与雪华走入，惊然发现墙壁上写着只言词组，细察之下，竟是如来神掌的心法。而因为山洞倒塌，心法所剩无几而且支离破碎，根本无法解其全部。 当陆小瑜等找到段飞，各人劫后重逢喜出望外。然而段飞一时无法解开心法，不得所用。但心急练功，差点走火入魔。然此时，陆小瑜发现人影绰绰，原来屠进为了肯定段飞已死，决定搜山。段飞决定毁山洞，然后众人逃离。 然而屠进的耳目众多，众人被困在一荒废的小村内，已是走投无路。

形势危急，屠进等越是逼近，段飞精神越无法集中。陆小瑜等外出抵抗，以性命换取时间。陆小瑜的话令段飞瞬间想邪神曾逼自己练功，看瀑布，直到眼前看到是一粒粒的水滴，贺天以死唤悟其弟，智能临终之言，生从死来为之大悲。他终于明白了何为如来神掌。 陆小瑜等在外苦苦支撑，护段飞在屋内练功，突破杀人招式。雪华，雪娟，红袖被重创，陆小瑜被屠进所擒。屠进以折磨陆小瑜而逼使段飞出来。段飞因情绪牵动，而按捺不住。陆小瑜高叫红袖杀了自己，红袖拉起弓箭，一枝利箭便向陆小瑜射去，陆小瑜含笑待毙的同时，段飞破关而出，接住了利箭，他终于悟出了如来神掌第十式「万佛涅盘」！ 一场惊天动地的决斗，段飞和屠进一时间分不出胜负，最后竟是一招进同归于尽，段飞倒下，屠进也随之倒下。临死之际，在二人的脑海中闪现生前的各种的片段。时柳飘飘，碧云，毕凡带着一群义士前来救段飞等人。屠进手下见屠进已死，一哄而散。雪华抱着死去的段飞悲恸，时段飞和屠进竟缓缓醒来，众人呆然。「万佛涅盘」原是让人经历死亡，在死的一瞬间勾起内心的回忆，唤醒其善念。而屠进看见的皆是自己之前杀人，鲜血片地。碧云，雪娟对其憎恨，一时难以接受，竟发狂疯了。陆小瑜欲杀屠进为碧云阻止，无论屠进再如何的错，此时已疯。雪娟，雪华皆求众人放过其父。一场江湖恶斗如此结束。 雨过天晴，陆小瑜接任长离教掌门的请帖，众人齐往。然毕凡竟不服陆小瑜，要与陆小瑜挑战，而终败在陆小瑜手上。毕凡原只是还多年心愿，因为毕孤至死也没有和自己教量，一直耿耿于怀，如今输的心服口服。陆小瑜竟在大典之日，当场宣布修改教规，他要迎娶红袖。 烟霞山庄，屠进疯癫至今仍无改善，雪娟已接管了烟霞山庄，终身陪伴碧云与屠进。此时雪华已怀有身孕，和段飞一同前来拜邪神。冥钱尚未燃尽，这对神仙眷侣，相伴消失在烟水之间，不再涉及江湖… 举头抬望，天高云阔，开心圆满大结局，万事皆好。