无情芷妍 发现疑点天亮后众人在石林中验尸，发现不少疑点，令无情不相信是女娲显灵。众神捕在村中调查却无收获，无情要求村长交出失踪者名单；当村长交出名单后，无情却指名单上的人有杀害官员的嫌疑。众村民大呼冤枉之时，有人在溪边发现了失踪村民的尸体。另一方面追命等人在应奉局受尽款待……前来协助查案的若飞竟与铁手在石林中迷路；两人吸入迷烟，醒后发现被囚密室中。案情毫无进展加上铁手与若飞失踪，无情向村长宣布放弃调查，回京请罪；但无情只是假装离开，更要追命与冷血乔装入村内调查。冷血在调查时遇上村民田嫂，她看见冷血时竟指他是自己弟弟；而冷血更发现田嫂竟拥有与自己一样的玉佩。悄悄折返的无情发现司马大人与村民翠翠是情侣；无情欲从他们口中迫问真相不惜恐吓他们，但却无功而回。正我与无戏欲到天石村协助，却发现蔡京亦带兵马出现；原来蔡京欲血洗天石村。为了寻回铁手等人，追命想出利用半疯的田嫂；田嫂更误会了小刀是自己的弟妇。无情跟踪村民翠翠，发现她私下与女娲娘娘见面……

官迫民反 酿成悲剧当众村民欲以毒烟杀害被困山洞中的铁手与官员等时，幸得田嫂带领，追命与冷血成功救回众人。无情发现了女娲娘娘作祟之谜，但混乱中田嫂却不幸丧命。首谋者承认一切都是因为官员过分欺压村民而惹起之祸。为了阻止蔡京屠村，众神捕竟合演一场「女娲显灵赠宝」，终成功让蔡京放过村民。经历天石村之事后，众人亦因此得悉了冷血的悲惨身世；正我将天石村的宝石交予皇上，更借机说出贪官藉此欺压百姓之事，令徽宗下旨要蔡京停止采石献宝。飘雪的好朋友到开封探望她时，竟染上了怪病突然死去，飘雪伤心不已，她的朋友突然复活变成了丧尸更欲袭击她。芷妍检查后发现她染上了不知名怪病，正我于是要众人到据称是传播这怪病的村庄查探；而芷妍为了寻觅师傅龙医师亦一同出发。众人到达后却发现官府已将该处列为疫村，不准进入。众人运用神捕司的权力入村，但官府却只让他们用七天时间解决危机，不然便会烧村。村中鲁医师努力替村民治病，但却对芷妍的建议不置可否。无情调查时感染了疫症，但芷妍却只能稳定病情无法医治。

疫病之谜 竟是人为七日之期限将满，官兵亦准备在日出后烧村灭病；铁手与若飞跟踪鲁医师，竟发现他竟有一秘密地下医坊，而且更养了一条怀疑引起疫症的大狗……无情失踪，最后更病发攻击众人，幸得众人将他制服，让芷妍让他饮下药汤。事件终圆满解决，经历此事后，无情开始接受追命等人为同僚。众人回程时，发现龙医师为采药而堕崖身亡，芷妍伤心不已。铁斧探望儿子时，正我发现铁手身上挂半个铜牌；正我找铁斧查问有关铁手的身世，发现他竟是将成家灭门的铁面判官之后人。正我得悉此事后，决定尽力隐瞒，不想让无情与铁手得知两人间有血海深仇。城内接连发生命案，但却无法查出杀人的凶器是甚么；无情苦苦思索后，竟能推断出凶器的模样。齐王与王妃嫣红一起到开封暂住，蔡京主动巴结；而嫣红发现飘雪竟与蔡京身旁的随从联络……无情推敲出杀人兵器的构造，但正我却故意要他调查其它案件。众人一无所获，但却又有命案发生；神捕们发现死者的共通点是身上钱财被洗劫一空，但这次在死者身上发现一只玉貔貅，因此推断出他们可能是赌徒。

凶手落网 引新疑团追命与赌坊合作，扮作赢大钱以引凶手现身；凶手果然被引出迅速落网。当审问时，这人说出自己只是渔民，因得到一箱武器才会犯事。神捕司众带犯人到家取那箱武器时，却突然遭人暗算，整箱武器更被夺走。原来是蔡京派人夺取武器，而他更证实这批就是成鼎天当年打做的兵器。嫣红约正我见面，欲提点他飘雪可能是内奸；但当正我与嫣红跟踪飘雪时，终发现……无情觉得对成家的武器似有印象，为寻找成家被灭门之事，私下到寺中调查却一无所获；原来是无戏派人通知住持请他隐瞒。蔡京约见落石父子鉴赏成家的武器，实则是威迫落石尽快统一江湖。若飞发现帮众陈九与飞虎帮的少帮主在街上打架，气愤下将他赶出帮会。落石父子发现受伤的少帮主；为挑起与蓝天帮纷争，落石竟杀害他而嫁祸给蓝天帮。落石假意代飞虎帮出面向破天要人，但实则欲要两帮相残；当两帮正大打出手之际，神捕司却介入平乱。落石借此理由，要小骨到处捣乱蓝天帮的地盘；为阻两帮当街火并，铁手将若飞与小骨同时拿下押回神捕司。

嫣红遇上 害父仇人铁手将若飞与小骨押回神捕司后，破天与落石分别派人马到神捕司要求放人；正我决定放人后，两帮人一起欢呼庆祝。落石竟趁机招揽破天但却遭拒绝。嫣红与飘雪于寺庙相遇，竟发现王爷赵昌与青楼女子一起进庙上香。嫣红气得独自离开，却遇上正在逃亡的陈九；原来陈九亦是当年令嫣红父亲自尽之人。追命在看守自己所居住的鸡儿巷一带时，却发现游冬替他家人所买的补药竟是假药，于是偕游冬到店铺理论。想不到此时小骨带领人马，以寻找陈九之名，乘机捣乱由蓝天帮所保护的鸡儿巷。嫣红捉了陈九欲行私刑；但陈九却坚持自己没有杀妻嫁祸嫣红父亲，更力指妻子与她父亲有染。当嫣红举剑欲杀人时，正我及时赶到将真相揭开。若飞率帮众与大连盟混战，街坊们亦为保卫家园而战斗，铁斧等亦因此受伤；正我赶至说出陈九已被带返神捕司，令战斗平息。正我在众人前审问陈九，终发现了飞虎帮少主是被高手所杀。众人责骂追命没有保护大家，但游冬却替他出言平反，而一众神捕亦原谅了他。嫣红失踪，正我在她亡父忌日劝服她，更主动将她亡父的遗书烧掉。

小刀诈病 为见冷血小刀刻意诈病，令不知就况的落石大为担心；当芷妍应诊时发现她诈病，但终答应带她与冷血相见。小刀以养病之名到芷妍医馆养病，当她见到冷血时，他却对小刀毫不理睬，令铁手也看不过眼。铁手巡逻时发现有人在赌坊生事，但见若飞没有动辄与人打架，更听到她说会报官举报，忍不住称赞她。蔡京与徽宗微服出巡作乐时，竟遇上江湖打斗，几乎伤及他；原来这一切是蔡京设计，令皇上觉得有设立武林盟主的必要，因此决定在王爷赵昌的月照山庄举行擂台比武以选出统一江湖的帮派。神捕司被委派担任维持比武的安全；当众人出发时，破天、冷血与无情等人同船，但途中船只爆炸，众人下落不明。若飞得悉此消息后，竟不问情由欲对付落石，却被小骨打败险死剑下，幸得铁手赶至相救。幸无情及早发现炸药令众人及时逃生，因此幸存者均飘流至一荒岛上。擂台比武正式开始，但破天失踪，若飞临阵代父比武更侥幸获胜；铁手力劝武功不高的若飞放弃比武，却遭她拒绝。孤岛上的幸存者秦帮主突然被杀，令众人怀疑岛上有凶猛野兽出没。