顾明道陷入深深的自责和悔恨中。张步高终于如愿以偿的坐上了院长的位子，可李肖一却提出要辞职，张步高意味深长的拿出法院的公文，暗示李肖一是自己这条船上的。丁凝夏恍惚间来到了聂莉莉的宿舍，这让范朋很意外，甚至一度错把丁凝夏当作是聂莉莉了。丁凝夏告诉范朋，自己还记得那双凶手的眼睛。由于电脑的硬盘没有在车祸中被损毁，阿虎发现了其中不可告人的秘密，于是他想敲诈钟大吕一笔钱，之后就带丁凝夏离开这里。而钟大吕本来想去偷周蜜的遗体，结果一无所获，他知道，要出事了。周蜜的尸检结果基本正常，只是她去世前曾流过产。这个消息又给许曼提供了一个新的线索，经过调查，她发现周蜜是被迫流产的，而她流产后就把孩子带走了，这可能才是妹妹留下的纸条上“小人”两个字的意思——就是胚胎。

宁菲儿又自杀了，刚把妻子抢救回来的顾明道，什么都不想管，只想跟妻子好好的过日子。可许曼就是坚信，妹妹是被李肖一害死的，她一定要为妹妹报仇。也许许曼自己都不知道，她渐渐的爱上了李肖一，她正在复仇与心痛中挣扎着、矛盾着。为了让宁菲儿好好修养，顾明道决定送妻子回老家。在宁菲儿离开之前，她把许曼、李肖一、范朋和丁凝夏都请到家里来，希望纠葛太深的他们能把话都说清楚，可结果却不欢而散。丁凝夏认出了在自己梦境里出现的，抢劫聂莉莉的那双眼睛，正是阿虎，可念在阿虎对自己的真情和付出，她没有告发阿虎，只是失望的让他离开。真心爱上许曼的李肖一去找许曼解释自己跟周蜜的关系，并告诉她，她的妹妹并不向她想象的那么单纯，周蜜在接触自己的时候，还有别的男人……李肖一向许曼再次表白，可换来的却是声嘶力竭的拒绝。急诊室里，顾明道被流氓病人打伤了，却遭其反咬一口，被警察带回公安局。可张步高却不肯派人去保，还好李肖一把顾明道保了出来。

阿虎想丁凝夏陪他去自首，可丁母无论如何也不让丁凝夏出门，于是丁凝夏跟范朋演戏，假装犯病骗过了丁母，溜了出来。丁凝夏和范朋来到和阿虎约好的地点，刚看见阿虎，他就被钟大吕派来的人害死了，硬盘也被抢走了。丁凝夏在穷追疑犯的时候，受到撞击也昏迷过去。又是天下大乱。顾明道记起周蜜去世之前曾经很小心，从不在外面喝水，这些疑点让许曼更加坚持要给妹妹做第二次的尸体解剖鉴定，她要查出周蜜的真正死因。丁凝夏经过抢救并无大碍，但已经成为医院的重点保护和推广对象。允诺过宁菲儿的李肖一无奈下把顾明道调回心外科门诊，让范朋接替了顾明道原来的手术组。张步高欣然答应顾明道回来，他是想在两强相斗时，巧得渔翁之利。

聂莉莉去世后，范朋的情绪一直很差，几乎无法完成日常的手术，李肖一却激励了范朋，使他重拾信心。钟大吕终于如愿以偿，把天一公司的药品搬回了中心医院，黑暗又笼罩在了心外科的上空。周蜜的第二次尸检结果出来了，还是没什么特别，只是胃液里含有少量不足以致命的吗啡，这令许曼很失望，为了让亲人入土为安，她答应把妹妹的遗体火化。可许曼依旧没有放弃，她怀疑有人为了隐瞒与周蜜的关系，偷偷给周蜜下毒。范朋也回忆起周蜜生前曾写过一篇关于胚胎的论文，从而猜测周蜜把打掉孩子的胚胎，藏匿在医院的标本室里，可当他们去寻找证据的时候，胚胎标本竟不意而飞，原来早有人捷足先登了。而李肖一就是所有证据直指的元凶，一场报复计划即将展开。

顾明道自知没有治愈全胜的把握，劝说一位患有重症的病人去更专业的大夫处治疗，但为了争一时之气，李肖一把病人拦了下来，并坚持自己做了超高难度的手术，张步高很是得意，因为心外科终于摆脱了顾明道的影子，李肖一可以独当一面了。可术后病人意外死亡，责任的追究像迷一样，李肖一要求做尸检，却被张步高拒绝。暗恋李肖一的护士长找到了许曼，把周蜜出事前后自己发现的异样告诉了许曼，在一切证据面前，爱上李肖一的许曼更加挣扎，她想用自己的方式解决这场战役——以牙还牙、毒死李肖一。可许曼还是下不了手。顾明道也发现了一点端倪，他希望李肖一不要被有企图的人挑拨利用，可李肖一早已迷失了自己，完全听不进去一星半点。

拒绝了范朋求爱的丁凝夏对顾明道的依恋更深。失意的李肖一去酒吧买醉，许曼去找他想求一个明白。醉倒的李肖一激怒了许曼，已经失去理智的许曼趁机刺伤了她心中最恨又最爱的人。生死关头，许曼和李肖一真情流露，冰释前嫌。顾明道把李肖一从鬼门关又救了回来。可此时，另一双眼睛正注视着他们的一举一动。但顾明道已然成竹在胸，黑幕即将揭开。他们利用李肖一假死，引出了幕后的黑手——张步高和他的妻子刘艳。原来张步高就是那个让周蜜怀孕的男人，而他的妻子为了保护自己的家庭，对周蜜恨下杀手。真相水落石出，警察带走了罪犯。李肖一和许曼有情人终成眷属。丁凝夏、顾明道、宁菲儿三个人之间错综复杂的感情纠葛又该如何理清楚呢？