地区公安局召开工作会议，会上谷局长表扬了清水公安工作的改进，何大来则批评清水法案上升。谷局长指出发案上升的原因是林荫将前任隐瞒的案件重新立案，值得肯定，令何大来十分尴尬。谷局长布署下阶段工作重点，一是继续打黑，二是搞好各局的人事制度改革。会后，谷局长让林荫回家看看。 林荫回到久别的家中，意外地看到侄子大明。交谈中，林荫得知大明是想通过他进公安局工作，秀云也替大明说话。林荫深感为难，他歉疚地告诉大明，这个事他做不到，局里马上就要开始改革人事制度了，自己要做出表率。大明不服气。父亲却支持林荫，要大明理解他。 赵铁军被停职后，跑到铁锋镇个体铁矿老板范大成手下当护矿队队长，这天，三位辽宁刑警来到铁峰镇，追缴一辆赃车。这辆赃车正是范大成的座车，范大成不仅不交出赃车，还召来赵铁军等护矿队员，将辽宁刑警和当地民警打伤。 林荫赶到铁峰镇查处此事，深入追查之下，才知此事还牵涉到交警大队的一个副股长，是他给赃车入的户。林荫不禁质问道：像赵铁军这样的人全局还有多少？靳树林说这是普遍问题，必须采取治本措施。林荫意识到治本措施就是进行人事制度改革。实行聘任聘用制度，竞争上岗，优胜劣汰，要尽快着手制定改革方案。 为减少阻力，局党委会前，林荫先了解各方态度。方政委并没有林荫预想的那么积极，只是说可以搞但可能效果不佳，因为两年前就搞过聘任制。林荫表示上次没达到目的，这次要动真格的，上级还要求先行一步。方政委淡淡一笑，表示这个头可不好带，再怎么改，党管干部的原则不能丢。林荫对方政委的态度感到不解。林荫又征求秦志剑等科所室领导和民警们的意见，他们的反应却比较积极，秦志剑还谈了上次改革失败的问题，认为群众意见群众投票一定要算数，否则这次改革又是空忙一场。但也有人忧心忡忡，怕搞竞聘上岗，自己会落选，比如郝正，到处探听情况，揣摩别人的态度。 在讨论改革方案时，牛明以党管干部为理由，反对以群众投票为聘任依据。靳树林也附和，说投票只能参考，最终还得党委说了算。方政委则模棱两可，老靳却支持林荫。林荫找方政委交谈，方政委依然顾虑重重。 牛明因在党委会上靳树林赞同他的意见，高兴地拉靳树林喝酒。牛明酒后吐真言，要靳树林和他抱成团，与林荫对着干，只要不对他们的心思，就让他滚蛋。靳树林反倒被这话吓醒了，他想自己的想法跟牛明可不一样，不能跟着他跑，应该主动找林荫谈。靳树林对林荫谈出自己的担心：如果完全以民警投票为准，那么就有可能将平时没本事工作能力差，却擅长搞关系的人选上来，这反而对工作不利。林荫听后觉得有理，两人又一起商量出一个合理的民主测评的方法。林荫又从靳树林口中得知，方政委除了工作上的顾虑外，也怕儿子方文下岗。林荫豁然开朗，自责自己没能设身处地为方政委考虑，但改革又是势在必行，他迫切要与方政委再谈一次。 牛明又拉方政委喝茶，先夸方政委的消极态度是对的，接着便挑拨说林荫的做法，就是不把党委和他这个政委放在眼里，表示自己今后一切听方政委的，与林荫对着干。听了这话，方政委突然觉得自己会被牛明等人当枪使。他立刻打电话约林荫面谈。方政委坦诚告诉林荫，自己确实有私心，但还是共产党员，还没有堕落，完全支持林荫。 改革方案在公安局开始实施，竞聘中层领导岗位的人，积极准备，气氛十分热烈。却有少数人惶惶不安，郝正对办公室主任的位子垂涎已久，到处试探人们的看法……

郝正想竞聘办公室主任，但又怕竞聘失败。他来找林荫，请求林荫替他说话。林荫告诉他，自己不会为任何人说话，想竞聘某个职位，一定要有广大民警的支持。 罗厚平认为自己不适合在刑警队工作，想竞聘办公室主任，征求林荫的意见，林荫虽然内心认同，但还是说了与回答郝正时一样的话。 秦志剑决定竟聘刑警大队长，显得十分自信。 竞聘并没有出现某些人所想象的混乱局面，一切按方案计划进行。经过竞聘，秦志剑和罗厚平都实现了自己的愿望。改革结束，大获成功。全局上下出现了前所未有的活力。可是，有少数落聘人或竞聘失败的人不高兴，这其中就有郝正。他虽然没聘上办公室主任，但保留了副主任职务。可他还认为是林荫的改革使他失去了正主任级职位，他要报复。就在这时，牛明邀他喝酒，郝正爽快地答应了。酒桌上，两人一起发泄对林荫的不满，昔日的对头，凑到了一起，郝正说不能让林荫他们正常工作，得制造点麻烦。 上报市委审批的聘任干部批下来了。秦志剑的职级提拔却没能通过。林荫和方政委感到意外，他们向陈副市长询问。陈告诉他们有人给市委寄了检举信，控告秦志剑有三方面的问题：1、对现实不满，攻击市委决策；2、个人英雄主义，独断专行。林荫和方政委摆出事实，逐一驳斥这些子虚乌有的指控。林荫要求复议。陈副市长提出既然实行了聘任制，又没人规定股级干部不能聘为大队长，可以变通一下。秦志剑虽未提级，但并不影响他当刑警大队长。林荫和方政委只好接受。 秦志剑得知内情，异常愤怒。林荫劝慰他：虽未提成副科级，但不影响当刑警大队长，要经得起考验。还叮嘱他今后说话注意点儿，别让人抓住把柄。秦志剑抑制内心的愤怒，向林荫保证决不会影响工作，而是会工作做得更好，以实际行动回击那些人的污蔑，看谁是合格的共产党员。 全局干警都为此事感到不平，但有两个人却很高兴，就是牛明和郝正，他们又聚在一起吃喝，为自己略施小计获得成功举杯庆贺。 秦志剑则将对诬告的愤慨转化为追查郑光军罪行的动力，在他的建议下，林荫成立了打黑除恶秘密调查组。林荫任组长，秦志剑和黄建强任副组长。他们将查清贺刚和郑华军的下落作为首要目标。 郑光军频频在清水的电视民屏幕和报纸上露面，或者给哪里损款，或者和领导们在一起， 大谈世纪工程的建设，风头出尽，志得意满。他没有想到，不管他去到哪里，都有警觉的目光盯住他。这天，郑光军去了一趟龙泉。黄建强跟踪而至，终于查到贺刚就隐藏在龙泉的龙城宾馆。林荫接报后，率秦志剑、高翔等人赶往龙泉与黄建强会合，在当地公安局的配合下直扑龙城宾馆。出乎他们意外的是，出现在宾馆里的是刀疤，却不见贺刚。 牛明风风火火闯到林荫办公室，态度狂妄地责问林荫为什么这么大的行动要避开他，是不是对他有怀疑，他要向上级反映。林荫反问他，为什么不信任他。他自己要好好想一下。牛明先是语塞，而后扬言走着瞧。 林荫彻底看透牛明，与方政委商量，此人不能再管刑侦工作，要调整牛明的职务。方政委同意，但说要向市委汇报，看能否调整出公安局；如果不行，就调整他的领导分工。林荫想先给陈副市长打招呼，求得他的支持。没想到陈副市长却因支持公安局工作和反对世纪工程，被明升暗降，调离清水。林荫和方政委都感到一阵悲凉：一个副市长说被整走就整走，一个公安局长又算什么？也明白了刚才牛明为什么那么狂妄了。 审讯刀疤有了结果，他承认参与了砍伤税务员的案子，是贺刚和郑华军召集他们去的。问他贺刚和郑华军的下落，他说他在龙泉只是偶然碰见贺刚，见面后就不知去向了，郑华军根本没见过。

在送别陈副市长的聚会上，林荫从洪市长等人的言谈中了解到万书记在市委独断专行的内幕，以及与郑光军、陶素素的复杂关系。 万书记又来与陶素素幽会，陶素素强装欢颜，痛苦地应付万书记强烈的欲望。从万书记的话语中，陶素素觉察到他在整走陈副市长后，又打算整林荫，不由得想起自己一段不堪回首的经历。她恨郑光军这些人，却为林荫深深地担心…… 牛明急匆匆来找郑光军，告诉他林荫要调整他的工作，以后事情会很不好办，要郑光军赶快找万书记阻止林荫。郑光军立即去与万书记商量对策。万书记似乎胸有成竹，他告诉郑光军，让牛明不要着急，他自有安排。 局党委会上，林荫宣布了调整后的三位副局长的分工，牛明改为分管常务。让人意外的是，牛明没有吵闹，还诚恳地说自己管刑侦几年，成绩一般，换换分工也有利于工作，他没有意见。牛明的反常举动，令林荫觉得奇怪，估计他会让万书记出面。然而，一天过去，没有任何人出面说这件事。自来清水后，林荫已习惯了阻力和困难，现在风平浪静，他反倒觉得不正常，不习惯了。林荫觉得其中有什么奥妙。 秦志剑和黄建强来向林荫汇报最近对全市黑恶势力调查的情况。各种迹象表明郑光军兄弟控制着一个分工明确，组织严密，并渗透到党政机关的黑社会组织，但现在缺乏证据，许多人不敢说话。“偏头”虽已被起诉至法院，但法院迟迟不做判决。许多证人到了法院又改了口，甚至有人说公安局有逼供嫌疑。秦志剑指出，一切的症节就在郑光军身上，他要不抓，群众就不敢站出来，而他是人大代表，上面还有保护伞，一下就把他抓起来，恐怕很难。林荫与秦志剑，黄建强商讨下一步的调查步骤。 苗雨就告诉林荫，听说市里要来考核牛明，说是要提拔。林荫不信，方政委却证实了这一消息，估计牛明可能要提拔去当政法委副书记，要真是这样，他恐怕会对公安局的工作处处作梗。方政委倒认为，牛明调出公安局是好事，不会直接影响局里的工作了。 牛明把自己要提拔的消息透露给郝正，郝正大献殷勤，出谋划策。郝正购买办公用品时虚开发票，以次充好。王晓珊将劣质纸张退给郝正，罗厚平询问原因，郝正却借机大吵大闹。林荫赶来劝阻，郝正说是罗厚平整人，然后扬长而去……王晓珊觉得郝正十分反常。 洪市长告诉林荫万书记是要提拔牛明当局政委，而将方政委调出。林荫心情变得十分恶劣，但他还是安慰方政委，方政委却担心林荫以后的工作会很难。而且，牛明的意图可能不仅仅是政委，他还盯着局长…… 秦志剑得知这个消息，来找林荫，说他想不通。 牛明则显得非常谦虚，竟然关心起高翔的工作问题。郝正也喜笑颜开，到处跟人说牛明的好话。 市委考核组来了，林荫、方政委、秦志剑等如实而又策略地反映了牛明的问题……

考核结束，对牛明的测评满意票，还不到半数，而且市委领导层看法也不一致。但林荫和方政委却乐观不起来，因为洪市长提醒他们如果上面有后台，考核也不起作用，要他们做好思想准备…… 一天吃午饭时，，牛明借着酒劲还是露出了张狂的面目，当众向秦志剑挑衅。秦志剑气愤难平，告诉林荫必须采取措施，不能让牛明上去。林荫却认为这行不通，秦志剑无奈离去。 于海荣找方政委谈话，要他做好准备到政法委上任。牛明当政委似乎板上钉钉。林荫只得向谷局长反映情况，谷局长说牛明的事只是在考核，一切都还没有确定，要林荫沉住气。 电话亭里，有个人影在拨打电话。林荫接到电话。那人问幸福乡兴旺村的事管不管。林荫问什么事，对方说村里有地主恶霸，把村里的卖地的几百万元都贪污了，还诬陷别人。林荫说当然管，问有没有证据。那人冷笑一声，林荫要再问，对方说还会与他联系，就挂了电话。 林荫问罗厚平兴旺村是否有这么一个案子，罗说有，当初自己就是办案人之一。案情是村里的会计徐子民贪污，还放火烧毁了账本，打伤一人，在审查时逃跑了，被列入网上追逃的对象，有一年多了。 打电话的人正是徐子民，他回到家中，与妻子久别重逢，悲喜交集。妻子问他怎么敢回来，那薛怀礼和李大兴可一直在追查他的下落。他说清水来了个敢为好人说话的公安局长，自己要去自首，把真相说出来。 村治保主任李大兴兴冲冲地告诉村长薛怀礼徐子民回来了。薛怀礼脸上露出笑容，告诉李大兴该怎么办。 第二天，林荫刚走进公安局，便与薛怀礼、李大兴碰了面。那两人兴奋地说在逃的徐子民潜回家中，昨晚被抓住，送到公安局来了。林荫听了，立刻让秦志剑去审徐子民。 徐子民坚持要见到林荫才说。林荫赶到看守所，亲审徐子民。徐对林荫大叫冤枉，说自己昨天还给林荫打过电话。林荫没想到他就是昨天打电话的人，便更加关注。徐子民哭诉自己没有贪污，没有放火，而薛怀礼才是腐败分子，李大兴是他的打手……于是林荫听到了一个真实的，不敢相信的故事……林荫反复盘问一些细节，推断徐子民没有撒谎。听完徐子民的叙述，林荫立刻找来罗厚平询问。罗极力为自己开脱，说他只是奉牛明之命办案，是赵铁军动手打徐子民，这更令林荫相信这是一个颠倒黑白，靠刑讯逼供搞出来的冤案，而冤案的制造者就是牛明。林荫决定认真调查，搞清真相，但他也估计到会有困难和阻力。林荫与方政委商量，方政委已经在做离任的准备。听林荫一说情况，眼里闪过一道亮光，两人商议稳妥的调查办法。 牛明闻讯来找林荫，以原来徐子民案是他带人查的为由，要求继续办这个案。林荫虚与应付，婉言拒绝。牛明恨恨地离去，林荫将调查任务交给了秦志剑，秦志剑立刻派黄建强和高翔去兴旺村。 薛怀礼让李大兴在村里应付公安局的人，自己则坐上一辆轿车离去。 于海荣召见林荫，责问调查兴旺村怎么不给他打招呼，因为兴旺村是先进典型，林荫尽量缓和地回答：先进典型不能成为理由。于海荣无言以对。林荫也由此感到事情的复杂性，决定采取一些预防措施，他给市委洪市长打电打汇报了情况。洪市长表示支持他调查，同时要林荫做好各方面的思想准备。 薛怀礼慌了神，跑到光华集团公司与郑光军和牛明商量对策，商议的结果是让万书记出面干预。 林荫问秦志剑调查的进展。秦告诉他，有村民说薛怀礼和郑光军兄弟关系非同一般……林荫听罢更加坚定地指示黄建强不受干扰，全力调查。

正在北京开会的万书记，果然打电话给洪市长，责问公安局为什么要查这个案。洪市长将此情况告诉林荫，并要他尽快突破。 林荫调兵遣将，加强了在兴旺村的调查力量，村民纷纷开始举报，提供线索和证据。薛怀礼和李大兴的犯罪证据越来越多。林荫决定传唤薛、李，但他们却在郑光军安排下匆忙逃离。这一切都说明薛、李有重大犯罪嫌疑，而徐子民是无辜的。 徐子民一恢复自由就控告薛怀礼、李大兴，还告牛明、赵铁军刑讯逼供。调查开始后，虽然牛明、赵铁军不承认，但造成错案却是事实，所以尽管牛明将责任推到罗厚平和赵铁军身上，让罗受了处分，但他仍负有不可推卸的领导责任。万书记大为恼火，取消了对牛明的提拔。在这次较量中，林荫占了上风，但他也意识到，对方不会善罢甘休。 林荫到地区公安局汇报工作，谷局长提醒他要把困难想得多一点，又劝林荫抓紧把家搬到清水，不然秀云会有意见。谷局长还问了清水公安局的经费问题，甚至苗雨的情况。林荫一一做了说明。谷局长听后，嘱咐林荫大胆工作，无论遇到什么困难，都要坚定信念。林荫有了一种不祥的预感…… 果然，刚回到清水，洪市长便找林荫和方政委谈话，告诉他们由地区政法委和纪检委组成的联合调查组将来清水，调查清水公安局的问题，也就是林荫的问题。何大来是调查组副组长。 林、方二人虽感突然，但他们表示一定认真接受调查，不会因此影响工作。 郑光军和牛明对调查组的到来欢欣鼓舞，在皇朝大酒店拉着陶素素举杯相庆。牛明又担心在这关键时刻，薛怀礼、李大兴再出麻烦。郑说不必担心，这两人已去了广州。 调查组的到来令全局干警心情沉重，气氛也变得压抑起来。秦志剑愤愤不平，来找林荫，说这工作没法干了。林荫告诫他不可这样消极，影响工作，并透露昨晚有一女人打来匿名电话，提供了重要线索——薛、李二人在广州，要求秦尽快查实……郝正很兴奋，在一些办公室串来串去，想拉人们谈这个事，但大家都小心回避着这个问题。 地区调查组分别与局领导班子成员，和科室队负责人乃至一般干警谈话，就是没找林荫谈。方政委和靳树林告诉林荫他们与调查组谈话的主要内容：对市委说过不满的话，到省财政厅要钱，给高翔等编外人员发补助费等等。秦志剑也来了，说调查组也找他谈话了，内容与方政委谈的差不多，但秦志剑说调查组还问林荫作风问题，虽未明说，但听得出来，是指林荫与苗雨的关系不正常。林荫又惊又怒…… 报社主编提醒苗雨调查组也会向她调查与林荫的关系，苗雨觉得十分可笑…… 秀云接到一个说林荫出问题的匿名电话，她匆匆赶到清水，劝林荫离开清水。林荫觉得自己不应该再沉默了，他拿起电话，找何大来，要与调查组谈……

在调查组驻的宾馆里，林荫与何大来激烈舌战，有理有据，逐一驳斥何大来对他的指控，澄清了事实，赢得调查组组长、地委纪检委毛主任的理解。 在公安局里，方政委、秦志剑等人牵挂着林荫，商量对策。方政委表示如果林荫被整走，自己也不干了。 苗雨直闯调查组，坦陈自己的看法，大出何大来的预料…… 郑光军以为林荫这次肯定垮台，便召集手下在华光集团总部开会，指示手下抓住这一大好时间，加大力度，完成收入指标，还要催收世纪工程捐款。大秃子不服他的指令，认为难以完成，争执起来。郑光军起了杀心。 调查组返回白山，组长毛主任认为根据调查的事实，林荫的言行没有重大错误，有些所谓的问题都是捕风捉影，必须对林荫做出正确的评价。何大来理屈词穷，无可奈何…… 大秃子不服郑光军，打算摆脱郑的控制，独立单干。郑光军却抢先一步，暗中召回郑华军，将大秃子杀死在荒郊野外。郑光军组织中的这一变动，很快被秦志剑、黄建强等人发觉，但又缺乏证据，林荫只能要求刑警大队加强监视，继续挖掘线索摊派给个体司机的世纪工程捐款，迟迟收不上来，万书记十分恼火。郑光军约来交通局长蒋实全，密谋联手强制收款，从中牟取利益…… 林荫突然接到电话，靳树林报告：个体出租车司机驾车驶向市委和市政府大楼，将市委大楼团团围住。 根据初步调查，事件的起因是郑光军的手下在路上设卡收捐款，老杨父子交不出，又被打得头破血流。司机们终于忍不住，聚在一起商量对策，决定到市委反映情况。 林荫在局里部署好各项应急措施，为了不激化矛盾，他只派出便衣警力暗中控制现场，保护市委和市政府，然后他和方政委赶去市政府开紧急会议。 市政府会议室里，万书记召集会议，大发雷霆，蒋实全将责任推到公安局，说抓几个人就行了。林荫和苏检察长驳斥了他的说法。林荫坚持认为司机们闹事是事出有因，不同意采取强硬措施，建议以对话的方式解决问题。他的意见引起万书记和于海荣的不满，但洪市长表示支持。会议最终采纳了林荫的意见，他也成为对话组的一员，负责与司机代表对话。