单元一 道高一尺 朱元璋受到精通奇门遁甲、天地五行的刘伯温辅佐，歼灭元朝，建立大明王朝，安邦定国后的元璋，为一统江山，仍极力斩除异己。 元朝公主南风为报灭国之仇，潜进皇宫行刺朱元璋，元璋失手伤其双眼，失明后的南风逃至伯温好友阿田的烧饼铺，与刘伯温及阿秀结为好友，伯温得知南风身世，一心护主，想尽方法，不让南风接近朱元璋，并尽力医治南风已失明的双眼，盼能彻底化解元朝与朱元璋的恩怨，让朱元璋稳坐帝王之位，不料大臣胡惟庸为个人私利蛊惑元璋，通缉南风赶尽杀绝，刘伯温与胡惟庸随即展开一场攸关大明王朝存亡的奇门遁甲斗智竞赛

单元二 情天恨海 马皇后思乡情切，郁郁寡欢，元璋见状，决心带着马后回宿州祭祖。 一心想扰乱大明朝纲的大臣胡惟庸见机不可失，在皇上到宿州之前通知马后的亲生弟弟马天行。马天行虽身为侯爷但并无行政实权，让醉心于权贵的他，大叹怀才不遇，汲汲于名利的他，步步为营等待机会，在人前公义正直，乐善好施，赢取民心；私下却勾结官府，结党营私，谋取财富，胡惟庸得知马天行弱点，向马天行献计蛊惑他除去刘伯温，马天行心动不已，将伯温引至宿州，欲予以歼除。 此时一位自称是伯温未婚妻的女子小青出现，要告刘伯温抛弃发妻，打乱天行的计划；小青的出现，让阿秀醋劲大发，誓要查明小青来历，阿秀巧遇一位道姑圆融，得知小青是个逃犯，并且身负血海深仇；伯温得知真相后，义愤填膺，要为小青平反，此一举动竟招来杀身之祸

单元三 七绝阵 元璋破陈友谅之时搜获陈友谅画像一幅，那幅画像将陈友谅画的极其威武。陈友谅是元璋一生中的最大敌人，如今已被他消灭。元璋自觉一切都远胜陈友谅，唯独就缺陈友谅那幅雄壮威武的画像。于是元璋便要画师为他画像，可是每个画师画出来的画像都不及陈友谅那幅，元璋气得把每个画师重打了八十大板之后才行斥回。马后为怕还将累及无辜画师问计于伯温，伯温遂建议找为陈友谅画像的画师温士凯来为元璋画像，但画师身患残疾无法前来京城，朱元璋决定至金华找温世凯并探访金华守将路允正，伯温从陈友谅的画像上查出「金华七绝阵」大为震惊，因七绝阵法可是摧毁朱元璋的帝气，毁去大明王朝国运，伯温判断元璋赴金华必有凶险，但元璋仍一意孤行。刘伯温与朱元璋一行人来到金华遇上一女子霜红欲与伯温一较高下，伯温觉此女可疑，欲查此女底细，遂知她是陈友谅之女，而利用陈有谅画像将朱元璋引至金华是其母半支莲所为，其目的就是要以七绝阵摧毁大明朝，伯温得知半枝莲目的后，力阻其布阵，与半支莲展开奇门遁甲的大斗法！

单元四 九关十八斩 朱元璋的女儿玉凤早年在战乱中失散，马皇后痛失爱女，伤心不已，多年来也曾差人四处找寻她的下落，但终究是音讯全无，算算今年她应该是二八年华的年纪了，每次一想到她，马皇后都为之惆怅欷嘘，茶饭无心，朱元璋猜想玉凤或许已经不在人世，劝马皇后看开些，但马皇后却不死心，相信一定能找得到爱女，因为玉凤的右肩上有个似凤般的朱砂胎记，很好认，这也是当初小公主取名玉凤的典故。也正是因为这个缘故，马皇后深信这个世界上不可能有第二个人会有这样的胎记；一天，胡惟庸向朱元璋谎称已经打探到了公主的消息，但是他没见过玉凤，不能确定那是不是真的公主，因此他建议由刘伯温去辨认，如果是真公主就将她迎接回朝。由于刘伯温在玉凤公主襁褓的时候就见过她，这个任务遍数朝中大臣，也只有刘伯温最为适合。于是刘伯温就奉旨前往，却不知前途路上竟有重重的危难在等着他，这回刘伯温应该是断无生路了！ 朱元璋也善为了让刘伯温一路上能够调兵遣将，顺利的迎回玉凤公主，他特地封刘伯温为钦差大人，并御赐「如朕亲临」金印一枚，凡事可以全权，甚至可以先斩后奏，于是刘伯温就风风光光的上路了…

单元五 长生劫 终于找回爱女，朱元璋与马后带着愉悦的心情回京，未料，半途却遭设计埋伏，马后昏迷不醒。 醒来后的马后，神情和往常一般，却得了「失心疯」，时而疯癫、时而正常，朱元璋十分不舍，招来刘伯温、胡惟庸商讨对策，两人面面相觑，而天下只有一人有办法医治此症，此人乃铁贯道人-陶溯，此人年近五十岁，术士出身，早年随着朱元璋打天下，功在社稷，然无意宦途，大明初定即退隐山林，与刘伯温交情颇深，此后，刘伯温多次造访都不肯出山，因拥有师父传下来的长生密法却遭孪生弟弟陶潜所软禁。 朱元璋一心一意想医治马后「失心疯」，被术士陶潜所迷惑，刘伯温在金銮殿上义正辞严地诉说皇上的无智，惹恼了朱元璋，老谋深算的胡惟庸，善于观颜察色，趁势落井下石，刘伯温遭到驱离京城。 刘伯温面临人生最大的考验，他该如何重振国师雄风，重返应天府；他又会如何突出重围，拯救大明皇室呢……

单元六 怒犯天条 朱元璋至濠州祭祖谒陵，与伯温进入地宫，赫然发现原置于地宫中，守护大明龙脉的具有天地灵气的上古奇珍「龙晶珠」已不见踪影且有一人死在地宫之中，额头上留一个特殊的 印记！元璋大怒欲下令撤查，伯温言「龙晶珠」藏于地宫之事，无人知晓，盗墓之人必是意图不轨，若是声张反中其计，不如暗中调查，元璋乃命伯温追查「龙晶珠」下落！ 一日，皇宫内苑传来一讯，有十二位官员在同一天离奇身亡，死者的额头上都留有一个印记，伯温推断此事件应跟龙晶珠失窃有关，遂展开追查，而此时各地亦陆续传来有人贪官污吏及通缉罪犯纷纷暴毙的消息，刘伯温循着蛛丝马迹，抽丝剥茧追查之后，杀人后留下 印记是来自于上古黄帝所留下的上古奇珍天条龟甲，根据天条龟甲上记载三条必死的的天条戒律一、挟怨杀人者死。二、奸淫盗掠者死。三、欺压苍生者死。若有人犯此天条律法，只要习得龙源真经心法者，用三诫刀将犯天条律法之人的姓名刻在龟甲上，犯罪者必遭天打雷劈而亡；刘伯温追查龙晶珠下落的同时，也渐渐揭开天条龟甲的秘密…