- 幽灵电脑 GHOST IN THE MACHINE 一台计算机已经不再能够胜任一栋办公楼里的工作，将要被淘汰。为了不被淘汰，这台计算机里的一种不知名的高级人工智能开始行凶杀人。

- 冰核计划 ICE 一个极地探险队在创造了最新的冰芯掘进纪录之后，突然开始了莫名其妙的自相残杀。Mulder探员和Scully探员同一队科学家和医生前往调查。他们在冰芯里发现了一种微生物，任何感染了这种微生物的人都会变得异常愤怒和偏执。调查队刚到不久，就有人感染。究竟谁会成为凶手？

- 太空惊魂 SPACE 一股神秘力量破坏了一项NASA的发射任务。Mulder探员和Scully探员开始了调查。

- 坠落天使 FALLEN ANGEL 一个UFO坠毁了。军方迅速封锁了事发地点。Mulder探员前往调查，但却危及了X档案的未来。

- 夺命夏娃 EVE 两位父亲在同一天被谋杀了，作案方式几乎完全一样。Mulder探员发现，这两位父亲都有一对8岁的双胞胎女儿。他们意识到案件的背后有更奇怪的事情发生。

- 恶魔烈火 FIRE Mulder探员在牛津大学时的前女友找到他，希望他帮忙调查几个英国重要人物的国际谋杀案件。这时，一个双手能够发火的杀手出现了。