在抗日战争最为激烈的1941年，有一群最为“草根”的普通民众产生了抗日传奇的故事。郑文博在街上发现被特务跟踪，在他死之前让秋致远将东西交给茂源布庄的孙掌柜，秋致远看到他死后急忙逃走。特务从秋致远身上发现了一封入党申请书，他假扮女子离开了被包围的院子。

鞍记马帮的关大鞍在帮人押货，秋致远在逃跑途中上了他的货车。秋致远在车上看了郑文博交给他的东西，那是一份锄奸密令，里面有要除去人员的名单。秋致远看到日本人来到城门时将那封信塞到了车缝中，还将纸条吃到肚里。等秋致远从车里被发现后，他说这事儿和关鞍有关，马帮的人都被关了起来。

在狱中关大鞍问秋致远为何要连累他，秋致远说自己的真实身份是八路军的指导员，关大鞍听完后对他表示敬重，秋致远让他们帮自己逃出去。孟老板去找马三保想让他照看关大鞍等人，秋致远在狱中一番胡编乱造，日本人暂且相信了他说的话。

秋致远利用日本话在日本人和关大鞍之前挑唆，两名日本兵被关大鞍等人杀死，他们换了日本人军装后准备逃离监狱。在秋致远的带领下他们扮成了一队日本兵，但他们在院里不知道该如何出去，关大鞍还想将那些马和货都弄走。他们要出去的时候被看守的人要出门条，他只好回去，关大鞍想硬闯被阻止。

秋致远回去后让人放火吸引日军，另一帮人伺机对付门口的。在打斗中关大鞍被踢晕，院中的日本兵乱成一团。放火的三个人被发现后想要逃走时被日本兵开枪打死，门口的他们目睹了一切。

关大鞍醒来后知道他们逃到了城北的小树林里，当他知道几个兄弟被日本人打死后很生气，他的鞭子打向秋致远，秋致远并没有躲闪。日本人准备将杀死郑文博的事情嫁祸到秋致远身上，马三保去见日本人，说他们有决定抓住逃跑的人。

秋致远来到茂源布庄找孙掌柜，他说事情很重要只能对他一人说，等孙掌柜出来后他说明了郑文博的事儿，秋致远说出了三张照片和暗杀密令，他说东西藏在马车里，但马车让日本弄走了，他被他们当成了汉奸，还把他当成日本特务队行动组的副组长。

秋致远趁机从布店中跑走，店老板和伙计追出去的时候什么也没发现。关大鞍看着几个兄弟被呆在大街上很心痛，他们准备晚上再来将他们的尸首弄回去安葬。关大鞍想去救他兄弟们时被秋致远阻止，他将秋致远打晕后一个人去了他们的尸首处，他将他们放下后被埋伏好的日军围住。

关大鞍扔下放在腰间的假玉米手雷，但被日军识破，他又被抓了起来。秋致远穿上日军服装将那三名被杀的人拉了出来，胖墩将他打晕后绑了起来，他自称是八路军的指导员，这才被松绑。他们看到了关大鞍被押在街上公示，胖墩背着炸弹要杀361个日本人给村里乡亲们报仇。

秋致远带着胖墩穿着日军服装来到看押关大鞍现场，还弄了一辆大卡军。五疙瘩弄了一辆马车在城外等侯，到是正午日本人在关大鞍身上抽着鞭子，他不让兄弟们来救他。关大鞍被带往刑场，秋致远将车开的很快，日本人看到胖墩扔的土地雷后急忙从车上跳下去。

关大鞍被绑在车后面挣扎，他看到那颗雷没有响，他们成功逃脱了，当日本人赶上后才知道上当了。日军从车辙上发现了他们逃走的遗迹，但日本人让部队撤退回城去，秋致远带着他们回城了，那儿应该是最安全的，关大鞍身上的伤还需要医治，但在他们下车时不小心将日军的帽子掉在了门口。

日本人通过线索包围了他们藏身的药行，幸好秋致远提前有准备，他们藏到了后院的地窖里，在屋里的床上还发现了血迹。店老板的儿子宝儿指着要藏到旧地窖里，地窖口打开时发现是一摊污水，日本军官将那把刀送给了宝儿，那污水是秋致远想的办法，这让他们逃过一劫。

等日本人想通赶回去后秋致远已经带人安全离开，关大鞍不想和秋致远在一起打鬼子，他想和他分道扬镳，两人在车上吵了起来，关大鞍还将他踢下车去，胖墩说了秋致远救出他三兄弟埋了的事情。孟若涵十五年后后回到家中，秋致远实际上不是八路军，他还被组织上误认为是汉奸。关大鞍又带人回到他兄弟坟前，秋致远需要他们的帮忙。

孟若涵说她娘十五年前已经离世了，她爹在责怪自己，他感觉对不起她们母女俩，若涵的妹妹下落不明。秋致远准备下一步杀一个当大官的，他知道有三个人在必杀范围之内。五疙瘩的哥哥是掘墓的小偷，他们去找他帮忙准备盗回马画上的照片。秋致远在茂源布庄门口被特务抓住，孟若涵路过说他是自己男朋友，他们只好将秋致远放了。

五疙瘩将他哥麻四带到关大鞍等人前，秋致远说他很欣赏他，并让他一起做事儿。麻四知道他们要从日军宪兵司令部拿东西时要走，秋致远掏出了玉镯，还说祖上有曹操的墓葬图。麻四同意去取东西，但麻五不愿和他合作。麻五穿上军装后来到日军宪兵大队。三名日军发现了他们的踪迹，他们将日本人杀死后吊了起来。麻四被打晕后带到城外树林，他们以为是麻四告密的，麻四将照片拿给了秋致远，之后他同意入伙了。

关大鞍不明白秋致远为什么要让麻四入伙，秋致远向他讲起了毛主席的号召，他让麻四先去查一下照片上人的行踪，并让麻五拉着马车去送他。孟若涵出门后听到枪响，她为救穿长衫的人故意引开了追击的人。孟若涵实际上日军的间谍，她的任务是想办法找到共产党内部代号为庐山的人。

麻四回去后打听到那个人叫臧志毅和他的生活习惯，他的身后跟着一个保镖。关大鞍熟悉臧志毅住的那个院子，麻四顺便还偷回来了一把日本军刀，看到刀后他们知道连累了老胡。秋致远决定要从他嘴上套出情报来，不能直接杀了他。麻四知道他们是八路军后不愿意参加行动，秋致远放他走了。

关大鞍在窑子里找到了麻四，麻四看到了他们将日本兵杀死，他被吓得坐在地上，麻五将他的手按到了墙上，一出血溅鸳鸯楼让麻四不得不加入他们，枚红不得已在大喊麻四杀人了。回去之后他们分配了武器，秋致远不会用枪，他带着胖墩出去找日本人学如何开枪。

孟老板在十八年前就悬赏寻找他的小女儿文英，他带着孟若涵来到她妹妹的坟前，她想起了小时候妈妈抱着自己的情形，文英当年被抢走。秋致远带人展开了行动，臧志毅知道不能把全部的消息都告诉日本人，他们要留有余地。胖墩打扮成店小二去楼上送菜，麻四在接应的时候离开了马车。

等胖墩上去后臧志毅问完话感觉不对劲儿，随后他将臧志毅打晕后用麻袋装了起来，但臧志毅的保镖也冲了上去，关大鞍和麻五都受了轻伤，由于麻四的离开让接应的马车无法及时赶到，幸好马听到口哨声自动赶来他们才得以逃脱。

秋致远回去之后要给关大鞍取子弹，关大鞍让秋致远小心点，秋致远拿着一把烧过的刀子给关大鞍取出了子弹。秋致远随后说以后大家都要学会使枪，要不然怎么跟小鬼子斗，关大鞍说谁愿意用谁用，反正自己是不用。

秋致远说以后给他们这个小组取名字叫神龙锄奸队，关大鞍任命为队长，自己是指导员，随后让炮墩当爆破手，麻五是突击手，麻四就是侦查员。这时候麻四回来了，秋致远看到麻四回来之后就拿了一把枪对着麻四说要以正军法，麻四害怕的不行，说再给他一次机会自己要戴罪立功。

随后麻四又去打探了藏志毅的行踪和消息，藏志毅故意大声地说自己要去见孙掌柜，还说秋致远是汉奸。藏志毅随后去找了孙掌柜，他告诉孙掌柜说秋致远是汉奸，他假冒是共产党，先是杀掉了郑文博，还想杀了自己，要赶紧除掉他。麻四听到了之后心里面暗暗地相信了，以为自己是受到蒙蔽了。

麻四回去之后跟关大鞍还有麻五他们说自己亲耳听到秋致远是汉奸，还说大家全都上了他的当了，麻四还自己分析的头头是道的，麻五跟关大鞍听后自己想了想还真相信了。麻四还给大家出主意说等秋致远来了先把他的嘴堵上，然后再做了他。

秋致远回去之后被困了起来，他还不知道是怎么回事，麻四说自己亲耳听到孙掌柜 跟藏志毅说他是叛徒。麻五拿着刀架在了秋致远的脖子上，让他说一句临终的遗言， 秋致远说了一番话之后关大鞍说带着秋致远去见孙掌柜对质一下。

藏志毅的手下查清楚了秋致远他们落脚的地方，藏志毅报告给了黑川，黑川说了自己的计划，要藏志毅配合行动。秋致远去了杨柳胡同，麻四负责放风，但是他喝醉了酒，跟一个自己的同行说出了他们在开会的事情。

秋致远去找了孙掌柜，这时候藏志毅也在场，藏志毅一口咬定秋致远就是杀害郑文博的凶手，还说秋致远是敌人的特务队长。秋致远给孙老板看了自己手里藏志毅的照片，这时候伪军的马队长接到消息带着一队伪军过来抓共产党，他在外面跟穿着便衣埋伏的日本人打了起来。

藏志毅听到枪声之后一位自己带来的人暴露了，有点慌了神，这时候秋致远给孙掌柜看了自己写的纸条，让他问藏志毅在郑文博被杀的当天都跟谁在一起。藏志毅说漏了嘴，孙掌柜知道了他是叛徒，这时候藏志毅的人在外面开枪杀了孙掌柜，秋致远趁机跑了。

黑川看到自己设的埋伏被马队长搅了局就带着宪兵队赶来了，这时候秋致远已经跟着关大鞍他们撤走了。藏志毅看到事情败露之后向黑川申请避避风头，黑川说他会安排的。

麻四打听到了藏志毅要去大青山的土匪窝避避风头的消息之后告诉了秋致远他们，秋致远他们加个人计划好了在他们的必经之路上设伏。

秋致远他们在半路上埋伏的时候被藏志毅的保镖发现了，关大鞍他们走了出来，这时候有个女土匪带着人抓住了他们。秋致远他们知道了这些人都是大青山的土匪，关大鞍跟那个叫横彪的二头领说明了自己的来意之后跟着这些土匪上了山寨。

关大鞍再去山寨的路上告诉秋致远说这下子他可闯祸了，这地盘可是黄拿山的地盘，让他上了山之后别乱说话。麻四在路上嘟囔着秋致远是八路，那个叫翠凤的女匪首听了之后说自己很喜欢八路军，八路军能打鬼子，随后秋致远跟那个翠凤聊了起来，他说跟他来的这几个人都是自己刚招的新兵。

到了山寨之后关大鞍跟寨主黄老太太打了招呼，翠凤告诉她说自己在巡山的时候看见两伙人在打架，就把他们全抓了过来。秋致远跟藏志毅都再虎视眈眈的盯着对方，秋致远叫黄寨主借一步说话，他告诉黄老太太自己是黑川太君的人，随后还拿出了麻四从藏志毅身上偷出来的介绍信让黄老太太看了，还说了很多奉承老太太的话。

翠凤问关大鞍他们到底是什么人，麻四说他们是八路，对面那两个是汉奸。黄老太太问了秋致远自己的疑问，还说自己的女儿翠凤说他是八路军，怎么又现在说是黑川先生的人，秋致远说的滴水不漏。黄老太太让秋致远带着他的人先下去，说把他们当成大青山的贵客来招待。随后黄老太太又叫来藏志毅问话，藏志毅一会儿说自己是黑川派来的，但是拿不出证据，一会儿又说自己是共产党，黄老太太听后说最恨别人撒谎，随后把藏志毅关了起来。

黄老太太跟秋致远他们一起吃饭的时候问了黑川答应给她的那批货的事情，秋致远说这两天就能到。翠凤告诉黄老太太说怎么能跟汉奸一起合作呢，他们都是无恶不作的畜生，黄老太太让翠凤先下去。秋致远上厕所的时候被翠凤打昏了，翠凤把他关进了猪圈，说这就是骗自己的下场。

秋致远说让翠凤打死他把，他告诉了翠凤自己是怎么骗黄老太太的，还说自己曾经为了打鬼子还扮过女人呢，翠凤把秋致远放了出来，跟秋致远在一起说起了话，翠凤被秋致远逗得高兴得不行。秋致远给翠凤说了为什么日本鬼子敢欺负中国，随后还跟翠凤说了共产党的领袖毛主席的论持久战的思想。翠凤告诉秋致远说她也想参加八路，秋致远听后高兴地不行，他说八路军就需要她这样的神枪手，还跟翠凤亲切的握了手欢迎她的加入。

黑川接到了一个信物，那是一朵绣着樱花的手绢，他需要无条件服从这个人的命令。黑川没有想到自己的上司就是从日本回来的孟若涵，她是日本军部的人。