加藤怎么也没料到自己的情人雾岛军司会抢在自己前面做成了Batista手术，但是更让人吃惊的是，原来雾岛军司竟然是美纪同父异母的哥哥。美纪把自己的情况详细的告诉了加藤。若干年前，美纪与母亲搬进了父亲的家，但是父亲并不认同这母女俩，也不让她们姓雾岛，美纪和母亲在家被当作佣人来看，高傲自我的哥哥雾岛军司更是以把美纪控制在自己手心为乐。当时的雾岛已是北日本大学医院颇有作为的医生，而朝田龙一郎当时也在北日本大学医院，两人是工作上的伙伴，但是一次手术过程中的分歧让雾岛极为不爽，因为朝田龙一郎胜他一筹的医术令他狂怒忌妒，也正是那个时候雾岛觉得自己比不过朝田龙一郎。为了铲除心头的绊脚石，雾岛利用一次医疗事故嫁祸于朝田，医院方面自是相信了八面玲珑的雾岛，而把叛逆、难以驯服的朝田开除出局，但是只有美纪心中明白，这一切都是哥哥搞的鬼，因为他的眼中容不得别人比他好，美纪义无反顾挣脱了哥哥的控制，追随朝田到了异国他乡，在紧张的抢救第一线学到了许多东西。所以，雾岛军司之所以千方百计做成日本首例Batista手术，就是为了要报复朝田比自己的优秀和美纪对自己的“背叛”。与此同时，朝田开始动手寻找麻醉师，荒濑精湛的技术很让他佩服，但是这个终日醉薰薰的人却只为了钱而出卖自己的技术，并且有过为了收取贿赂给病人试药而致多名病人死亡的记录，但是朝田却认定了他的技术，并且一语中的的说出：好的麻醉师最希望的是与好的医生合作。明真医院第二例Batista手术又将开始，雾岛军司却在为解散明真医院Batista手术小组而频繁活动着，他们终于不可避免的站在了交锋之地。

野口教授退休后的继位人被明真大学医院提到了议事日程上，但是野口依然有决定继位人的权利。雾岛军司依然在为解散明真大学Batista手术小组而努力着，事实证明，他与野口在背地里已达成某项协议。朝田、加藤等人开始准备第二例Batista手术，临床工学士经由加藤推荐找到了优秀人选，剩下的便是麻醉师了。朝田认准了终日醉薰薰的荒濑，并让伊集院与他接触。荒濑把伊集院带到了自己买醉的酒吧，在那儿，伊集院认识了小香—一个多年来一直默默关注着荒濑的女孩，从她嘴里，伊集院了解了荒濑的情况。但随后就在小香出门买东西的时候，却不幸遭遇暴力事件，她被两颗子弹打中胸部和大腿，生命危在旦夕。伊集院发现后大惊，荒濑也完全忘记了自己的醉态，对小香实施了紧急救护措施。在送往医院的途中，小香渐渐没了心跳，荒濑在对自己良心极度谴责中绝望起来，他甚至不敢再看一眼挣扎在死亡边缘的女友。到达医院后，朝田迅速展开了救治措施，他与鬼头医生相互配合，后来荒濑也进入手术室成为手术一分子，朝田精湛的医术终于把小香从死亡边缘拉了回来，荒濑也在手术中感受到了朝田的力量，他最终答应了朝田的要求，这样Batista手术小组的成员就齐全了。而与此同时，野口向加藤宣布了自己继位人的名字，这个人并不是加藤，而是雾岛军司，加藤刹那惊呆了。

众人得知加藤已没有希望当上教授后十分震惊，雾岛军司也从北日本大学转到了明真医院，准备就任下一届的心胸外科教授。同时，朝田龙一郎的第二例 Batista手术也即将开始了，对象便是那位16岁的高中女生。手术过程中，各人完美的配合着，加藤看着眼前的队伍，下定了某种决心。手术成功完成后，加藤找到野口，野口以为她还要继续理论自己当教授的事情，正不耐烦间，加藤却说她早已不想当教授了，还把自己研制的论文数据交了出来，说自己的研究成果都可以给雾岛军司，只是希望明真不要解散Batista小组，这下轮到野口有点吃惊。朝田龙一郎、伊集院等人得知加藤要以辞职来挽回Batista小组时，大家都非常激动，说缺少了加藤的队伍是不完整的，加藤看着眼前的好友，眼泪控制不住的滚落下来。朝田找到鬼头教授请求她推荐加藤，因为只要有教授推荐，就可以做为候选了。鬼头虽然表面不置可否，但是心里却很欣赏朝田的才能，在教授会议上，她提出了改革方案并提名加藤做了候选人。同时，雾岛开始接触伊集院，他希望伊集院到自己的手下工作，这让伊集院十分惶恐。第三例Batista手术又将开始，众人接到病历后都大吃一惊，因为病患不仅是心股扩张，还是概率极小的内脏反转，并且只有9个月大。朝田考虑再三后，向野口表示自己准备放弃这个手术。

雾岛军司开始拉拢伊集院，而朝田龙一郎也放弃了第三例Batista手术，事情向着极其微妙的方向前进。与此同时，教授会议也正式召开了，会议就野口和鬼头所提出的改革建议进行投票，胜者就能一步登天，而败者就有可能被扫地出门。雾岛军司为了登上教授位置与野口合伙同谋，商量着如何在最后的投票中打败鬼头一派。朝田放弃了Batista手术，这让孩子父母极为愤怒，他们认为朝田等人与其他医院的医生并无两样，朝田并不多说什么，他开始着手安排孩子转院，此举伤透了孩子父母的心，孩子转院安排在了教授会议当天。当天，伊集院找到雾岛，声称自己既然已是他手下的人，就想知道此次选举的详细情况，雾岛把事情原委都告诉了伊集院。就在野口自觉万无一失、胜算在握的时候，朝田等人发起了反攻，他们突然决定给孩子做手术（选在教授会议这天，正是有理由不需通过教授同意而有权力做紧急手术），伊集院搜集到情报后也表明了自己的立场，说自己无论如何也无法跟随雾岛的脚步，雾岛一时怔住，但随即又露出了阴险的笑容。第三例 Batista手术开始了，优秀的团队重又聚集在一起，为了这个手术，他们已经策划了很久，但是手术中他们却发现了一个意外，这个意外正是雾岛留给他们的致命一击，这个婴儿还患有其它不能手术的病症，雾岛故意隐瞒病情，这让手术气氛一时紧张到了极点。

大家面对患者被故意隐瞒病情的事实，一时不知该如何处理，加藤打算停止手术，随后赶来的野口等一众医生也屏住呼吸观望事态发展，其余医生则通过屏幕看着这场手术。朝田深思片刻后果断的下了决定，他不打算停止手术，而是通过从胃部抽取一根血管连到心脏，以此做一个搭桥来解决面临的难题。他的想法令手术组成员信心大增，在朝田的指挥下，手术继续进行，事实证明，朝田以其精湛纯熟的医术解决了难题，之后的步骤就可以再进行Batista手术了。雾岛通过屏幕看到了朝田无人出其之右的医术，想着自己的最后一招也被朝田闯过之后，他开始彻底绝望，失魂落魄的走上大街。同时，小患者的Batista手术即将开始了，朝田等人正有条不紊的进行手术，正在此时，却从急救部传来了惊人的消息，雾岛从高处坠楼（他选择了自杀），身体多处受伤，生命垂危。木原冲进手术室，恳求朝田救救雾岛（因为雾岛对于木原还是心存诚恳，所以最后木原不忍看着雾岛死去），朝田得知消息后，一边是性命攸关的Batista手术，另一边也是性命攸关的急救手术，他深思片刻后做出了果断的决定，他请加藤暂时做主刀，伊集院担任第一助手，而他准备去抢救雾岛，看着心跳已经停止的雾岛，朝田利用脑死亡前的最后4分钟，用行云流水般的神速替他缝合了所有的伤口，并且进行了心脏按摩，最后时刻，雾岛的心脏终于恢复了跳动，朝田不由松了一口气。返回 Batista手术现场，朝田又执刀继续进行手术，并且在这例手术中运用了新的方法，这个新的方法足以颠覆以往的旧方法，将是里程碑式的一个实践，朝田以其极尽完美的手术折服了所有的医生，大家报以热烈的掌声，只除了野口，因为他知道他拼命想得到的一切已经化为泡影。伤愈后的雾岛选择去了美国，临走前，他由衷的对朝田说：你才是最好的外科医生。朝田则决定离开明真，依然选择了去往战火纷飞国家的万人治疗队，Batista手术小组成员给予了他最深的祝福，朝田带着众人的祝福，又一次投身于医疗的最前沿。