以为金明国博士死去的孙赫知道了他被NTS转移到日本的事情，他下令打听金明国的位置。权勇冠局长指示载熙监视孙赫，强化威胁NTS组织的外部势力。正在调查金明国博士下落的惠仁被调查室要员叫去，重新接受关于‘雅典娜’组织的调查，惠仁再次陷入了危机。

正在追赶绑架金明国的绑架犯的政宇掉进陷阱。NTS的调查越来越接近孙赫的根据地，惠仁得知后欲告诉孙赫危机情况。NTS要员们向金明国绑架的地方出动，这时俊浩知道了真的金明国博士所在的位置。

正宇看着在自己面前接受拷问的惠仁惊呆。绑架犯们以惠仁做人质，要求正宇拿来新型原子反应堆的核心设备SNC。左右为难的正宇为了救惠仁决定偷SNC。正宇接近保管SNC的保险柜，开始解开装置，正当正宇即将打开保险柜的瞬间，举着枪的要员们在背后包围了他。

丢失SNC的孙赫和惠仁遣送到美国。权勇冠局长下令载熙调查孙赫，对偷了SNC的正宇下了停职处分。对金明国博士的死仍有怀疑的正宇独自调查在日本的事件，发现金明国死前拿出来的东西是解开事件的重要线索。

正当孙赫向正宇开枪的瞬间，惠仁突然出现。露出不安表情的惠仁告诉正宇不要再见面，正宇无法理解突然改变的惠仁。美国CIA怀疑孙赫的身份，下达抓捕令，孙赫被CIA和NTS同时追捕。

正宇小心翼翼地接近孙赫的房子，不料出现在他们面前的竟是向孙赫举枪的惠仁。抓获孙赫的权勇冠局长对他下达NTS独立任务。正宇、载熙、俊浩从孙赫那里接到找出NTS内部间谍的秘密任务。正在调查孙赫的正宇从孙赫随身携带的照片中发现了熟悉的面孔。