寻人密探组必须破解一件怀疑绑架案，这次案件扑朔迷离。保姆简和婴儿同时在住所消失，在此之前简刚因为偷窃被辞退，因此简成为头号疑犯。后来事主收到绑票电话，所有的证据都指向简，然而事情刚刚开始……

名门之女佩吉突然离奇失踪，寻人密探组展开一轮调查后发现佩吉原来在失踪前与一名警员见面，在密探组努力追查下发现该人是一位假冒警员！而且二人更涉嫌一起盗窃案，到底佩吉的失踪与该男子有什么关系？而出身豪门的佩吉为何又会涉入盗窃案中？

第二季中的艾米莉回来了。并且已经变成了大人的样子，还掌握了一门超能力——穿墙术。

艾米莉逃出实验室后又找到了拉娜，为了与她重温儿时快乐将她囚禁起来。另一方面，Pete与克拉克道别，但却被莱诺的手下找到。

克洛伊找到莱克斯希望他帮助自己与莱诺对抗，指证莱诺的罪行。终于，莱诺被捕了。

一个自称来自Krypton叫做Kara的女孩找到克拉克，告诉他Jor-El派她来带克拉克回家。

莱诺被送进了监狱，他告诉儿子自己得了绝症，但莱克斯根本不相信。

克拉克发现了莱克斯的密室，里面全是关于自己的资料，克拉克顿时火冒三丈，拂袖而去。

结尾处，Kara消失，乔纳森似乎死了，莱克斯中毒，克洛伊早炸弹袭击……