Merlin在干农活的时候对烟雾使用了魔法，仅仅因为无聊，但要命的是被人发现了，于是Uthur就找来了Witchfinder Aredian。自然又是腥风血雨。Gaius为了保护Merlin和Morgana承认了莫须有的罪名。于是Uthur决定烧死他。Merlin对Witchfinder可以说是以彼之道还施彼身，所以真相就大白了。

A mysterious warrior Morgause来到Camelot向Arthur挑战并赢了他，于是她要求Arthur去找他。Arthur为了想知道母亲Igraine的故事答应前往。Gaius发现Morgause是Morgana的half-sister，并明白魔法高强的她一定有所图谋。Arthur知道了自己的出生和母亲死亡的真相，回来找Uthur血拼，但在Merlin的“谎言”下，一切又“恢复正常”。

Merlin从一个赏金猎人手中救出了Freya，一个Druid girl，并爱上了她，但发现她被下了诅咒，每晚午夜钟声响起就会变成a bloodthirsty beast——a Bastet，貌似长着翅膀的黑豹。最后呢，因为在追捕的时候被Arthur刺伤了，所以Freya死掉了。Merlin就将她火化在湖中。

五个国家的国王聚集在Camelot签署和平协议，King Alined 想要和Camelot开战，但是又找不到借口，于是就借助magic让Arthur爱上了King Olaf的宝贝女儿Lady Vivian。而破解魔咒的方法就是a kiss of truly loves，好吧，之前送错求爱信的Merlin从头到尾认为Arthur的真爱是Guinevere，于是Gwen也成功的用她的吻解救了Arthur，带来了和平。

一个叫 Alvarr的warlock救了成为孤儿的Mordred，他相信Mordred可以驾驭the Crystal of Neahtid，于是就找到了Morgana，让她偷出了水晶。Arthur找回了水晶抓到了Alvarr，Morgana暗中放了Alvarr并与Uthur决裂。当然Merlin也拥有驾驭水晶的能力，于是他看到了让他无法承受的未来。

Morgause点燃了the fires of idirsholas，唤醒了the knights of medhir。Arthur和Merlin前去查看遇见the knights，逃脱后回到城堡，却发现Camelot里所有的人都睡着了，当然除了Morgana。Merlin再次向巨龙求助，但巨龙一定要他实现放了它的诺言，Merlin用母亲的生命保证换来了解决方法——杀了Morgana。Merlin让Morgana喝下了毒药，迫使Morgause停止了进攻。Morgause带走了Morgana。Merlin也偷出一把旧教铸造的剑，用魔法砍断绳索，放出了巨龙。