方腊带着残部路遇菜园子张青孙二娘夫妇，又是一场混战，张青和孙二娘奋力将方腊残部剿灭，双双战死，但方腊却又命大逃脱。
谁知前面还有武松拦住去路，二人交手，武松一只胳膊被兵器刺中，插入柱子，他忍痛砍掉自己的手臂，追上方腊，以一只手臂将方腊擒住。方腊起义军自此才全部被剿灭殆尽。
宋江探访囚牢中的方腊，方腊赠给宋江自己的一条红头巾，他敬佩宋江是一名英雄，满怀惺惺相惜之意，而宋江却唾弃他造反作乱祸害黎民，方腊告诫宋江警惕奸臣，而宋江不为所动，话不投机，宋江拂袖离去。
童贯视差前线，要将方腊部下的兵将们全部斩首，宋江苦苦求情，说明那些都是被迫为贼的良民，童贯不允，告诉他一日为贼，终身不改，宋江似是听出了一些弦外之音。
徽宗听闻方腊叛军被平定，召宋江率领梁山军回京接受封赏。
鲁智深在六和寺中听见潮信，这才明白当年五台山文殊院智真长老留给自己的八字之含义，遂含笑而逝。宋江等人前来寺中看望鲁智深，只见到他的尸体，和他留下的一首偈语，众人悲痛，宋江难过病倒。
武松向宋江辞行，愿意留在寺内修行，请他抹去请功名单上自己的名字。宋江心里不舍，却不愿强人所难，希望武松日后能得善终。武松从此再也没离开六和寺，直到八十岁善终。