皇上私下询问当年小公主之死的真相，珍儿指责是媚娘所为，而且媚娘与预言有关。皇上信以为真。珍儿添油加醋，皇上十分震怒。密令元宝诏长孙无忌进宫。元宝在途中与随从聊天，无意间被凌静听说了宫中发生的事情。长孙不见小多，媚娘要盈盈、狄仁杰找到君羡，将先皇遗诏交与君羡。禁军找到小多尸体，并发现血书，皇上终于向媚娘质问。皇上决定废除皇后。盈盈派人追杀君羡，君羡知道媚娘有难……

盈盈取走了媚娘藏起来的东西，大惑不解。小多被打断双脚，刺瞎双眼，放逐街头。东施收留了他。盈盈不断折磨珍儿，珍儿吓得唯命是从。盈盈指使珍儿劝说皇上将媚娘打发出宫。皇上决定将媚娘作为人质送给匈奴。君羡来到京城，打听到宫中发生的事情。君羡在途中救下媚娘……

盈盈在皇上身边旁敲侧击君羡是媚娘的守护神，皇上盛怒，要诛杀君羡和媚娘。君羡、媚娘、凌静三人躲避官兵追捕，来到破庙。媚娘向君羡倾诉了宫中发生的所有事情。小多爬到破庙，媚娘认出了小多。但小多被割掉舌头没法说话了。皇上授意元宝一定要活捉媚娘，保住媚娘性命。东施来给小多送吃的，被媚娘撞见。媚娘没有问出实情，却派东施去通知盈盈。东施回到宫中，本想收拾包裹逃命，却被盈盈撞见。东施告诉盈盈媚娘要见盈盈……

盈盈来见媚娘，小多十分激动，盈盈趁媚娘不备，杀死了小多。媚娘让盈盈去找狄仁杰和皇上帮助自己。盈盈向官兵告密，媚娘发现小多死了。官兵前来破庙，君羡与官兵厮杀。盈盈从官兵举止看出皇上并不想处死媚娘。君羡等人逃出城外。盈盈询问官兵统领，知道皇上心软了。狄仁杰带回小多尸体验尸。狄仁杰叩见皇上，禀报小多尸体的事，告诉皇上小多根本不识字，血书乃架祸之举。凶手定是要害皇后。盈盈陷害珍儿刺杀自己。珍儿指责是盈盈指使自己的，皇上不信。盈盈指使护卫杀死珍儿灭口。盈盈告诉皇上媚娘在护国寺…… 盈盈告诉皇上要小心君羡和凌静。皇上带重兵包围媚娘和君羡。皇上以放君羡来要挟媚娘回宫。媚娘答应皇上，皇上却出尔反尔。媚娘挟持了皇上。君羡和媚娘分析，怀疑到盈盈。狄仁杰从元宝处套出皇上实情。凌静以先帝遗诏的事气皇上。狄仁杰要盈盈出面救回皇上……

狄仁杰故意劝荐皇上写下圣旨放了君羡。一场风波平息。皇上回到宫中，仍然派兵追杀君羡。媚娘开始怀疑并试探盈盈，盈盈心中不安。狄仁杰向皇上负荆请罪并要求追查小多疑案，皇上恩准。狄仁杰见到媚娘，两人都怀疑到盈盈。盈盈出宫测字占卜命运，狄仁杰尾随而至，询问出盈盈与算命先生间的事情。狄仁杰预感到上官仪的死因也快要查出来了。狄仁杰见到缉拿君羡的告示，告诉媚娘。媚娘质问皇上为什么出尔反尔。媚娘责怪皇上恩将仇报，皇上向媚娘询问向自己不小心透露的先皇遗诏的事，媚娘没有回答。凌静与君羡在逃亡途中不小心被官兵在酒中下了蒙汗药，凌静被抓。皇上到牢中向凌静询问先皇遗诏的事…… 君羡来找狄仁杰。凌静向皇上讲出了“新君会”和君羡的身世，并讲出了先皇遗诏的事情。皇上十分镇惊。媚娘来见君羡，并让狄仁杰拿出先皇遗诏，请君羡拿回皇位…… 君羡留下先皇遗诏，只身到皇宫救人，被困大牢。皇上向媚娘证实君羡身世和先皇遗诏的事，媚娘为了君羡性命与皇上发生争执。狄仁杰派人打探皇宫情况，知道皇后被软禁，君羡被俘。狄仁杰翻看了先皇遗诏，决定公开遗诏，派人四处张贴遗诏复本，并修书派人速送长孙无忌。京城大乱，百姓们都看见了先皇遗诏。百官在朝房议论纷纷。狄仁杰佯装不知。皇上早朝，发现情形不对，正要询问，元宝送来遗诏复本，皇上匆忙退朝。狄仁杰建议众人到朝房候命，众臣赞同。长孙派人送来“告天下书”狄仁杰兴奋至极，对众人公布长孙证实遗诏确实属实。皇上派人将君羡推出武门斩首，百姓不分男女，以血肉之躯来劫囚车，救出君羡，并拥戴君羡为皇帝，推翻李治。众官叩请皇上顺应民意。君羡劝说百姓以大局为重，以天下太平为重。李治要众人拿出证据，狄仁杰拿出先皇遗诏……

君羡为了天下太平，当众自刎以示忠君。媚娘感谢凌静对君羡的一片痴心，将君羡骨灰交予凌静，让凌静将君羡骨灰带到安静的地方去。媚娘向皇上说明小多的死因盈盈嫌疑最大。皇上愿随媚娘同去观狄仁杰断案。盈盈终于承受不住，承认了自己的罪过。媚娘这才知道母亲和小公主都是盈盈害死的。皇上也十分惊奇。媚娘派人到牢中找来盈盈，在空灵堂前，媚娘让盈盈从一杯毒酒和一杯普通酒中选择，盈盈将两杯酒都喝下。媚娘要盈盈将所有的事情从头至尾讲出来，盈盈毫无保留地将所有的事情一五一十地讲了出来：预言石、武母的死、伤害媚娘和小公主的歌谣、小公主的死、小多的死…… 若干年后，媚娘终于成了一代女皇武则天。婉儿要狄仁杰告诉自己媚娘想念的那个人的样子，狄仁杰无意间发现了一个与君羡长的一模一样的人。婉儿将他带到宫中，命他向媚娘直呼其名。年老的媚娘仿佛见到君羡，老泪纵横……