李建成又上奏李渊，调走了李世民得力的谋臣房玄龄和杜如晦，李世民的幕僚皆感自危。长孙无忌劝李世民：以社稷为重，以国家安危为重，早除祸根。李世民不忍对亲兄弟下手。北胡人又复犯大唐，李建成举荐李元吉领兵讨伐，李元吉向李渊请调尉迟敬德、秦琼、程咬金等李世民手下的猛将，李渊答应。长孙无忌警告李世民：若不早做决定，大祸降临。李世民还是下不了决心。 东宫有人密报：李建成欲在为李元吉饯行时杀李世民，众人哗然，幕僚们对李世民说：若再不下决断，将离开李世民。李世民只好痛下决心。李世民采纳谋士们的主意，密奏李建成、李元吉淫乱后宫，李渊召李建成、李元吉进宫询问。李建成、李元吉在玄武门被李世民的伏兵围住，李世民含着泪射杀了李建成。李元吉逃跑，尉迟敬德害怕李元吉借李渊皇威反扑，杀了李元吉。这一页被记录在史书中，后人称之为“玄武门政变”。