铁飞花正要逃跑之际，千户手下的兵士涌了进来……

冲出关押的房子，铁飞花抓了千户为人质，要付佥事将包围在身边的官兵都统统退下去。

付佥事无计可施，只得看着铁飞花押着千户带着柳儿逃出客栈。付佥事遂命人一路跟行伺机抓捕。

高旗决定营救铁飞花。她追随其后，寻机保护铁飞花。而铁飞花一路上忍饥挨饿，人困马乏。最终决定在林中稍作休整。不料，偶遇贪图名利的江湖人出手偷袭铁飞花，高旗出手干掉江湖人，并将千户杀死……

这时，官兵追赶上来，高旗将领兵的总旗官杀死，并声言铁飞花是自己朋友，谁要杀铁飞花她就杀谁，铁飞花怒斥高旗，她这样并非是救自己，而是在陷害自己，擅杀官兵是大罪，自己已是百口莫辩。高旗对铁飞花说自己是前来帮助她们的，想和铁飞花交朋友。并主动报上自己的师承何人，乐清心意门高竞。铁飞花一听乐清心意门知是好人，便也不再计较。高旗对铁飞花推心置腹，提醒她官场黑暗，江湖险恶，铁飞花对高旗甚是感激，并且请求高旗助自己一臂之力。

在驿道之上，铁飞花偶遇陈久久。陈久久告诉铁飞花，他收到消息，漕粮是倭寇劫的，他要继续跟踪，在铁飞花的恳求之下，陈久久答应铁飞花跟自己一起前去打探。

付佥事回到杭州，并没有跟陈清明复命，而是到钦差行辕向方谨陈情，方谨从付伯伦口中了解到了铁飞花情况，当付伯伦提到龙三的时候，方谨突然意识到龙三一定出事了……

陈久久有意将铁飞花引到一座茶棚外，铁飞花通过“察言观色”揭穿了陈久久已经被人收买的事实，是来害自己的。最终陈久久自食恶果，被自己所设置的机关刺死。

柳丝丝得知姐姐冢原柳穗被铁飞花杀死，决意要为家姐报仇。

高旗等人从驿道上，策马而来。来得机关重重的土屋击开门，发现陈久久的尸体，铁飞花却不知去向。只看见屋内留有的血字“铁飞花查漕案，谁敢下套，谁敢挡我，天王老子我都杀。”此番言论传到杭州，各位官员各怀鬼胎，更有的伺机对铁飞花不利。

铁飞花想起机关重重的木屋不是一时就能建起来的，于是带着柳儿找到茶棚老板查证。经过柳儿的利诱恐吓，铁飞花从茶棚老板那里得到了一个跟护漕兵士有关的重要线索。

客栈内，铁飞花和柳儿互换身份。柳儿打了闯进来捉拿铁飞花的衙役，并且让衙役传话，铁飞花要大大方方的回到杭州城去。

高旗和舒俊得知铁飞花要去江阴查漕兵，一路尾随。在路途上无缺道人和不弃和尚带着小徒弟戒嗔想捉拿铁飞花，求得赏银。高旗和舒俊现身解围。

温印泉从周少康那里得知替姜百户把风茶棚的人还活着，便派周少康赶在铁飞花前面去销毁证据。吕中找到温印泉，说自己找到一条查漕粮的线索，便是江阴那支失踪的兵马，可能藏在某个村庄。请总督大人下令，传谕各州各县官吏，深入乡村勘查可疑。

铁飞花和柳儿不查江阴的练兵校场，却去戴溪刘家洼坟茔，只因为在江阴密练的那支队伍失踪的前几天，负责招募兵士的南直隶兵备道员刘万成，却因病亡故。铁飞花决定去验尸骨。铁飞花和柳儿闯入无锡府衙，意欲劫持知府前去戴溪刘家洼坟茔。知府却告知铁飞花，不仅刘万成坟墓被掘，连棺木都消失无踪。

铁飞花通过望闻问切断定知府是在说谎，铁飞花一语道破天机，知府心虚，答应带铁飞花去戴溪查看坟茔现场。

铁飞花仔细收集坟墓坑尸虫。这时，闻讯赶来的千户欲捉拿铁飞花，这时，高旗押着另一千户赶到，要铁飞花以千户为人质，赶紧逃脱。不料，大敌当前，铁飞花却一语道破了高旗的身份……

高旗却对铁飞花说自从在仙游相识，自己是真想帮助铁飞花的，也拿铁飞花当朋友。这时，一直跟踪在高旗身后的伺机抢功的唐门弟子突然现身偷袭铁飞花，为救铁飞花，混战中舒俊身亡，高旗断臂重伤，却不愿意连累铁飞花，只身一人离开，而柳儿也被高旗手下带走。

铁飞花捉住唐薇问清缘由，唐薇承认只不过是想邀功请赏，铁飞花建议唐薇找其姐夫，提出派大军保护她去杭州，这样就能避免血腥。

小和尚戒嗔找到铁飞花说她与佛有缘，要收她为徒，铁飞花不以为然但通过戒嗔的佛语禅机，铁飞花仿佛悟到了什么，她所经过的人和事都在一瞬间闪现在眼前。所有这些人的面部表情变化，每个穴位的变化，牵动着经络的行走变化，又牵动着某个腑脏的变化。这所有的变化已反应到动作和动态上以及神态上了。这样的闪现已经让铁飞花对自己望闻问切断案的本事融会贯通了。

唐肥趁高旗昏迷搜出身上那封冢原柳穗子的信函，断定铁飞花与倭寇有关联，高旗也是倭贼探间。

温印泉在得知刘万成的尸骨烧毁了，骨灰倒进太湖，铁飞花再也找不到线索，不禁心中暗暗得意。

返回杭州的途中，铁飞花遇上董成的截杀，她专挑董成的薄弱之处进攻，致使董成慌乱被擒。铁飞花一眼识破董成此举是为了救人，而她可以助董成一臂之力。

铁飞花综合地运用医学辩证和推论来分析董成，准确地推断出董成的经历和意欲何为，铁飞花准确的推断让董成心服口服。铁飞花答应帮助董成的朋友洗清冤屈。董成作为对铁飞花的报答，答应铁飞花可以找来江湖上的朋友前去杭州，让杭州局面混乱，好让铁飞花方便行事。

虞风收到匿名信件，称若再查漕粮，必将他杀死铁苍龙的秘密公之于众，吕中感到事态严重，安排手下鲁洲将虞风及其家眷一干人等送出杭州城。

方谨询问护送铁飞花回杭的千户，铁飞花的线索查询如何，千户却道铁飞花眼能通神，单凭人的声气就可以查出案子。途中又遇一位小高僧的点化，更能将人的五脏六腑都看清。方大人却在为铁飞花没有真凭实据而忧心。柳丝丝与九州侯越走越近，方谨一直怀疑柳丝丝的身份，吩咐亲随一定要敲诈听雨楼试探柳丝丝。

此时的柳丝丝也在暗中布局，一定要铁飞花偿命。所谓明剑易躲暗箭难防，铁飞花的处境危机。

铁飞花在杭州城内与快意堂的人马汇合，从快鞭三嘴里得知龙三已经去世，虽然心里早有准备，却还是悲痛万分。