中元告诉妍华Ray在白山和郑柳健的交换中死了，妍华告诉中元原以为是自己杀死了他的，中元以为他们俩是恋人关系，妍华说是为了利用装作喜欢而已。崔敏想要柳健私下非官方的帮助她查找白山和刘中元的下落，并给了他必要的东西。NSS要员在查找朴泰熙的时候被她发现逃开了。柳健给妈妈打电话，妈妈听到他平安归来开心的哭了，柳健说自己处理完事情就回去见她，妈妈说也有很多话跟他说。柳健逃过监视去找魏尚哲，但是却看到魏尚哲的尸体。时赫到达魏尚哲家发现魏尚哲已死。刘中元打听到了白山的下落，准备前往，同一时间柳健打妈妈家的电话无人接听，担心之下前去找寻，却意外见到白山和妈妈在一起，妈妈告知柳健白山就是他的父亲柳尚俊，柳健听到之后十分震惊，白山刚要去握柳健的手，却响起了枪声，刘中元赶到想要射击白山，却意外杀死了柳健的妈妈郑智瑛。刘中元逃跑后，柳健回到抱着妈妈的身体的白山旁，妈妈拜托他原谅爸爸，就离开了人世。因为白山体内有NSS偷偷注射的可以追踪位置的药液，崔敏让时赫按照位置追踪去找寻白山，但是白山感到疼痛后，自己取出了追踪器遗弃，使得追踪信号消失。柳健妈的葬礼上，秀妍告诉崔敏白山是柳健的父亲，崔敏不知道如何安慰柳健，柳健说一定会亲自杀了刘中元。秀妍看着因为妈妈去世痛苦的柳健，到教堂去找哥哥聊天，说感觉自己爱的人正一个个离开自己。时赫查出魏尚哲家只有柳健留下的指纹，想要逮捕他，但是他却逃跑了，崔敏也没有下令继续追捕他。Ray醒来，崔敏想要从他嘴里知道Mr.Black的消息，但是无论用什么酷刑他都不说。Mr.Black让刘中元去解救Ray，刘中元劝妍华不要意气用事，想要报仇得有计划。Ray要求局长帮他和李秀珍一起到瑞士去，就让他和Mr.Black接触，NSS决定同意Ray的提议。

秀妍告诉崔敏她哥哥在那个教堂做神父，这个是Ray和李秀珍早就做好的计划。这时刘中元给NSS发来视频电话，要求用教堂的神父和人质与Ray和李秀珍交换。柳健偷偷潜入了教堂，一个个消灭着刘中元的手下。NSS在教堂交还了Ray和李秀珍，刘中元利用让NSS准备他们逃离的车辆的间隙，扔下Ray和李秀珍，带着自己的手下们从秘密通道逃跑。因为有人质逃跑Ray开枪杀了他，秀妍返回教堂，Ray拿枪逼着秀妍的哥哥，这时柳健拿枪逼着李秀珍出来，但是Ray却先射杀了李秀珍，又枪杀了秀妍的哥哥后逃跑。柳健根据崔敏提供给他的追踪路线，找到了Ray，在两人的正面对决中，柳健最终杀死了Ray。秀妍因为哥哥的离世很痛苦，爸爸告诉她不要埋怨柳健，因为作为人质的情况是无法控制的。Mr.Black知道Ray已死，给刘中元打电话说以后他就负责Ray的职务了。白山告诉了崔敏曾约定的关于核武器的情报，崔敏带队前往探测，找到了四个核武器，白山说自己会留着最后一个核武器作为筹码。柳健根据查找朴泰熙的位置，去找刘中元……

柳健追踪朴泰熙的位置找到住所，但找到的地址却不是刘中元的住所。妍华杀了朴永春代表，正好被回来的朴泰熙看到这一场景，两人因此相互厮杀打斗起来。中元喝停他们，知道妍华杀了朴永春气愤地赶走了妍华。朴泰熙去打包外卖，却不知咖啡店经理报告给了NSS，柳健跟踪朴泰熙查到他们的住所，向崔敏寻求支援。中元收到信息被告知藏身之所已被暴露，迅速撤离，却在停车场被截住，只好分散走。贤宇快要抓住朴泰熙，却被朴泰熙刺伤，时赫眼看到却没有去追朴泰熙。柳健杀死了中元的手下基成，两人愤怒的对打起来，但是柳健的头突然痛起来，原因是脑部残留的子弹的作用，柳健被刘中元打倒，刘中元想到误杀了柳健的母亲放过了柳健，和朴泰熙一起逃走了。中元与Mr. Black的谈话被朴泰熙听到，心为震惊怀疑中元会出卖原来的目标。妍华回到中元的住所，不知柳健就在住所等着，被柳健带走。柳健告诉崔敏有人通知刘中元他们要去抓他怀疑NSS有内鬼，不能把妍华带回NSS。柳健把妍华关在密室里，为了让妍华开口开始折磨她。崔敏带秀妍去看核武器，并让秀妍调查贤宇和时赫谁是间谍。柳健告诉妍华自己要杀中元的原因是为死去的母亲报仇。尹时赫去见了刘中元，将情报给他，被宋英民用手机追踪到他的位置，知道了他是间谍，尹时赫不得不直接杀了他。崔敏将贤宇和时赫一起关在审问室，想看他们的反应。崔敏得到时赫搭档宋英民已死的消息把时赫带了出去。秀妍负责审问贤宇，贤宇对于秀妍对自己的不信任感到气愤，不配合审问。中元也开始他的计划……

妍华告诉柳健Mr. Black是以前被白山暗杀的五位核物理学家中还健在的一位。柳健向崔敏寻求进入国家记录院的帮助，他们的通话被局长的监视人员偷听到了，而他们仍不知情。柳建进入国家记录院查看当年白山暗杀的五位核物理学家的资料。局长的监视人员带人赶往国家记录院，柳健要离开时发现有人进来，与他们交手后逃出。柳健去拜祭已故的母亲，遇到白山，白山说自己很后悔一直不知道你的存在，白山劝说柳健不要再参与对抗IRIS的事了，柳健告诉白山Mr. Black就是白山当时没杀死的刘正哲博士，白山不敢相信，柳健坚持自己会亲自抓到中刘中元和Mr.Black。崔敏建议应废弃核武器，坚持韩半岛无核化，总统却赞同国家应该确保核武器，反而召回了姜哲焕局长叫他组织国政院和NSS联合核武器管理队伍。姜哲焕局长被强迫带走去见刘中元，刘中元想拉拢局长与自己合作。尹时赫被崔敏问话，时赫说一直都是副局长给他下达秘密任务，如果自己的间谍，副局长的责任更大。崔敏决定用测谎仪测试分析贤宇和时赫的身份。秀妍去教堂见郑修女，想了解脱北者的一些情况，郑修女跑去通知刘中元，刘中元派朴泰熙到教堂，就在秀妍刚刚与崔敏通完话，朴泰熙来到她身后，将秀妍弄晕带走。调查时赫的枪支并未使用，和杀死宋英民的枪也不一致。姜哲焕下令在追捕白山和郑柳健的过程中可以使用枪械，并暗示威胁崔敏不要在身后帮助柳健 。尹时赫和徐贤宇被带走准备接受国情院的调查。刘中元用秀妍作为抓郑柳健和白山的诱饵，中元打电话给崔敏要以白山和柳健交换池秀妍。崔敏将实情告诉柳健，并说自己无法再帮助，要靠他自己想办法去救秀妍。白山也接到秀妍被刘中元绑架的消息，决定亲自前往。姜哲焕拒绝投奔中元，并向他说出NSS已经确保了核武器，并要与中元作对。柳健和妍华找到教堂，与中元通上电话，柳健要自己前往，妍华却一定要跟着他……

白山只身闯进中元的根据地，与中元他们展开枪战，但是却不敌众人，最后被抓住。但秀妍已被白山的助手所救并放在医院门口，被咖啡店员看到救回。柳健知悉秀妍已被救出，知道肯定是白山闯进了中元的根据地。中元用酷刑威逼白山开口。妍华利用自己与中元的交情，主动帮助柳健救白山，妍华进入根据地，柳健趁机救出白山。中元发现白山不见，跑出去追，但还是让白山柳健跑掉了。尹时赫与徐贤宇在被带往调查的途中，时赫故意造乱，车辆翻倒，押送的武警乱枪射杀，时赫想逃跑时被贤宇开枪打中，时赫翻入桥下失踪。崔敏告诉柳健他的身体现在很危险，柳健知道自己的情况还坚持要抓住刘中元。中元决定转移阵地，妍华通报柳健让他做好准备。NSS全队展开追捕尹时赫，而崔敏也联系美国支部长，想将核武器转出去，继续维护韩半岛的和平。中元联系Mr.Black需要他的武器和人员帮助，以助自己夺到核武器。柳健准备好了枪支弹药来到了中元的新阵地，妍华与柳健联系时被发现，匆忙逃跑。柳健只身闯进敌营，与中元遇上，相互展开了枪杀，就在危机时，白山及时赶到将柳健救出。白山突然感觉柳健做事和说话越来越像自己了，为了不让自己后悔，保护儿子，决定将以前有关自己所做的事的一段录音给柳健，内容包括IRIS的很多事情。白山决定要与Mr. Black 见面，做个了结。妍华逃回到柳健的住所，柳健回来突然倒在地上，中枪的伤口血流不止……

柳健醒来，妍华已经给他包扎好了伤口，说他已经昏睡了20小时了，问他是不是杀了中元，柳健说他还活着。Mr.Black作为韩国政府想要合作的科学家身份回到韩国，总统和他探讨核武器的威力。Mr.Black确认了韩国政府拥有了核武器。刘中元要转移根据地，Mr.Black说会给他安排场所，并说自己已经到达韩国马上会跟他见面。妍华借着酒劲希望柳健不要杀中元，知道他是为了报母亲的仇，但是自己和中元的母亲都被杀了，怎么去报仇呢，如果中元死了，自己就成寡妇了。崔敏和柳健见面，希望他确保白山手里的那一枚核武器，柳健说白山准备钓Mr.Black的时候用那一枚，自己相信他的话。刘中元带队入住Mr.Black为他们准备的住所，腿受伤的时赫负责接见他们。柳健见炳镇，让他帮自己分析白山给的硬盘，但是炳镇在回去的路上被局长派的要员抓捕。刘中元给北朝鲜领导打电话，说自己会再首尔引爆核武器，然后北朝鲜派兵闯进南边。Mr.Black和刘中元见面，Mr.Black说如何中元引爆核武器成功，自己会把他推到很高的位置。崔敏带领美军准备转移四个核武器，姜哲焕局长下令让秀妍带队追回崔敏，崔敏最后无可奈何只好返还核武器，局长让崔敏自己离职回美国去。崔敏给柳健打电话让她和秀妍联系下，柳健给秀妍打电话报平安，让她帮自己分析炳镇拿着的硬盘，秀妍想起来炳镇被捕是黄室长拿着那个硬盘，回到NSS调换了硬盘。秀妍带贤宇出去吃饭，向贤宇道歉，希望他能够理解这个职务有时候必须做一些不想做的事情，两人重归于好开心的吃着饭，贤宇突然接到尹时赫的电话，秀妍让A组追踪尹时赫的位置，发现在贤宇家，秀妍给柳健打电话要求支援，同一时间秀妍和贤宇，柳健和妍华都赶到贤宇家，但是尹时赫却不在……