镇上开了个奇怪的算命博览会，在那里三个小伙伴通过布莱森太太结识了算命女巫泽达，并且发现这个泽达是一个可怕的坏女巫，她利用布莱森太太对她的信任骗取钱财。莫娜通过自己的星相学知识，识破了女巫的本来面目，并且和巨人公主、激光飞侠一道，巧妙的打败了女巫，最后女巫落入法网，布莱森太太的钱财也追回来了。

镇上草药店的美宝女士被莉莉和莫娜认为是精灵王后，因为她能用草药治好大家的花粉热，所以小伙伴们都非常喜欢她，并且认为她的店里到处是精灵。可是事有凑巧，当莉莉再次为了花粉热去找美宝女士的时候，她却到林子里去了，而且一整天都没有回来。大家觉得事情不妙，就带上她的拐杖到森林里去找她。原来美宝王后因为没有带权杖，被邪恶精灵抓住了，目的是为了控制精灵世界一年。莫娜小魔女、巨人公主和激光飞侠与邪恶精灵展开恶斗，终于战胜了精灵，救出了美宝王后。

夏天大家戏水的乐园海滩上出了鲨鱼，虽然并没有人受伤，但是大家都吓坏了，豪警官不得不为此关闭了海滩。莫娜觉得事有蹊跷，决定调查。结果发现镇上新来的拉瑞形迹可疑，他们到拉瑞居住的游艇上调查，发现这个拉瑞就是一个鲨鱼人。拉瑞邀请大家到他船上去聚会吃自助餐，为了不让大家被鲨鱼人吃掉，莫娜小魔女，巨人公主和激光飞侠又开始行动了。经过海底搏斗，他们脱掉了鲨鱼人的靴子，让他不能再吃人。回到岸上，拉瑞被捕了，因为他故意制造恐慌，目的是想占用海滩做房地产赚钱。

镇上所有的猫都为普曼的秘密配方猫粮发了疯，它们会不惜一切代价就为了吃一口。开始大家都没在意，但随着阿方的种种不正常的举止，到后来从家里逃走，事情到了不可收拾的地步。莫娜和小伙伴们跟随普曼的送货车和阿方来到了普曼的工厂，发现了一个惊人的秘密：普曼是一只野心勃勃的猫，它通过猫粮和项圈控制了所有的猫，并把它们变大，帮他工作。他的最终目的是把人和猫的角色转换，以便自己统治地球。碰上莫娜算他倒霉。最后竟然被豪警官抓到他在配方里用了毒品，最后锒铛入狱。

清新空气夏令营正在开展，这时候来了个蛮横的葛布拉塔先生，以自己买下这块地为由，凶恶的把大家赶走了。不甘心的三个小孩跑回来和他理论，又被抢走了查理的扩音器。莫娜和莉莉、查理到图书馆查资料，正好碰到葛布拉塔先生也来查询资料，原来他是海神，来这儿想恢复沉没的亚特兰蒂斯，而那只扩音器也不是普通的扩音器，而是恢复亚特兰蒂斯的钥匙，只要在日落前吹响三次，亚特兰蒂斯就会升起来。莫娜认为这样会造成水淹全镇，他们为了阻止他和海神展开恶斗，终于赢得了胜利。而葛布拉塔先生也因为污染和不安全施工被叫停了。

今年的飞虫季节来得特别早，而且飞虫也特别多，扰乱了大家的生活。莫娜和莉莉、查理调查的结果是这些飞虫都来自老房子后面的沼泽地，而控制飞虫的人就是老房子里的无线电老人麦考林。通过向豪警官和布莱森太太的情况了解，他们准备了一些对付飞虫的东西，在老房子前面与飞虫展开战斗。莫娜使用了爸爸赞助的老无线电，终于摆脱了飞虫的纠缠，飞虫转而攻击老人麦考林，莫娜巧妙的用风扇赶走了飞虫。豪警官和布莱森太太也劝说市长填平了产生过多飞虫的沼泽地。皆大欢喜至于，懂事的莫娜还给麦考林和布莱森太太用无线电牵线，让他们开始约会。

高高老师的姐姐罗贝塔来参观学校，并且还给生病的高高老师代课。因为举止怪异，当电脑程序员的罗贝塔被他们看成是机器人，而且她是被校董会派来做调查的机器人老师，如果让她成功，所有的老师都会被机器人代替，学生们的噩梦就开始了。莫娜小魔女、巨人公主和激光飞侠请来了莫娜的机器人保姆做高参，想尽了各种办法，都无法打败机器人罗贝塔。最后是高高老师的出现给大家解了围，原来战胜机器人的唯一办法就是人类的感情，因为电脑无法计算。

高高老师布置大家写作文，题材任意，让大家随便发挥想象力。回家的路上，三人碰到了免费的激光闹鬼屋，决定进去一探。没想到老板发给的魔术棒不管用，大家对付不了里面的激光怪兽，反而被里面的黑暗巫师施了魔法。从此他们的一想到什么，什么就会变成现实。可是为了完成作业，他们又不得不发挥想象力。两难之下，他们决定化身莫娜小魔女、巨人公主和激光飞侠，偷到了管用的魔术棒，重新潜入到闹鬼屋里去找黑暗巫师。强大的黑暗巫师什么都不怕，大家危在旦夕，这时莫娜想起了高高老师的话，提醒大家什么都不要想，让黑暗巫师无计可施，最后只好消亡了。

查理的叔叔格里要主办一次保龄球比赛，参赛的有豪警官和著名的保龄球手罗林。这两个人很多年前就是对手，豪警官经常会占上风。但由于一次机械故障，罗林赢了比赛，从此两人的人生也发生了变化。莫娜发现罗林有些不对劲的地方，他并不是靠自己的实力获胜。伙伴们一起找出真相，原来罗林养了几个保龄球小鬼，靠他们捣乱他才能每次赢得比赛。莫娜和朋友用智慧制服了小鬼，豪警官打败了罗林并发现了几年前的事实。

马戏团的空中飞人默里由于一次意外，不敢再表演，而且老觉得团里有鬼。马戏团不得不改成了马戏学校。莫娜和朋友们报名参加了学习，但他们最喜欢的空中飞人却没有人教。他们觉得很奇怪，开始查找真相。原来是因为马戏团的前任空中飞人的鬼魂马休斯，他要找到默里弄丢的幸运符。莫娜帮助默里找到了幸运符，他又恢复了勇气，并教孩子们学习空中飞人。 马休斯完成了自己的心愿，离开了马戏团。

查理为了挣钱购买漫画书，受雇给3个孩子当保姆，但他发现这3个孩子与众不同，也意外地挽救了地球。

查理为完成老师的作业，借用了博物馆的展品，结果却招来了专爱恶作剧的小狼神。3个小伙伴机智地与小狼神战斗，最终取得了胜利。