清晨，新疆叶河县亚瓦克乡央塔克村村长牙合甫的门上插了一把带纸条的匕首，这是暴力恐怖组织对牙合甫的威胁。当天晚上牙合甫和他的儿子就死在了恐怖分子的砍刀之下。这就是震惊新疆的“8•21”案件。叶河县公安部门迅速展开调查活动，了解到牙合甫是一个捍卫民族团结的基层干部，曾经和恐怖组织头目、在逃犯阿巴斯有过过节，而且正准备处理进行非法宗教活动的事情。牙合甫被害前一天，刚从县里开完综合治理先进表彰大会回来，并为儿子举办了婚礼。阿巴斯团伙肆无忌惮，此时正在密谋制造武器，酝酿下一步的恐怖活动。

阿巴斯暴力恐怖团伙在公安部门调查牙合甫被害案件的过程中，继续作案，密谋杀害亚瓦克乡派出所民警，却错杀了乡通讯员，制造了“9•11” 案件。在调查摸排的过程中，公安干警了解到有些小学生不去学校上学，却到地下讲经点去学习。其中就有阿巴斯的情妇热比娅的儿子多里坤。证据证明亚瓦克乡铁匠铁木耳有重大嫌疑，铁匠铺打的刀与杀死牙合甫的刀是一样的，而且铁匠铺就是一个地下兵工厂，他们生产的左轮手枪可能就是“9•11”案件的作案工具。另外，铁木耳还伙同他人从一个制造火药的人处购买了大量的火药。

阿巴斯团伙一方面蓄谋更大规模的恐怖活动，一方面继续开办地下讲经点。被迫学经的孩子们在阴暗潮湿的环境里忍受着非人的待遇被打伤和制残的程度触目惊心。入夜，亚瓦克乡派出所火光四起，爆炸声声，阿巴斯率领恐怖组织成员对值班的公安民警发动了突然袭击，所长塔西带伤奋起还击------这就是震动全疆的“9•17”案件。调查发现，原来乡派出所治安员肉孜•阿塔吾拉是阿巴斯团伙打入公安的卧底，就是他提供的情报使使阿巴斯的袭警的疯狂计划得以实现，他禁不住公安民警的强大攻势，终于全盘交代了自己的罪行。

与卡日阿吉一起制造“9•11”枪杀案的马木提被抓获，打开了案件的突破口。南四县侦破指挥部领导小组会议召开，部署了大规模的搜捕行动，爱国宗教人士依明阿吉痛斥阿巴斯的罪行，号召人民协助公安共同对付阿巴斯。武警与公安干警协同作战，共同搜捕阿巴斯。他们在阿巴斯的情妇热比娅家中发现了地下藏身点，但狡猾的阿巴斯早已逃之夭夭。但早在布控之的卡日阿吉在乌鲁木齐被逮捕。

公安干警在沙漠中对恐怖分子进行二十四小时布控，恐怖集团成员“舅舅”卡日终于出现了，他赶着毛驴车，车上麻布口袋里藏着热比娅的儿子多里坤。狡猾的卡日躲过了干警的追捕，但干警从多里坤口中得到了有价值的线索。斗争更加艰险，搜捕行动中干警斯马依遇害。在叶河县和耶城县出现了一个神秘的女人，引起了巡逻人员的注意。这个女人正是热比娅。

阿巴斯团伙艰难地走出了芦苇滩，走到卡日的一个远亲家中，亲戚认出了阿巴斯，连夜向公安报告。他们残忍地杀害了亲戚家一家三口，继续逃窜。热比娅目睹他们的暴行，终于看清了他们的真实面目，不愿与他们同行。大漠中，阿巴斯一伙的行踪终于被发现了，少数民族边境巡逻队以及武警、公安干警终于包围了这伙暴徒，送他们走上了绝路。但是卡日中途逃脱了。反恐斗争取得了重大胜利，自治区记者采访了英雄的干警塔西和他的家人，揪心的回忆使人唏嘘不已。