山林间，一架直升机带着一团火球轰然坠地，顿时一片浓烟，烟雾散去，坠地的机舱里踉踉跄跄，钻出一个孙悟空，刚走出机舱，守候在附近的蜘蛛精用火箭筒发射击中，悟空倒地，蛛精将他扛在肩上，随后起来的林娜小姐和八戒在机舱里只看到昏倒的独眼龙和二胡，都不见猴哥，这时警察赶到。要传讯八戒等人，于是把他们带走……

蜘蛛精将悟空带到一座洋房内，把他锁进保险箱内，并在周围安置了一大堆地雷，才放心离去。法庭内，唐僧正在接受审理，并让八戒，林娜作证人，一场破坏空中秩序与破坏歹徒劫机阴谋的激烈争辩展开，这时又把另二目击证人独眼龙和二胡传来，但他们已被炸成痴呆状，无法证明什么。法院以唐僧遭陷害证据不足，限期十天之内赔款一千万……作为判决，并以密码箱作为抵押。而关在保险箱内的悟空在箱内拼命挣扎，但却无法挣脱，最后保险箱翻倒，地雷爆炸，保险箱炸飞，掉落在摩托城里正在绘制广告的工作人员黄毛身旁，箱子炸裂，悟空从缝中跳出。而唐僧八戒他们为找到悟空，决定在各大报刊登寻人启事，城市里许多儿童为解救唐僧纷纷组织募捐活动。他们将募捐来的钱献给唐僧爷爷，谁知蛛精做了手脚，将钱变成小粪蛋，大家都非常吃惊……，蛛精为了获得唐僧等人的行踪，他通过窃听器来窃听，结果被悟空发现。

摩托城正在举行“巴戈摩托大赛”，悟空为得到冠军的一千万奖金，正在大赛上驾驰着那辆白马摩托，经过了激烈的争夺，战胜了各种世界最先进的喷气摩托，获得了冠军并得到一千万奖金，正在高兴之时，老K带了警方来，说悟空服用了兴奋剂，公布比赛成绩无效，悟空意识到这是蛛精在捣鬼，于是设法将附在巴戈老板身上的蛛精驱逐出去，唐僧师徒三人甩开林娜离开旅馆又开始了新的旅程。

记者林娜小姐在八戒的暗中留条指引下，找到了唐僧等人，但脚底已打满了血泡，悟空帮助她包扎好，并让其休息。而密林深处的蜘蛛精在古堡式的洋房里搞研究，研究使其具有抗药力。

为了唐僧有一双神奇的僧鞋，使一个城市都在流行，人人穿着仿制的僧鞋。旅馆的老板也为此动了心。为了得到真正的的僧鞋，他偷偷地换掉了唐僧的鞋。蜘蛛精也想以假换真。可是真僧鞋给老板穿上就无法脱下。唐僧穿了鞋匠特制的假僧鞋后，一下子就磨破了，发现被偷换了。这时蜘蛛精发现也上当了。于是发射神经毒气弹，把唐僧师徒及林娜都击晕了，并将悟空踢进水中。蜘蛛精窃得了“珍宝”的密码箱逃逸了。

悟空泡在水中，毒气消失。游到岸上取出解毒丸，将唐僧等人一一救醒。发现密码箱被窃。而蜘蛛精明白，那双神奇的僧鞋，已经让旅馆老板换走，就冲到旅馆找到其中一只真鞋穿上。发现鞋子具有神奇的力量，可让整个楼倒塌。

旅馆老板比尔为了那穿上又脱不下的僧鞋，到医院让医生用凿子敲打，仍无法脱下，只能去求助唐僧。回到旅馆，发现一片废墟，感到这是贪心的报应。

悟空为了寻回密码箱，潜入蜘蛛精的洞穴，用“敌万虫”对付蜘蛛精，发现无用。原来蜘蛛精已具有抗药力。于是悟空挥舞金箍棒，却打不过穿着神奇僧鞋的蛛精。

蛛精企图用僧鞋的力量去开密码箱，不料一脚踢飞。击中空中迎面飞来的八戒，八戒意外得到，蛛精赶到，将八戒击倒，并关在牢中。

而另一只僧鞋从老板比尔脚下取回，让悟空穿上，悟空与蛛精在林中进行了一场旋风般的搏斗。最后被蛛精擒获，也关在牢中。唐僧，林娜也被抓来。

悟空施法得以解脱，并钻进蛛精的僧鞋中，让其难忍，蛛精只得求饶，并趁机逃脱。

戈壁滩，烈日炎炎，黄沙漫漫，一张通缉令贴在六指镇上，通缉六指镇赫赫有名的大盗。贼窝里，小贼们人人都是六指，贼王正向小贼们传授偷技，——“六指偷天术” 贼窝楼顶，怪鸟用望远镜窥视远方，发现戈壁滩上出现蜘蛛精的装甲车以及唐僧一行两路人马。贼王立即仰首左右，一路辛苦的唐僧师徒正要寻找歇息之地，发现前方有六指镇，于是向前进发。住进旅馆。蛛精的装甲车驰向六指镇，小贼们按指示阻拦，他们掀翻了装甲车，带蛛精，独眼龙，二胡见贼王。蛛精向贼王提供唐僧的情报及密码箱的消息，于是他们勾结起来，派小贼潜入小旅馆，给唐僧悟空等人的饮食中施加“神经毒素剂”。特别给悟空增加“电子神经钳”以便在偷取密码箱时畅通无阻。

因此，小贼在潜入偷箱时，被悟空发现，正好在追打至关键时刻，“神经钳”发挥作用，制服了悟空，而蛛精在外面也向小旅馆发射激光网，旅馆失火，老板慌忙逃窜，这时悟空被烟熏得一阵咳嗽，睁开双眼，发现出事，只想到如何解救师博，但寻不着，只得先逃出火网，而蛛精与贼王正在迫害和逼供唐僧等人，这时悟空赶来，与贼王厮杀起来，蛛精趁机想用石头砸死唐僧，偷走密码箱。悟空察觉，救出唐僧，但密码箱被蛛精所盗，并驾驶装甲车，悟空立即冲将出去。

在警方配合下，一场现代化的对攻战，最后蛛精等束手就擒。而悟空却因为“电子神经钳”的威力，受伤倒地，后来在记者林娜的帮助下，被解救出来。唐僧师徒四人又向新的地方迈进。

大漠孤烟，长河落日，唐僧师徒一行在艰苦奋行进，沙丘中出现提着望远镜的怪鸟，他自称是改邪归正的好鸟。这次是来做导游的，带他们到一个风景如画的美丽山岩去，那里奇花异草，树木参天，那里的溪水，喝上一口，人都会长寿延年，他们听后好生高兴，悟空纵身飞出，在绿毛谷鸟瞰，发现虽然景色诱人，但有股妖气，记者林娜也在可视通讯器中被告知这里有好多批游客失踪的信息。然而师博唐僧还是执意要去，于是一行人进发，留八戒在谷口等候林娜……谷口突然出现蛛精驾驶着摩托，他给八戒一阵臭打后扬尘而去，八戒气极。绿毛谷的绿毛王得悉将有一个藏有无穷宝藏的密码箱到来的消息，顿时来劲，命令下属绿色武士夺箱子，并要把这几个和尚也变成绿毛族。

悟空带领师博来到绿水潺潺，青山苍苍的小溪旁，悟空变作小鲤鱼，跳入潭中，发现眼露绿光、浑身绿毛的武士，于是发生了一场恶战，蛛精驾驶摩托，伪装是帮助唐僧，向绿毛武士发射怪物，然而在白马变摩托时，却把唐僧的袈裟和密码箱弄丢，被蛛精抢走了，另一边悟空也在使法制止绿毛怪，绿毛王亲自出阵，将唐僧和孙悟空抓走，关在绿毛笼内，被绿毛怪逮住的蛛精也被关在里面，为了能逃出牢笼，他们决定大敌当前联手，最后被逃脱。这时车尘滚滚，电视采访车和警车赶来，知道唐僧等遇到了情况。他们缓缓驶来，突然绿毛武士出现，飞起绿毛，卷住行进中的汽车……。在绿毛谷底，绿毛王等正在庆贺时刻，八戒变成绿毛女混在其中，乘他们酩酊大醉时，偷走了密码箱，但却未逃脱，被绿毛怪发现并逮住，关到笼子里去，谁知林娜也关在这笼子里，他俩被抓去吊在树上，准备行刑，这时悟空、蛛精、警察赶到，他们施法制服了绿毛王等……突然所有绿毛人都在捂脸痛哭，原来他们都是无辜的旅游客和警察，他们被手提骷髅杖的女巫，施展了魔法，变成了绿毛怪，好要让人类变成邪恶，互相残杀。悟空知道真相后施法，让天上降下雷阵雨，洗净大地和人们，雨过天晴，一切又恢复了原样，人们欢呼，雀跃。

蜘蛛精率独眼盗，二胡乘直升机飞抵机器城，被滴滴博士发现并镇住。此时，唐僧师徒三人在怪鸟的指引下，也到达这座由电脑控制的全面自动化，信息化的城市——机器城，他们为了避免被蛛精发觉，乔装打扮后向城里进发。机器城里，蜘蛛精要挟滴滴博士用现代科技方法打开“神秘的”密码箱—其实是假箱—。然而当打开一看，所有人都大为震惊。原来“悟空”藏在箱子里，并飞走了。蛛精气极，变为小蜘蛛钻进博士腹中，从而控制博士所为。

再说，正饿得慌的八戒在机器城的管道里的自动售货口，大吃大喝，也把超强的饮料喝下。使他变得力大无比。谁知他们违反机器城的规定，无款取货，警铃大发，机器手臂袭他们，他们纷纷逃走，却被各个管壁困住。悟空知道一定是蜘蛛精捣的鬼。悟空用金箍棒把闸门打的粉碎，但修复程序一启动又立即恢复。悟空灵机一动，化作苍蝇飞入怪鸟肚中，逃过电子眼的监视。

正在蛛精得意之时，控制室门打开，宇宙一号战士进入，并将蛛精击倒，蛛精说时迟那时快，飞快地扑向滴滴博士，劫持了博士，要他启动自毁程序，然而并没成功，因为宇宙一号是悟空所变，后来终于将蛛精征服，把密码箱收回，胜利离去开始新的征程。