奔月来找圣母对圣母说出心中的疑问：圣母是否和宝玉有着怎样的渊源。圣母沉思不答，表示事情没有这么简单。奔月对圣母的遭遇深表同情，两人的感情增进。竹林中，宝玉练剑发泄胸中郁闷。金祖扬走来送给宝玉一把宝剑，剑上刻着：宝玉剑。金祖扬认为宝玉已经有了大侠的武功，现在需要的是大侠的气度和胸襟，应该抛开儿女情长。宝玉向珠儿敞开心扉，希望照顾珠儿一生。珠儿拒绝表示自己另有所爱，但突然间她竟然无法想起大藏的名字。隔天，宝玉来给珠儿送药时，发现屋里空无一人，桌子上留着两行字：天涯长恨勿相问，孤身一人赴泉台。珠儿离开竹林，情蛊再度发作，昏迷在庵堂前，被惠觉师太给救了。惠觉师太为人傻里傻气，有点疯疯癫癫，但其实大智若愚。众人庆祝王巅当上武林盟主，王巅表示要号令武林人士剿灭魔教。此时，外面来报说火魔神带领手下求见。众人正在疑惑时，火魔神进来表示他是来归顺的。紫衣侯赶到，发现宝玉和珠儿并不在。紫衣侯终于爆发对王巅的鄙视，怒斥王巅在自己女儿身上下蛊。王巅极力狡辩，表示紫衣侯没有真凭实据，还指责紫衣侯与白水宫是一伙的。两人大打出手……紫衣侯怀疑王巅有更大的阴谋，但现在最重要的是前往白水宫找奔月，将她带出险境。白三空知道火魔神归顺后，觉得攻打白水宫一事，水到渠成。白三空提醒王巅让火魔神打头阵，同时也要消耗掉武当和少林的实力。王巅反对白三空的建议，觉得现在武林，少林不足为惧，没必要赶尽杀绝……紫衣候带着春影和夏禅到白水宫给白水圣母通报消息。圣母得知火魔神叛变要带王巅来攻打白水宫的消息感到气愤万分。大战之前奔月拒绝跟紫衣候离开白水宫，父女二人发生激烈争执。为保护奔月，紫衣候只能留在白水宫。他劝圣母暂避风头，遭到圣母痛斥。

王巅纠集所有武林门派的残余势力来势汹汹，白水圣母布下暗道机关，双方展开惨烈厮杀，死伤惨重，激战当中春影夏禅为了保护奔月性命，双双被刺死。白水宫在紫衣候的助阵下，一度占居上风。关键时刻白三空按照约定在暗处释放“七煞琴音”，霎时间天摇地动，白水宫寡不敌众，眼看就要败阵，圣母无奈启动暗道，大藏，木郎和史都将军被隔在巨石之外。身负重伤的大藏被李子原追杀到河边走投无路，无奈之中只好跳河。白水圣母根据古老传说中的偏方，带领仅剩的几人从密室进入沉香谷。王巅设法打开密室的门口，却因林中有毒雾气的阻挡无法进入沉香谷。他只好一边兵围沉香谷，一边派人去寻找进入树林的办法。紫衣候在沉香谷中埋葬了春影和夏禅，失去了两位相依为命的亲人，紫衣候痛苦万分。他指责白水圣母只图一时虚荣，不计代价，导致白水宫损失惨重。白水圣母受伤之后，功力大不如前。她抓紧一切时间在沉香谷中打坐疗伤。面对紫衣候的指责，她的情绪起伏不定，矛盾万分。紫衣候对白艳烛的念念不忘，又让她在心底又有种莫名的感动。王巅进不了沉香谷，整日一筹莫展，正在犹豫准备退兵之计。胡不愁从药农那里打听到了口含斑斓叶可以躲避沉香谷毒气的秘方，王巅大喜过望。奔月终于意识到自己的意气用事害死了两位姐姐，她追悔莫及。看到了紫衣候的痛苦，奔月也意识到了紫衣候是多么关心自己，她下定决心从此好好照顾紫衣候。父女二人彼此有了更深的了解。清晨，王巅终于突破了毒雾的防线，冲入了沉香谷。睡梦中惊醒的四人被团团围住。紫衣侯，白水圣母众人在沉香谷中受到王巅等人攻击。紫衣侯气愤白水圣母为了白水宫的荣誉和王巅硬拼，结果不但自己全军覆没，而且让春影，夏婵也丢了性命，更让奔月和脱尘生死未卜。两人发生激烈争吵，白水圣母最终解开面具，紫衣侯认出眼前的人竟然是白艳烛……木郎匆匆来到小镇神秘接头，在青萍山庄，木郎意外发现原来白三空就是他要见的人。白三空更惊讶木郎身挂纯金要牌。白三空想打听木郎身世，被木郎轻描淡写搪塞开。木郎表示，朝廷希望将旷世财宝之城的秘密---罗雅古城泄漏到江湖上，希望所有江湖上的成名英雄都能被吸引到川南的密林中，从而一网打尽。木郎希望白三空将这个消息透露给王巅。木郎在离开青萍山庄密室的时候竟然巧遇宝玉。宝玉觉得木郎出现在青萍山庄十分奇怪，对他产生怀疑。木郎三言两语以谎言蒙混。木郎以为宝玉相信了他的谎言，其实，他的言语中的漏洞已经让宝玉识破。宝玉不动声色表示希望跟着木郎见见世面。木郎说出要到京城去。宝玉跟着前往。京城外，木郎以为将宝玉灌醉……

沉香谷中，身受重伤的白艳烛在紫衣侯的照顾下，躲避着王巅等人的追捕。王巅发现因为长期在沉香谷中驻扎，搜索，已经引起各路豪杰的不满。各门各派间的摩擦越来越频繁。最终，王巅只好决定留下火魔神继续搜索沉香谷。他带着众人离开，前往自己的轩辕山庄庆功。火魔神对这样的安排虽然不满，却也只能忍气吞声。火魔神的部下个个不高兴。最后火魔神私下决定：呆上一段时间就走人，也不管搜到没搜到紫衣侯等人。紫衣侯，白艳烛趁着对方守备松懈，偷偷逃出了沉香谷。京城外，宝玉追上木郎神君将一切谎言揭露。木郎神君不动声色，暗暗向紧随其后的两个锦衣卫打眼色。三个人欲置宝玉于死地！追踪木郎的宝玉在乡间被两位大内侍卫从后包围，木郎暗自得意以为可以在此结果宝玉性命，没料想到底宝玉技高一筹，不仅躲过一劫，还打伤木郎。趁侍卫纠缠宝玉之机，木郎落荒而逃。宝玉杀掉侍卫后继续一路追踪。木郎直奔距离沉香谷不远的平凉千户营，面见千户长陈恬。宝玉眼见他消失在军营里。木郎从陈恬那里了解到白水宫大战的结果，并且告诉陈恬自己的身份已经暴露给宝玉，他要杀掉宝玉灭口。鉴于宝玉武艺高强，木郎命令陈恬调集强弩营兵力，他要做好圈套等待追踪而至的宝玉上钩。入夜，宝玉潜入军营深入木郎住处，却被埋伏在外的强弩营围个正着。一时间万箭齐发，宝玉虽然冲破围困却手臂中箭。危难时刻他拿出神木令牌，木郎为夺令牌丧失了抓住宝玉的时机。两人打斗间，宝玉毁了令牌。宝玉手臂受伤无力，他的宝剑被打落在地。宝玉为躲避木郎的追杀走投无路冲进了大漠。木郎还要再追却被陈恬及众属下阻拦。众人知道沙漠危险，没有足够的水和干粮没有人敢进沙漠。陈恬劝告木郎此季节常会起沙暴，更不可贸然行事，而误入大漠的宝玉也只有死路一条。木郎只得悻悻作罢。艰难跋涉的宝玉终于在沙漠中昏倒。苏醒后的宝玉惊喜地发现自己被脱尘所救。原来脱尘和奔月为了躲避武当道人的追踪，无奈之际进入了沙漠。脱尘讲出她和奔月在一起，只是奔月目前仍不想见他。宝玉心头一阵酸楚。脱尘讲述了白水宫大战的惨烈经过，春影夏婵史都将军纷纷战死，大藏，木郎被冲散下落不明，其余的人被迫退入沉香谷，现在也已失散，只剩奔月和脱尘两人。幸好来自大宛国的脱尘之前有在沙漠生活的经历，两人逃入沙漠，找到一块小小绿洲才能撑到现在。史都的信鸽让脱尘睹物思人黯然神伤。宝玉犹豫片刻，终于向脱尘讲出木郎的真实身份，脱尘完全不肯相信，气愤离开。奔月、宝玉，两人见面，思绪万千。奔月表示自己过去无法和宝玉在一起是因为天意，让宝玉认命。宝玉说在白云观是要真心实意与奔月成亲，他现在仍不明白为什么会发生那么不可思议的事情。奔月告诉宝玉，她隐约猜到一切都可能是圣母无心所为，请他接受已经与珠儿成亲的现实并且原谅圣母。宝玉义愤难当！脱尘凭直觉认为此处离沙漠的边缘已经不远，大家应该齐心合力走出大漠再作打算。绝望的宝玉得知自己无法与奔月在一起之后，留下口信一个人离开。心中同样无法割舍宝玉的奔月不顾一切的去追赶他，脱尘只好随同前往。两人终于在沙暴来袭之前找到宝玉。面对大漠的滚滚黄沙，三人生死未卜……

集市上，大藏满脸病容，摇摇晃晃走来，路人侧目。数名乞丐盯上大藏手上长光，忽起歹念围攻大藏。大藏抱住长光与乞丐周旋，大藏遇袭，危急间，珠儿出手相救。大藏恍惚间看见珠儿，震惊昏倒。昏迷中的大藏一直喊着珠儿的名字。珠儿在旁伺候。珠儿奇怪大藏为何一直叫着自己名字。惠觉亦无法解释，还吩咐珠儿说，人是你救的所以由你负责照顾。大藏昏迷多日，珠儿一直细心照顾。珠儿看着昏迷的大藏自言自语，仿佛与老朋友交谈一般，不知不觉睡着。大藏微微皱眉，朦胧中仿佛有了反应。隔天，惠觉师太在认真念经。大藏出现在门口，询问珠儿在哪里。大藏赶到天井，审视珠儿。珠儿回头看见大藏，一副完全不认识大藏的样子。失魂落魄的大藏问惠觉关于珠儿的遭遇。惠觉告诉大藏救珠儿的经过，只知道珠儿为除蛊毒喝了一种失去记忆的药。惠觉巧妙的开导大藏，要他对此事释怀，接受珠儿的遭遇亦可能对她更好。惠觉探听珠儿是否想恢复记忆，是否想记起大藏。珠儿觉得现在自己很开心。她不觉得记得大藏有什么重要的。大藏经过一番思考，决定仍然要珠儿回复记忆。虽然此刻珠儿的生活无忧无虑，但珠儿恢复记忆后，大藏仍有信心能给她幸福。迷失在大漠里的宝玉、脱尘和奔月被一群官兵发现，宝玉谎称是驼队扛货的，驼队遇上沙暴失散了。士兵将领假意给他们指路，宝玉等暴露了身份，两帮人大打出手，宝玉他们杀死了所有的士兵。宝玉一口咬定是木郎所为，脱尘极力争辩，两人起争执。三人到城门口，发现宝玉被通缉：宝玉连续几天之内血洗了潼关“镇西镖局”杀死一百多人，同时还在豫南“九莲塘”将九位女堂主杀死，连带手下一百多人也死在宝玉剑下。宝玉等震惊不已骑马离开，却被旁边的两位武林人士认出，急追而下。武林人士一口咬定是宝玉所为，根本不接受宝玉的解释。宝玉看自己无法申辩，只好和两人动手，最终点了两人的穴道。宝玉等以为已经收服了两人，怎知一人忽然射出暗器。奔月在危难时刻救了宝玉的性命。奔月希望能够搞清楚官府四处张贴告示缉拿宝玉到底是怎么一回事。宝玉解释一切都是木郎在陷害他，脱尘不相信木郎是坏人，和宝玉发生激烈争执。宝玉将陈恬抓来，陈恬坦白是有一个锦衣卫的重要人物前来，要求围堵宝玉。陈恬和宝玉讲的一模一样。脱尘依旧半信半疑，内心世界非常痛苦。宝玉晚上睡不着，在院中散步时遇上奔月。奔月，宝玉慨叹都长大了，不知不觉回忆以前的事情，两人开心不已。奔月说出，自己希望能够离开宝玉，却又担心宝玉一路上会中别人的陷阱，对宝玉的关心流露出来，宝玉感动。奔月深深知道在他们之间已经有了珠儿这个阻隔。白三空要王巅查清情况帮助宝玉脱困，王巅表示自己爱莫能助。白三空发现王巅已经不听话，再度出言威胁，却奈何王巅不得。白三空只好求见木郎说出现在王巅已经不受控制，并请木郎网开一面放过宝玉。木郎表示，宝玉知道他的底细，不这样做的话可能会坏了全局大事。白三空一筹莫展。木郎安慰白三空他只是要让宝玉失去江湖信誉，不会真正杀他。

在茶寮歇脚的宝玉、奔月和脱尘被化装过的锦衣卫逮个正着，奔月和宝玉被关进官府地牢。木郎向脱尘摊牌了身份，脱尘生气木郎杀了史都，气愤夺下木郎的鞭子，狂抽木郎，木郎一动不动站着，脱尘伤心欲绝。木郎来见宝玉，表明自己的目的，宝玉怒斥木郎是朝廷鹰犬，木郎只好悻悻离开。木郎只得利用白三空收编宝玉，白三空犹豫不决。为了重新得到脱尘的心，木郎把脱尘休息的房间布置得和大宛国一模一样，还不惜代价弄回了汗血宝马。面对脱尘的不肯原谅，木郎讲出他唯一违抗严嵩的命令就是没有杀脱尘，木郎坦诚他对脱尘的感情是真的，对大藏的结拜情谊也是真的。脱尘痛恨木郎对她的欺骗，无法原谅他，但她也深深明白自己对木郎的爱同样刻骨铭心，自己没办法逃脱木郎的控制。地牢中的宝玉和奔月知道明天就要被砍头，宝玉说出自己的种种遗憾，宝玉恨自己没能够给自己的外公报仇。奔月也坦白依旧爱着宝玉，可是却无法再回到宝玉身边，能够共赴黄泉，让两人获得些许安慰。白三空来见宝玉，奔月。宝玉极度震惊并且对白三空的欺骗非常愤怒。白三空讲出了自己的苦衷，奔月、宝玉听到白三空的话，目瞪口呆。白三空明确表示，自己的目的就是为了劝宝玉归顺朝廷，否则就会死路一条，宝玉宁死不从。木郎告知白三空，如果宝玉不答应，他是不可能活着走出地牢的。白三空发怒，若宝玉有三长两短，一定要木郎陪葬。宝玉和奔月带着镣铐与脱尘见面。脱尘向宝玉道歉，宝玉劝脱尘有机会赶快离开。脱尘痛苦摇头。脱尘讲出，自己对木郎的感情是真的。宝玉强调人不能没有大义。此时，木郎哈哈大笑着走了进来说，如果成为一个死人，你拿什么讲大义？此时，宝玉突然出手，一掌重重打在木郎背后。木郎应声倒地。宝玉劝脱尘快走。脱尘跑出去几步，突然停步，看着地上的木郎，终于还是回来将木郎抱起离开。脱尘紧张木郎的伤势。突然，脱尘发现木郎穿了软甲，一直在欺骗脱尘。脱尘转身要走。木郎急忙从床上起来拉住脱尘，一把撕掉软甲，露出伤痕累累的上身告知脱尘，天底下只有一个人能伤得了我，那个人是你！宝玉和奔月在地牢里患难见真情，未免奔月被牵连，宝玉终于答应加入锦衣卫。木郎吩咐手下在宝玉手臂上烙下一个飞鱼烙印。宝玉和奔月终能离开地牢，宝玉愤恨之极，拔出宝剑要断臂被奔月死死抱住。两人心中郁闷，决定找紫衣侯了解宝玉的生事。紫衣候照顾着白艳烛。紫衣候不能理解为什么为一个中原武林所不容的东洋人要付出这么大的代价？白艳烛只是不答。

躲在远处的天残双煞看到紫衣候离开，悄悄进入小屋，正当李子原对圣母施暴，紫衣侯忽然出现。双煞，李子原和紫衣候杀在一起。经过激战，紫衣候终于将双煞砍死，李子原受重伤而逃。可是，紫衣候也受了伤。紫衣候带着白艳烛匆忙赶路，山道上迎面站王巅，紫衣候迎上前来和王巅战在一起，紫衣候已经受伤不轻，再加上赤霄宝剑的威力，王巅已经是游刃有余能将紫衣候控制住。王巅突然发出一掌，将紫衣候打飞。紫衣候挣扎着无法站起。王巅一步步向蒙着白纱，站立不动的白艳烛走去。王巅小心谨慎抓住白纱掀起，就要挥剑砍下，白艳烛用计打退王巅，但自己也用尽了全部气血。白艳烛气若游丝，以为自己命不久已，她终于向紫衣候和盘托出自己的经历以及两个孩子的身世。大藏竟然是霍飞腾的儿子令紫衣候大为震惊，但面对自己日思夜想的爱人，紫衣候再度真情流露，他决心不惜代价救活白艳烛性命。被迫加入锦衣卫的宝玉对未来已经绝望，打算自暴自弃，在奔月的开导下，他看到了新的方向。紫衣候为了给白艳烛疗伤四处到药铺偷窃名贵的草药，成了远近闻名的药贼。一日，紫衣候又用计谋盗走了一棵长白老参但险些被决心为民除害的宝玉和奔月撞到。白艳烛生命垂危，紫衣候知道有一株千年灵芝可以救白艳烛的命，他决心一定要把灵芝拿到手。紫衣候在盗取灵芝的过程中被宝玉和奔月抓到，三人终于相认。白艳烛感谢宝玉救了自己的性命。为了不让宝玉与紫衣候结怨，白艳烛选择不告诉宝玉真相的做法，紫衣候认为白艳烛太糊涂。宝玉求奔月千万不要把他们被抓的事情告诉紫衣候和白水圣母。因为，他不想让任何人知道自己身上有一个耻辱的烙印，更不想让别人知道自己尊敬的外公在为朝廷卖命。奔月则好心的让宝玉找紫衣候询问身世。早有准备的紫衣候坦然讲出一切，说出是自己当时误杀了宝玉的父亲。宝玉不敢相信这样的事实，痛苦万状。宝玉经历着无限痛苦的心灵挣扎，面临着崩溃，经过了痛苦的思考，他决定割舍掉现实中的情感为父亲报仇。郊外的旷野中宝玉月紫衣候决斗。两人一场激战，风云变色。紫衣候放弃了抵抗被打倒在地。紫衣候缓缓闭上了眼睛，宝玉举起了剑，但剑没有落下。奔月劝告宝玉面对一切。宝玉感慨为何自己又要面对上辈人留下的不幸。他表示自己钦佩紫衣侯是一个大侠，所以不忍心杀他。但是，他也不想再见到紫衣侯。