“女鬼”叫庄美美，他的丈夫叫夏文亭，在一家保密单位工作，似乎这是一个大案子。 经过调查发现那十二个照片上的男人是白敬斋留下的特务组织成员，这个组织叫梅花组织。 肖克他们找到了夏文亭，夏文亭对妻子的死很悲伤，虽然很爱庄美美，但却并不了解她。夏文亭告诉他自己是工程师，父亲是大学教授，他和父亲是解放的时候国外回来参加新中国建设的，参加了雷达站的设计。这次设计对外严格保密，地方公安部门一概不知。庄美美和夏文亭闪电结婚嫁入夏家，她的动机不一定是爱情。但是他们父子是否被发展成特务了呢？不得而知。于是“梅花案件”特别专案小级成立了，公安局决定监视夏家父子。夏老先生十分通情达理非常配合公安人员的监视工作，而夏文亭非常不满与公安战士大吵大闹。 馆长在档案馆找了间空房间作为龙飞和南云的结婚新房。他们开始准备操办婚姻大事。 肖克得知龙飞和南云结婚的事，心里有点惆怅。 龙飞和南云坐车买结婚物品的时候突然听到售票员报站名“清泥洼路到了”，这句话点醒了龙飞，他想起了那张自燃的纸条上的“清泥洼路”字样，于是他给清泥洼路上的每一位住户都发了一封信。 火葬厂方面传来了坏消息，说庄美美的尸体没经过同意就被火化处理了。肖克急了，赶到火葬厂火化工却说人已经被烧了。但是医学院解剖室却有人报案说多了一具女尸。 肖克找到医学院解剖室的教师向学一，吃惊地发现那具多出来的女尸竟然就是庄美美！

肖克对庄美美的尸体来历进行了细致调查，尸体是怎么到了解剖室的？疑点集中到了向学一身上，为什么这个尸体被运来运去，难道尸体里有什么有价值的东西？突然有人报告向学一去了火葬厂，肖克决定加强对向学一和解剖室的监控。 龙飞不断地收到清泥洼路的退信，同事对他的行踪感到奇怪。 叶蕾毕业了分配到肖克的身边工作。第一次任务就是跟肖克一起到医学院查看庄美美的尸体，可是她只看了一眼弹痕累累的尸体就被吓的晕了过去。她心里十分羞愧，父亲却鼓励她给她勇气和信心。 龙飞总是早出晚归，一心一意准备结婚的南云几次和他相约却扑了空，心里很不高兴，隐隐约约地觉得他们两人之间出了问题，龙飞安慰她并兴致勃勃地计划婚礼的内容。 在公共汽车上，龙飞邂逅了护士梅香。龙飞去找她看病，梅香护士对他百般暧昧。 因为上次的晕倒，叶蕾很不好意思，于是她自报奋勇地去医学院解剖室蹲点，监视向学一。但她心里却打起了鼓。晚上实在害怕，于是找龙飞帮忙陪她壮胆，龙飞答应了。

在医学院解剖室里龙飞给叶蕾讲起了“背靠背”的恐怖故事，正在两人毛骨悚然的时候，黑乎乎的医学院的楼道里摸进来了个人影，叶蕾被吓的逃离医学院。 只剩下龙飞一个人，那个人从解剖室里抱着庄美美的尸体正准备往外偷，龙飞经过一翻苦战终于将他打倒在地，肖克等人及时赶到，并将其捕获。 开灯一看竟然是肖克曾经找过的火化工向永福，原来他向学一的父亲。但是向永福眼疾手快同时把庄美美眼睛里的胶卷迅速曝光了。 向永福交待，他的使命是要把庄美美拍到的军事基地的建筑平面图交给梅花组织。但是自己败露了，胶卷决不能落在公安人员手里，所以他只能毁了它。 叶蕾受到擅自离守的处分，保证不再犯错。南云向肖克及叶雷了解到龙飞的最近情况，并希望今后不要影响他们，两人和好如初，定下婚期。 但是龙飞觉得梅香不是普通的护士，依然时不时的去造访她。龙飞想从梅香那里了解白家老宅的情况，梅香好像一无所知。

专案组制定了下一步行动计划，让向永福去接头。却没想到向永福左思右想，他不愿意出卖他的组织，又不愿意连累儿子，最后选择了死。 向永福自杀，线索中断。这给行动造成了更大的困难，肖克向专案组请命，以让他假扮向永福，利用向永福单线接头中的漏洞，直接和取图的人接上关系，代替向永福，打入特务组织。 龙飞越来越怀疑梅香是特务，说要和她玩抓特务的游戏。 肖克提前来喝南云和龙飞的喜酒，叮嘱龙飞今后好好待南云。叶蕾也在婚礼的一大早赶来告诉他临时有任务不能参加婚礼了，提前送来礼物。龙飞突然明白今天江边有行动，追至江边，还告诉肖克不要去，肖克骂龙飞太没有原则，坚持行动。肖克被前来接头的特务黄栌看出破绽，行动失败了。 龙飞因泄露情报被我公安人员抓获，没能如时进行婚礼。龙飞跟赵处长说明了一切他所做的事的目的，并让转告肖克。 南云由于龙飞没能与她正常进行婚礼，十分伤心。龙飞保证以后不会再有这样的事，并向南云道歉。

行动失败后，赵处长给大家开会，批评了肖克。南云来找龙飞，他又不在家，门上挂着一把锁。依然是屡屡失约，常常找不到他的踪迹。 叶蕾怀疑龙飞是特务，就对肖克讲了。 梅香果真是特务。 黄栌的公开身份是电影院的副经理，电影院就是他们活动的地点。他一直在打梅香的主意。当他发现他和梅香之间又冒出个龙飞的时候心中很是不快。黄栌早看出梅香对龙飞的态度暧昧，他已经追求梅香多年。于是黄栌在龙飞进到护士站的时候在背后将他打晕绑架了龙飞。梅香制止了黄栌为泻私愤折磨龙飞，但是她并没有很快放龙飞走。梅香问龙飞为什么行动那天要救肖克？龙飞告诉梅香肖克是他的朋友。她对龙飞的解释颇为满意，她决定放龙飞走，但要他说出是谁杀死了庄美美，却没想到，龙飞说庄美美就是他杀死的。 黄栌想问清龙飞到底是什么人，并对龙飞施以私刑。龙飞反问梅香能否加入特务组织。黄栌的父亲黄飞虎逼问龙飞是怎么杀死他女儿黄菲也就是庄美美的，并让他带杀死黄菲的真正凶手来。龙飞明白这就是考虑他的加入了。 一连几天不见龙飞的踪影，南云心里有了不详的预兆。她撬开龙飞的门，乱翻他的东西，发现了梅香写给龙飞的信笺，上边写着“老时间，老地方见”，心如刀绞。

龙飞下决心要成为黄飞虎他们中的一员，他时不时地和梅香出双入对。 南云因为失望到寺院找弱行师傅寻求解脱，弱行希望南云一定好好选择，好好活着。 档案馆的同事们议论纷纷，跟龙飞说处理好男女关系，这让龙飞很恼火，叶蕾更加觉得龙飞有问题。 肖克去找南云发现她正站在房顶以为她要自杀，一把将她揽在怀里。心事重重的南云啼泪具下，肖克一番劝说安顿好南云便回家了。 梅香收到一封莫名其妙的信，黄飞虎要她查清是写的，并说要给龙飞看看。 黄飞虎看信后得知龙飞与南云的关系，同时也对他的身份大为怀疑，便派梅香去证实。 龙飞再次向南云保证一定要办一次婚礼，只有他们两个人。结婚的晚上，南云准备好一桌饭菜等着龙飞，龙飞没能及时回来，让南云倍加心酸，再次绝望。 正当南云暗自落泪的时候，梅香却尾随龙飞回到档案馆的新房。她逼着龙飞杀死南云证明自己的身份，意想不到的是南云一把夺过了枪，用枪口对着自己，开枪自杀了。 南云自杀事件给龙飞造成了极其恶劣的影响，他被开除了档案馆的公职。龙飞将黄菲的骨灰送致黄飞虎处，并得到他的初步信任。