回到被恐怖份子从外部隔离的医院之后，井上薰展开了对恐怖份子的反击。他在一楼干掉沼田之后，又和护士长富永一起到理疗室救出了世本绘里。井上一边观察房间里的东西，一边告诉富永，为了正在做手术的加藤原首相和被软禁在大厅的患者们的安全，他必须和世本一起制服恐怖份子，而且剩下的五个恐怖份子，全部都曾经是军人。与此同时，留在医院五楼的首领金田并不知道井上他们的行动，还在据点要挟加藤原首相的秘书买卖股票。医院已经被警车包围了，SAT队也做好狙击队形，准备强行突击。这时，到达现场的尾形总一郎接到电话，井上告诉他自己和世本都没事，加藤原首相也很安全，让他通知SAT队不要急于行动，他会和世本一起解决这些恐怖份子。井上和世本利用医院的药品和设备干掉了二楼的垣原，三楼的小林以及四楼的赤城。不久之后，尾形又接到西岛理事官的命令，让他们停止行动。这时SAT队已经要展开行动，而完成股票交易的金田和吉野正好接到沼田的消息。金田立刻来到一楼，潜入五楼的世本麻利地干掉了吉野，留在一楼的井上也顺利利用爆炸干掉了金田。人质被释放时，井上来找尾形，希望在手术结束前继续做警卫工作，加藤原首相的手术在他们的守护下终于平安完成。