日本使臣伊藤博文拜见李鸿章，就朝鲜事件谈判。李鸿章则带伊藤博文参观定远、镇远两艘当时亚洲最先进的舰只，日本使臣深受震撼，不敢无理，双方和平商谈，最后签订了《中日天津条约》。

经李鸿章保奏，总理衙门核准袁世凯署理朝鲜交涉商务委员。并打算让长子经方走外交之路，重新启用张佩纶。

刘永福随唐景崧，拜见了张之洞，并得知，因朝廷只按名义上的人数只给黑旗军拨发了两千人军饷，另外一千人由其自筹，刘永福为保基隆，为保黑旗军所有将士都能安然回国，只好答应。

临行之日，阮文明亲自送别刘永福与黑旗军战士，并表示永远与他是兄弟。刘成良跪别义父，留在越南为生父守墓。

基隆封锁解除，台湾军民一心，出资出力重铸炮台，刘铭传却思绪万千。此时，朝廷传旨命他启程回京，丘逢甲赠台湾茶叶，为其送行，希望他能回味台湾，早日重返。朝廷命刘铭传写明弃守基隆、保卫台湾的经过，刘铭传深思熟虑后，写下一本“密陈福建巡抚移驻台湾”的奏折。刘铭传进宫拜见西太后，上奏密折，开诚布公，西太后赐还头品顶戴，加恩赏戴双眼花翎，以巡抚衔在京候补。

北京，西太后决定对台湾、越南之战的将士论功行赏。台湾有功将士，孙开华将刘铭传列为首位，左宗棠不解，细问才得知所谓的刘铭传“怯敌，弃守基隆”实属误会，立刻发加急电报向刘铭传认错道歉。

唐景崧升任四品京卿，送刘永福回乡祭母。随后奉旨回京，途中巧逢刘铭传，二人惺惺相惜，彻夜长谈。随后，拜见恩师，军机大臣翁同和从其口中得知镇南关的真实情况，气愤难忍。

翁同和上廷实奏“李鸿章扣发电报，晚报军情，”却被李鸿章巧妙搪塞过去。

左宗棠重疾之下，由人代书上奏“海防折”，建议将福建巡抚改为台湾巡抚，强调台湾重要，与刘铭传的密折不谋而合。

西太后命醇亲王主办台湾以及海防事务。醇亲王找恭亲王商量，翁同和与光绪皇帝也在商议此事。恭亲王建议以同治十三年的琅峤事件为鉴，不可鲁莽行事。翁同和则提醒光绪帝在亲政前，要拥有各项权力。

醇亲王巡视北洋水师，此时的北洋海军实力已是亚洲第一，他希望李鸿章总管海军衙门。随后，醇亲王又向西太后回禀台湾及海防之事，言语之间，西太后早已猜出这些话皆出自被贬退出的恭亲王之口。

伊藤博文回国后，将清国海军现状向日本睦仁天皇如实禀报。天皇下令日本全国官吏每人捐献薪俸的百分之十用以扩充海军。从而，加速实现侵略扩张的野心。

左宗棠在弥留之际，念念不忘台湾建省，但还是未能等到皇帝亲允建立台湾省的好消息就殉职于福州任上。朝廷得此消息，纷纷悼念左宗棠，并在京都设立专祠祭奠，醇亲王代天子致祭。

西太后一面应允建立海军衙门，一面提出修建园林供她养老。醇亲王无银子，只好求助李鸿章。建立完善的海军需要花费大量银两，而修建园林更是花钱如流水，李鸿章为此也一筹莫展，此时孙毓汶提议设立“海防捐”，借此敛财，以解办海军和修园林之难。

光绪十一年九月初五，清廷终于下旨台湾改为行省，命刘铭传为首任巡抚。于第二日，设立总理海军事务衙门，醇亲王为总办大臣，李鸿章为会办大臣。1885年10月12日，台湾府终于改为台湾省。

李鸿章让刘铭传出任海军会办，刘多次婉拒。李鸿章打算上折请奏，孙毓汶则自告奋勇，认为有能力让刘铭传回心转意。

台湾巡抚刘铭传走马上任后，事事皆难，福建和朝廷均不拨军饷，万般无奈之下，刘铭传只得与唐景崧共同写旨上奏朝廷，缓建台湾省。正在此时，偶遇孙开华，得知左宗棠临终遗命“福建原先每年给台湾的四十四万两军饷，一切照旧”。刘铭传大喜，无奈缓建台湾省的奏折已递上，孙开华买通管事太监，把奏折拿回。

刘铭传上任之前向李鸿章告别，并表示将重新利用当年被沉入海底的那条铁轨，为台湾建造第一条铁路。李鸿章挽留刘铭传的希望破灭，只得将写好的折子付之一炬。同时，刘铭传上折保荐唐景崧为台湾兵备道，并弹劾现任台湾兵备道刘璈于台湾战事之时不闻不问、有饷不发、坐观成败。醇亲王因事情棘手，暂压奏折。

李鸿章与德璀琳商谈大清购买巡洋舰事宜时，北洋水师管带邓世昌忽然闯入，恳请派他去英国监造兵舰，李鸿章被感动，欣然同意。此时，日本也在商议派何人去法国监造他们的舰只。

日本派海军大佐伊东佑亨去法国监造舰只，他与邓世昌相遇在客轮上，两人经历了一番唇枪舌战。

刘永福率军回到广西，却无实权，黑旗军将士们一个个离开，连曾阿富也告长假返乡侍奉哭瞎双眼的老母亲，母子相见，泪如雨下。面对弟兄们的离去，刘永福心如刀割，却无能为力。

台湾建省，众人免费品尝当地的“国姓爷鱼粥”，以示庆祝。

刘璈得知刘铭传上奏弹劾他，便恶人先告状。经朝廷商议后，令闽浙总督杨昌濬彻查此事，杨昌濬派王诗正亲往台湾私下调查二刘互参一事。王诗正拜访四品京卿林维源，恰逢，刘铭传来与其商讨如何恢复基隆煤矿之事，从两人的谈话中，王诗正已清楚事情真伪。王诗正据实以报，刘璈本想略加贿赂杨昌濬以平息此事，却适得其反，刘铭传终还清白。

唐景崧升任台湾兵备道，与同僚共庆祝，酒醒后发现红颜知己紫玉已经离开。