李时珍在斯语和家人的照顾下身体慢慢康复，他说动父亲支持他继续告下去。他到了巡抚衙门状告福成药行与惠民局勾结贪污朝廷除疫银两、制假贩假，使得瘟疫蔓延、百姓死伤无数。巡抚暗示李时珍不要再告。朱成翊也找到李时珍，以成全李时珍和苌葶的婚事为条件让李时珍撤诉，遭到李时珍的拒绝。

很快，巡抚便用假的人证物证告李时珍出售假药害死人命，将其缉拿归案。危急之时，顾先生出面带领众乡绅为李时珍求情。巡抚有所收敛，却暗中找严世蕃问计。严府明示先定罪再说，巡抚随即判李时珍秋后问斩。顾先生赶紧给亲家刑部尚书冯天驭写信求救，冯天驭研究卷宗后觉得案情重大，似乎与严家有牵连，随即请内阁大臣夏言定夺，夏大人正愁找不到拿捏严嵩的把柄，下令彻查此案。