雷刚想要入党，柯湘让他写申请。毒蛇胆自以为能抓住柯湘他们于人交付药品货物，却被柯湘他们反扑。柯湘与小姑的误会也化解了，了解了她的小姑还上山来帮她，教兄弟们识字。

毒蛇胆想利用柯湘的公公赵举人，把他关进大牢，赵举人凛然自尽。全杜鹃山人在山上为他祭奠。柯湘与小姑又闹了矛盾，她说服了小姑写检讨。雷刚与喜鹊成亲当日，喜鹊被毒蛇胆派来的人枪杀，杜鹃山上一片悲愤。

气急了的雷刚杀死了几个俘虏，柯湘也没能拦下。柯湘要给雷刚记大过处分，雷刚的兄弟温其久不服气。山上的兄弟生了病，柯湘告诉队员们要克服，不能用要送去给组织的药品。兄弟们的病情更加恶化，柯湘觉得特别无助。

柯湘的小姑凭借医术救回了队员。队员金奎私藏了公款潜逃，被柯湘发现，要治他死罪。全体队员为金奎求情，柯湘犹豫不决之时，金奎拔枪自尽。雷刚觉得柯湘不讲情面，十分愤慨。自卫队去攻打毒蛇胆，毒蛇胆带着儿子逃窜。

自卫队放粮食给老百姓，老百姓们认识到了共产党的好。毒蛇胆逃到吉安城，自卫队分浮财，被柯湘制止，温其久不服气还私藏了物件。温其久对柯湘的不满日益加重，雷刚越来越信任共产党，支持柯湘的工作。

毒蛇胆团队溃散，他最珍爱的儿子也死了。组织来的特派员要撤掉温其久。雷刚为他抱不平。毒蛇胆又开始挑拨，与杜鹃山的队员们展开了战争……