碧血盐枭话分两头，一边是一群盐枭（就是卖私盐的）被官兵追杀（其中就有女一号杨怡），打算从密道土遁，结果还是被围剿，小部分人突出重围，但亦身受重伤。另一边，盐栈（就是卖盐的官方版）老板胡老爷被分销商围攻，要压其盐价，胡老爷无奈，向二儿子（也就是男二号黄浩然，据说戏份比马仔还要多）求救，而黄浩然也很拽的帮老爸解决了难题，但刚刚搞定难题，他的消渴症（貌似就是糖尿病）就犯了，于是两队人马为了同一个目标——看医生而走到一起来了，杨怡这队人是先到的，为了打发走来求医的黄浩然，杨怡自称是吕神医的女儿给黄浩然胡乱的开了个方子……吕神医搞定了盐枭的伤后得知了杨怡开的方子，马上和杨怡去找黄浩然阻止误喝“毒药”，而且断言黄浩然还有一年活头了，黄浩然黯然。而官兵则是锲而不舍对逃脱的盐枭穷追猛打，终将其一网打尽，而杨怡侥幸逃脱，被黄浩然救起，她只好跟着他们去扬州。路上，在客栈，黄浩然因为不能吃甜食（其实是因为糖尿病快死了的原因）一时想不开要自杀，刚好被杨怡看到，就开解了他。杨怡跟着黄浩然回到扬州，在街上了瞥到了因为官兵围剿而走散的恋人男一号马仔……

在扬州街上杨怡没有找到马仔，就跟着黄浩然回了胡家，也认识了胡家的一群人，刁蛮任性的四小姐，被休回娘家的大小姐，玩物丧志的三少爷和没什么地位又丧夫的胡老爷的妹妹。而黄浩然也因为杨怡看不懂姑姑拿的药材而开始怀疑杨怡的身份，正在这时盐枭（包括杨怡的父母）的尸首被曝尸城楼，而站在城头宣读圣旨的，正是杨怡的恋人马仔……原来马仔是缉私营（专抓私盐的）派到盐枭那的卧底，也是缉私营统领的干儿子，他这次因为成功剿灭盐枭而升了职。而他爹当年也是被盐枭所杀，所以他就立志要剿灭所有盐枭……杨怡为了给父母报仇，找到了马仔，但终因武功不行打不过人家，没能如愿，这一切都被知道了杨怡身份的黄浩然看到了，杨怡被黄浩然带回家后，开始绝食求死，黄浩然除了悉心开导和照料，还答应她帮她取回她父母的尸首，杨怡这才肯吃饭了。黄浩然去找马仔走后门（他们之前就是朋友关系）帮杨怡取回了父母的尸首，并让他们入土为安，并要求杨怡不要报仇而是好好的活下去……

杨怡因为不想在胡家吃闲饭而要求去盐栈打工，而胡家上下则认为她和黄浩然有暧昧。马仔的妈妈和黄浩然的姑姑臭味相投，合伙开了间酱油铺，外带卖水盐（也就是水货盐）、放高利贷，马仔的妈妈因为怕聂家无后（忘了说马仔的角色叫聂致远），所以想给马仔找个媳妇，姑姑就把四小姐介绍给她，四小姐得知后本不打算答应，但见到马仔够靓仔，就改变了心意，结果轮到不知情马仔不干了，更当众宣言早已心有所属，虽然是有缘无分，但心里已再容不下他人，这些话也被在一旁的杨怡听到了……晚上，在胡家做客的马仔私下对杨怡表明，自己对她的心意是真的，但被杨怡则拒绝，更骂他是伪君子，这些也都被四小姐偷听了去……新任盐运使与胡家三少爷在妓院争风吃醋而大打出手，使得一心想巴结盐运使的胡老爷心存忧虑，没想到第二天盐运使就和三少爷握手言和，这个貌似糊涂但其实不简单的盐运使更是心直口快的抖出了大小姐的伤心往事，还顺手发现了胡家有家贼，而这个家贼——胡家大小姐则是为了帮补情夫才去偷家里的古董……

原来胡家大小姐的情夫蔡子安和缉私营统领屠应龙是狼狈为奸，蔡子安把大小姐偷来的古董都送给了屠应龙，而屠应龙则暗地支持蔡子安巴结新任的盐运使姚守正，以便得到总商之位，而屠应龙的最终目的就是要侵吞胡家所有财产。在胡老爷和蔡子安争相巴结的酒宴上，姚守正大醉，回家的路上遇到了屠应龙，原来他们曾经结过梁子，姚守正更指屠应龙是个贪官……胡老爷为了抓家贼夜守书房，结果却误抓了妹妹，大小姐便借机演戏，令胡老爷相信其与蔡子安已无私情，继而取代了姑姑开始掌管胡家的账目。胡四小姐托三哥撮合她和马仔，结果被马仔婉拒，令四小姐怀恨在心，于是把马仔与杨怡有暧昧的事在胡家宣扬，更联合大姐和姑姑一起来抹黑杨怡，人言可畏，正当杨怡准备离开胡家去找黄浩然道别的时候，听到了黄浩然和马仔的一番对话，使得杨怡最终决定留在胡家。马仔追剿盐枭屡屡失手，于是怀疑线人耍诈，追查下去却发现线人和姚守正的师爷有接触，而且这个师爷也是个练家子……公布总商之位人选的时候，姚守正突然称本次总商的位子由世袭改为公开竞投，气的胡老爷当场晕倒……

马仔于胡三少爷吃饭时无意中看到放假消息的线人，便追了上去，没想到居然与姚守正和其师爷一起将线人抓获，正当二人逼问线人是谁指使其放假消息时，线人就被冷箭射死，马仔怀疑是姚守正所为，更指姚守正本就是贪官，姚守正便带马仔去看他给灾民派米，并表明自己表面贪，其实是把贪来的钱用来赈灾。姚守正提醒马仔缉私营有内奸，并暗示内奸就是屠应龙，马仔虽敬姚是清官，但却不认同自己眼中一向正义的干爹是坏人。黄浩然为能投标成功而联合其他盐商，岂料其他盐商阳奉阴违暗地纷纷支持蔡子安，黄浩然得知后连夜清算身家并做好了标书。胡大小姐为帮蔡子安，设一计偷看到了标书的内容，并告知蔡子安……胡家上下为了投标一事弄的鸡犬不宁，黄浩然亦心力交瘁，不惜加大自己用药的分量，这一切都被杨怡看在眼里，于是杨怡夜探蔡府偷看到了蔡子安的标书，岂料被家丁发现，逃走之时却又遇上马仔……

马仔放走了杨怡，与蔡家家丁打了起来，蔡子安和屠应龙赶来，马仔质问屠应龙为什么会和蔡子安勾结在一起，屠应龙承认自己是贪官，连马仔的爸爸和他都是一丘之貉，马仔当然接受不了这个事实，岂料又被他发现老妈放高利贷卖私盐，终于明白自己一直以来似乎都无法明辨是非……黄浩然在竞标前修改了标书，最终在竞标中击败了蔡子安，而黄浩然怀疑将自己的标书透露给蔡子安的人是姐姐，但大小姐矢口否认。黄浩然让杨怡在姐姐上街的时候跟着她，结果被大小姐戏弄而结识了青楼女子映月……大小姐甩掉跟着她的人与蔡子安密会，结果被四小姐发现，大小姐求她不要告诉胡老爷，四小姐答应……杨怡和映月吃饭时看到喝醉了的马仔和三少爷去妓院，原来映月喜欢三少爷，不料三少爷让她服侍马仔，映月对三少爷死心，打算嫁人做妾室……马仔回家后见到屠应龙，屠应龙要他去假装围剿盐枭，被马仔拒绝……