纪晓岚颇为欣赏如玉的才情，于是让如玉女巧扮男装，跟随自己去大内看《四库全书》的编纂。和珅将纪晓岚写下的奏章呈给乾隆，乾隆大悦，让纪晓岚在宫中骑马作为奖励。和珅散布谣言说纪晓岚当初扣下颜骥的藏书只为查反书以取说皇上，众官皆信不已，纪晓岚有口难辩。颜骥的学生戴沾一直潜心帮纪晓岚著书，得知此消息，痛斥纪晓岚道貌岸然，被官府以辱骂朝廷命官为由投进大狱。纪晓岚见到奏章实为自己笔迹，百思不得其解。小月深夜潜入和府要盗出迷魂烟草，不料中了和珅的圈套，将假烟草拿回了纪府。纪晓岚检验烟草的真伪，不料牙齿被烟草染黑。早朝时，和珅看到纪晓岚闭口不语很是幸灾乐祸，并千方百计的让纪晓岚在乾隆面前开口。纪晓岚将计就计，引经据典，表示“黑齿”之举只是为了提醒皇上理政之道。乾隆深感纪晓岚的一番苦心，高兴之余奖纪纪晓岚烟草，纪晓岚表示愿意用烟草换戴沾免罪。戴沾同意前往纪晓岚家中继续编纂《四库全书》。和珅找到神父，表示要捐资修教堂，神父经受不住诱惑，将纪晓岚佯装找到迷魂烟草的真相全盘托了出。如玉与戴沾同在纪晓岚家中。见到戴沾的正直之举，如玉很是钦佩。

见到戴沾对纪晓岚不屑，小月很是愤然，欲百般捉弄戴沾，却不小心失足从树上跌下，幸而戴沾出手相助。在乾隆的询问下，和珅说出设计于纪晓岚的真相。和珅道出自己已从神父处得知真相，让纪晓岚不要再虚张声势。戴沾表示要报答颜骥的救命之恩，誓要与纪晓岚斗争到底，如玉被戴沾的一腔正气所折服，暗生爱慕。和珅、乾隆不相信纪晓岚有迷魂烟草，于是纪晓岚请来太后作证人。和珅、乾隆果然抽完后迷倒。太后很是惊讶，纪晓岚坦言自己只是在茶里放了迷魂药，恳请太后做主为颜骥全家平反。太后最终被纪晓岚的一番肺腑之言所感动。和珅中了纪晓岚的计，无奈只得说出颜骥被奸人陷害的真相。

和珅将颜家平反的功劳全揽到自己身上，将纪晓岚说的一无是处。如玉受到蒙骗，恳请和珅帮自己报仇。和珅将伪造的金烟杆交给如玉，让其盗出真烟杆以陷害纪晓岚。如玉让戴沾里应外合，戴沾只得勉强答应。戴沾见如玉成功，为表示自己因为此举而深感愧疚，要放弃修书。乾隆与和珅夜访纪府，纪晓岚在和珅的怂恿下拿出金烟杆，却发现烟杆为伪造之物，纪晓岚愕然。刘全建议和珅杀如玉灭口，以掩盖烟杆之谜。和珅突然升起怜香惜玉之情。纪晓岚为烟杆之事一筹莫展，隐隐感觉此事与和珅有关。从纪晓岚口中得知戴沾已替自己揽下全部罪责，如玉顿时乱了方寸。戴沾表示自己并没有认罪，如玉方才察觉自己已中了纪晓岚的圈套。两人争相要替对方承担罪责。如玉决定自首。一个杀手受刘全指使，谎称替纪晓岚来接如玉。如玉被带至一荒庙。就在杀手要下手时，小月赶到，救出如玉，并告诉其和珅的真实面目，鼓励如玉状告和珅。

乾隆拜祭颜骥，碰到女扮男装的如玉。乾隆对如玉的见解产生兴趣。这时杀手赶到，乾隆挺身相救，并带如玉从楼上一跃而下逃脱了追杀。纪晓岚想到往年和珅都请自己给太后写祝寿赋，于是想借此来向和珅交换烟杆。谁知和珅拿出戴沾的祝寿赋来卖弄，纪晓岚仔细看过后指出赋中暗藏对太后不敬之辞，和珅气急败坏。御医为如玉疗伤，却发现如玉实为女儿身。得知纪晓岚将赋中暗语告诉和珅，戴沾痛斥纪晓岚。纪晓岚苦口婆心规劝戴沾不要因一时冲动而葬送终生，两人尽释前嫌。乾隆下旨除去纪晓岚《四库全书》总纂官的职务，和珅幸灾乐祸。如玉醒来得知乾隆身份大惊。乾隆佯装不知如玉为女儿身，邀其共眠，如玉百般推辞。乾隆装睡，如玉想到乾隆赐死全家，欲杀乾隆报仇，但想到自己为乾隆所救又不忍下手，痛苦之时想一死了之，被乾隆拦下。乾隆心下断定如玉与颜骥有关。和珅指使同为编纂官的冯大人到狱中探望戴沾，冯慌称要把戴沾的手稿编纂成册，却暗中将手稿交给了和珅，以换取自己落在和珅手中的罪证。乾隆带如玉前往四库馆。如玉尽显才学，被乾隆指派到四库馆修书。

乾隆邀如玉共眠，如玉只得说出自己的真实身份。和珅以小月要挟纪晓岚交出八哥，纪晓岚无奈答应。太后亲临四库馆，见到才貌俱备的如玉甚是喜欢。太后召小月进宫，纪晓岚嘱咐小月告诉太后和珅家有一只会说人话的八哥。太后欲将小月许配给如玉。太后和乾隆兴冲冲地要看和珅的八哥，和珅得意之余却发现往日甜言蜜语的八哥此时只会痛骂太后。纪晓岚表示自己还有一只会说贺词的八哥，但要用金烟杆来换。和珅无奈应允。和珅以献鸟博得太后欢心，本以为乾隆会指派自己担任总纂官，谁知皇上以纪晓岚找回烟杆为由让其官复原职。乾隆经过和如玉的接触，已对其产生爱慕之情，他命和珅阻拦如玉和小月的婚事。与此同时，纪晓岚对如玉表示只有同意与小月的婚事，才能救出戴沾。

纪晓岚探望戴沾。对证之下，两人明白是和珅从中捣鬼使两人频生误会。纪晓岚表示如玉处境危险。为救如玉戴沾只得说出真相。得知如玉的真实身份，纪晓岚惊讶万分。如玉到狱中恳求戴沾与自己远走高飞，戴沾却表示要一心潜修《四库全书》，不愿因为儿女情长而辜负颜骥厚望。得知乾隆早已知道自己的身份，如玉表示自己也早已忘记仇恨。纪晓岚带太后看戏，太后惊讶地发现公主为小月扮演，而驸马正是如玉扮演。戏中驸马原为女扮男装，被发现后要处以死刑，太后深为同情女驸马，令纪晓岚修改剧本，恕女驸马无罪。