大院君要衛隊長用武力關閉書院，只留下四十七個書院。許多儒士上書，向皇帝表示不滿。皇后認為錯誤不在大院君，而在於儒林自己，文人儒士不如先前清高，他們結黨營私，貪婪錢財，理應率先清理門戶。貴族紛紛用武力抗稅，毆打收稅人。閔升鎬勸皇后趁士大夫和儒林與大院君作對時出面協助皇帝主政，但皇后覺得生性軟弱的皇帝還不能和大院君抗衡。1873年，小善六歲，皇上登基9年。大院君在去見眾臣之前，去見皇上，要他冊封李尚宮的兒子為世子，並一同去思政殿見眾臣。皇上不從意父親的命令，認為父親不同情皇后的不幸，在封太子之後馬上就會廢除皇后，眾大臣意見也不一。皇上想當真正的皇上，不當父親的傀儡，下決心與父親對著幹，但是被母親府大夫人勸阻。