燕怡拿着照片找到肖剑秋，质问他到底是不是共产党。面对确凿的证据，肖剑秋起初还在想方设法狡辩，但燕怡不依不饶。肖剑秋最终明白自己已经暴露了，只能拔出枪来对准燕怡。心情复杂的肖剑秋无法下手，他问燕怡为什么不把这件事告诉周培熙。燕怡此时无法控制自己的情绪，袒露了自己的感情，并告诉肖剑秋唯一一个知情人已被处理。燕怡也告诉了肖剑秋自己很感激他在偷档案那次帮自己解围，并说出了从谢炎鹏那里听来的自己是共产党的后代的话。肖剑秋知道燕怡已经无法回头，深受感动。

燕怡的手下无故失踪，这引起周培熙的注意。在检查照片时，周培熙发现少了一张。他怀疑是燕怡拿走了那张照片。周培熙一直在思索燕怡为什么要藏起那张照片，照片上的人到底是谁。周培熙想到燕怡和肖剑秋最近越走越近，心中不由得又对肖剑秋产生了极大的怀疑。为了确认燕怡是否是为了肖剑秋藏起照片，肖剑秋是否就是照片上的人，周培熙决定兵行险招，试探一下燕怡。

周培熙秘密召集了燕怡和谢炎鹏，告诉他们上级下令要将肖剑秋以暗杀的形式处决，他将这件任务交给燕怡来执行。燕怡闻听这个消息，心神大乱，因为这个时候她已经爱上了肖剑秋。虽然燕怡心中已经心知肚明肖剑秋就是共产党，但还是无法下手。周培熙命令燕怡和谢炎鹏在第二天晚上下手，在肖剑秋从师部下班回家的路上行刺。谢炎鹏摩拳擦掌，急不可待，而燕怡则心神不宁。

当天晚上，燕怡回到家中，左思右想，还是给肖剑秋写了个纸条，提醒他已经暴露，让他赶紧离开江中。肖剑秋接到燕怡的信后，也陷入了沉思。

第二天下午，肖剑秋突然命令部下从军统监狱将叛徒陈进带到师部审讯。肖剑秋装模作样地审问陈进，问他知不知道张凌轩实际上是国民党的特务，陈进此时已经精神失常。肖剑秋恶狠狠地怒斥陈进害死了党国精英，造成了局势的被动，陈进只得不住地哀求饶命。肖剑秋提审陈进的消息迅速传到了周培熙那边，周培熙没多说什么，指示燕怡和谢炎鹏继续按计划晚上行动。

晚上，肖剑秋亲自押着陈进离开师部，但没有回军统办公处，却一直向江边走去。谢炎鹏开车带着燕怡悄悄尾随，谢炎鹏将周培熙给他的无声手枪交给燕怡，叮嘱她一旦进入了射程就立即向肖剑秋开枪。距离越来越近，燕怡举枪瞄准肖剑秋，却无论如何扣不下扳机。就在燕怡犹豫之时，突然斜刺里杀出一辆车来，车上的人举枪瞄准肖剑秋和陈进就是两枪，肖剑秋和陈进应声倒在血泊中。燕怡和谢炎鹏大吃一惊，忙驱车离开。

开枪射击肖剑秋和陈进的正是林砚泉，他接到了肖剑秋的指示，一方面以此来除掉叛徒，另一方面免去了燕怡的为难境地，为肖剑秋消除怀疑。陈进当时便被一枪击毙，而肖剑秋只是肩膀受擦伤，伤势并不重。

谢炎鹏回到军统办公处向周培熙汇报任务失败，周培熙告诉谢炎鹏枪中是没放火药的子弹，根本打不出去，他就是为了试探燕怡才布了这个局。

肖剑秋受伤仍然不能解除周培熙对他的怀疑，他忽然突击检查库房，发现那台发报机早就少了一个元件。周培熙设下鸿门宴，邀请肖剑秋。席间，周培熙突然告诉肖剑秋，发报机少了个元件，而在此期间进过库房的只有肖剑秋一个人。肖剑秋假装忽然想起自己登记的时候，登记员曾因为写错字而撕掉了一页纸。肖剑秋立刻利用这一细节为自己辩护，他要求周培熙找到入库登记记录。周培熙找来登记记录，上面果然少了一页，而且就在肖剑秋的入库记录之前。肖剑秋用拓印纸扫了几下，上面赫然出现了谢炎鹏的名字。原来当时肖剑秋就打算利用记录员撕掉错页的细节来把周培熙的注意力引向谢炎鹏，他趁记录员不注意在本子上动了手脚，早就准备好了一份留有谢炎鹏签字印痕的纸。肖剑秋对发现谢炎鹏的名字故作吃惊，周培熙面无表情。

周培熙将谢炎鹏叫到了自己的办公室里，让身边的警卫员都离开，二人密谈。周培熙拿出了那张签有谢炎鹏名字的记录纸，告诉谢炎鹏他现在有很大的嫌疑，解除了他的职务，要他次日立即回到南京接受调查。谢炎鹏看到那张纸，很是惊愕，连忙说自己一直对周培熙忠心不二，这一定是有人陷害。周培熙沉默片刻，告诉谢炎鹏自己也不相信他会是共产党，但现在必须要有人出来背这个黑锅，他会保证谢炎鹏回了南京也不会有什么危险，但谢炎鹏在眼前证据确凿的情况下，无论如何必须回去接受调查。

谢炎鹏毫不相信周培熙的承诺，深知自己一旦回去恐怕就没命了。面对周培熙的丢卒保车，谢炎鹏也留着自己的杀手锏。他拿出了燕怡偷入档案室那天留下的爆炸物残片，又拿出了自己随身保管的档案室的钥匙。谢炎鹏在钥匙上发现了黏土的残渣，而能有机会拿到钥匙倒模的人，只有那天把他灌醉的燕怡。而且他也早已查出燕怡杀掉了自己的手下一事，谢炎鹏断定燕怡就是共党的奸细，纪录上做的手脚也一定是燕怡所为。周培熙勃然大怒，质问谢炎鹏为什么不早告诉他，谢炎鹏直言燕怡和周培熙是父女关系，自己贸然从事只有掉脑袋的下场。谢炎鹏告诉周培熙，就燕怡的事情，他已经准备了一份详尽的报告，希望周培熙能大义灭亲。但如果他一定要丢他这个卒子，那么大家就只有鱼死网破一条路可走。

周培熙想到如果谢炎鹏的这些证据被南京知晓，不但到时候燕怡小命难保，恐怕连自己都会难逃干系，将面临灭顶之灾。周培熙想到这里，动了杀机，趁谢炎鹏不备，猛地掏出枪来，指住了谢炎鹏，要谢炎鹏把那份报告交出来。谢炎鹏明白周培熙动了杀心，便假意答应，趁周培熙不备猛地扭身冲破了窗户，跳窗而逃。周培熙开枪，但只打中了谢炎鹏的肩膀，谢炎鹏趁机逃走了。听到枪声的警卫员冲了进来，周培熙告诉他们谢炎鹏是共党的奸细，下令全城搜捕谢炎鹏，格杀勿论。与此同时，周培熙决定亲手杀死燕怡，以绝后患。

周培熙以散心为名，带着燕怡来到了荒郊野外无人处。燕怡此时也知道了谢炎鹏逃走一事，心里七上八下。周培熙站在燕怡身后，掏出枪来，就要动手。燕怡感觉到了周培熙的举动，回过头来，正对着枪口，一下愣住了。但最后关头，周培熙无法释怀多年来的父女之情，放下了枪，让她逃得越远越好。燕怡临走之前，终于向周培熙问起了自己的身世，周培熙此刻不再隐瞒，将事实真相告诉了她。

燕怡的亲生父母实际上是在1927年的4.12事件中牺牲的中共党员，而他们就是死在当时只是个小头目的周培熙之手。但面对嗷嗷待哺的燕怡，周培熙下不了手，他收养了燕怡，但向所有人隐瞒了她的真实身世。而谢炎鹏在那次行动时就已经是周培熙的手下，所以他也知道此事的前因后果。

燕怡终于得知了自己的身世，周培熙就是杀害自己亲生父母的凶手，但她仍旧对周培熙恨不起来。周培熙苦笑着说谢炎鹏一开始就跟他说，非我族类其心必异，想不到果然应验了。他问燕怡是不是要杀自己为父母报仇，燕怡面对养育自己长大的杀父仇人，沉思许久，一言不发地转身离去。周培熙看着燕怡离开，头一次无声地流下了眼泪。

燕怡打算去跟肖剑秋告别，没想到在去见肖剑秋的路上突然遭到了谢炎鹏的绑架。谢炎鹏决定押着燕怡去南京，打算以燕怡作为证据来搞倒周培熙和肖剑秋，以图东山再起。谢炎鹏考虑到江中四处都有追兵，决定绕远路前往南京。

燕怡在和谢炎鹏前往南京的路上，留下了种种痕迹，被游击队所注意。林砚泉认出了二人，立即通知了肖剑秋。肖剑秋得知燕怡被绑架的消息，方寸大乱，决定冒险前去营救燕怡。

肖剑秋和林砚泉会合，得知谢炎鹏和燕怡二人绕路前往南京，被游击队紧紧盯梢，便立即决定抄近路截住二人。为了不暴露肖剑秋的卧底身份，林砚泉下令撤去了盯梢的队员，只是自己和肖剑秋二人前往拦截。

林砚泉和肖剑秋一路紧追不舍，终于截住了谢炎鹏。在江边，双方展开枪战。混战中，燕怡中枪，谢炎鹏也被沈林二人击毙。燕怡弥留之际，肖剑秋终于亲口对她承认，自己确实是代号“鱼鹰”的共产党员。燕怡含笑死在了肖剑秋的怀中。

燕怡和谢炎鹏的死讯被周培熙得知，失去了养女和得力助手的周培熙心力憔悴，苍老无比。

渡江作战已经迫在眉睫，上级指示肖剑秋要尽快弄到江防情报。肖剑秋强忍燕怡去世的悲痛，将全部精力投入到情报搜集工作中来。

周培熙仍然不能完全信任肖剑秋，他向肖剑秋“请教”在当前大形势下，自己该何去何从。肖剑秋深知这次谈话的凶险，对周培熙的几个问题一一作答，周培熙十分满意。告诉他现在能够信任的只有肖剑秋了。

肖剑秋终于利用周培熙的信任拿到了最终的布防情报，此时距渡江作战已只有三天了。肖剑秋和林砚泉秘密赶往江边，准备亲自把情报送过江。二人经过一番生死历险，已成莫逆之交。林砚泉说起渡江作战之后的全国形势，肖剑秋忽然决定留在江南。他要继续发挥自己的价值。毕竟国民党内部还有不少人打算负隅顽抗。肖剑秋与林砚泉挥手告别。

三天后，总攻开始了，与此同时，陈继业率部起义。兵荒马乱之际，肖剑秋发现周培熙已经打算逃往台湾。并要求他一起去，肖剑秋没有说话。

渡江战役，我人民解放军大获全胜。但从此没有人再见过肖剑秋。