半夜出逃的柳氏被捕头王追回，大娘子和氏听到后也从娘家匆匆赶回。现场遗落的匕首成了柳氏杀夫的证据，和氏也一口咬定柳氏心狠。柳氏百口莫辩，当场晕倒。宋慈为其把脉，却另有发现。英姑拿着宋慈为柳氏开的药方去药房抓药，一问，才知宋大人开的原是保胎药。既然柳氏怀有身孕，谋杀亲夫的动机便不能成立。宋慈和英姑一起推案，结论是谋杀李唐者设下栽赃柳氏之计。和员外来访，万般恳请宋大人为其女婿报仇，言词间却泄漏出案发当晚其女和氏情有异常。为解开那把匕首之迷，宋慈和英姑进牢提问柳氏。柳氏却说其实真正把匕首交到她手上的是和氏。和氏有明显的作案动机，但案发日其人留宿娘家，却没有作案时机。宋慈断定和氏另有帮凶。借茶楼监视李府，果然见一男子鬼鬼祟祟进入李府，可马上又被和氏用门闩赶了出来，宋慈一看那男人，竟是前日压价收买过李府家产的旧货店老板贾仁。

正当宋慈百思不得其解之时，捕头王兴奋地闯了进来，交给宋慈一支玉簪。宋慈讯问贾仁，贾仁说是案发日李大娘子失落在他家门前的。贾仁的证词证据和和员外漏嘴的证言，无不印证了和氏半夜潜回作案的事实。宋慈于是便放了柳氏，而将和氏捉拿归案。大堂上，和氏虽然矢口否认案发日回过家，却说不清自己的玉簪怎么会失落在旧货店门口。正当和氏百口莫辩之时，柳氏却来为和氏伸冤。柳氏出示了一包和氏亲手缝制的婴儿衣衫，使和氏因嫉恨柳氏怀上身孕而杀夫嫁祸柳氏的作案动机荡然无存。为解开玉簪之迷，宋慈带着和氏到旧货店，按着贾仁的证词，将和氏跟踪李唐的场面作了演示，贾仁说是先听到脚步声而后才看到和氏身影从门前闪过。宋慈恍然大悟：迷底就在男女有别的一双脚上！

宋慈从狱中叫出梁雨生，有意吟起小姐房里的那首词，梁雨生即说此词是他所作，即写下整首词。又说与小姐只是隔墙遥望，从未私会。刘皓说你把小姐肚子弄大了，还说这话？梁大喊冤枉，说诗文是楼家小儿交丫环，再转小姐的。宋慈想到丫环是关键人物。再去楼宅，丫环已用剪刀自杀。宋慈细察其伤势，认为是他杀。又发觉死者指甲内有血迹，而楼员外左边脸颊恰有两道抓破的血痕，楼夫人说是她睡梦中不慎抓破的。刘知县提出见解：楼员外恨女儿与穷秀才相好，一时气急，将二人推入井中。此事让丫环看到，只得杀丫环灭口……宋慈否认楼员外杀人。要刘皓在全城搜捕凶手，凡脸有破痕者都要细加询问。

英姑暗随一个脸上有抓痕的男人，见其走进一座破落小院。稍后，楼夫人携宝儿去私塾读书，不一会也悄然走进破落小院内，与那名叫袁生的男子幽会。 宋慈、刘皓及楼员外赶到，男人已倒地身亡。众惊。宋慈从容讲出此案的微妙内情。有人密谋“李代桃僵”之计：梁雨生与小姐隔楼遥望而生情，将情诗交学生宝儿送给小姐，宝儿给了丫环，丫环则给了袁生，袁又另抄一份当作己作送给小姐。小姐爱袁生风流潇洒，以身相许。袁生与她相约于订亲夜外逃。订亲之夜，梁雨生喝了许多酒，见小姐的留条，便毫不犹豫追至后花园，懵懵懂懂被人弄至枯井之下。楼夫人说，没想到袁生会做下这种恶事。宋慈却揭出楼夫人的险恶用意：借袁生之手，将小姐害死，另将梁雨生作为替死鬼，最后再弄死袁生。

楼员外质问女人：我待你不薄，为什么还这样做？女人愤然道：我不过是被你花五百两银子买来的卖笑女子，你女儿对我屡出恶语，只怕将来我们母子没有好结果，故而趁早除去，让宝儿独得家产。此案既破。夫人求宋慈与儿子再见一面。女人将自己的一缕青丝交给尚不懂事的儿子。而后，她用刀自刺胸口，拔出刀子交给宋慈，说是杀人凶器……杜松妻子李玉儿离家三月未归，杜母街坊里听到风言风语，拖着病体到豆腐坊责问儿子。妻舅李丁也怒气冲冲赶到，喊着要杜松还他的姐姐。太平知县刁光斗在河边垂钓，来了位秀才讼师贾博古。二人心照不宣，谈定了交易。随后，杜松被传上大堂，刁知县好言好语，说只要杜松交出李氏，街上盛传他谋杀老婆的谣言便不攻自破。无奈杜松交不出人来。刁知县条分缕析，推理杜松因妻子不贤而起狠心，将李氏谋害，抛尸河中……

杜松当堂喊冤，刁知县却也不怒，好言道若交不出李氏，只得将杜收监，李氏何时出现，本案何时具结。时隔半年之后，贾博古来催知县结案。刁光斗绵里藏针地问贾何以对此案如此尽心？贾只得再奉上一张银票。于是，刁知县便对杜松动了酷刑，无奈杜松死不认罪。宋慈下县暗访，路遇李丁运姐姐尸骨回家。宋慈问一堆尸骨何以就能确认死者是令姐？李丁说敢认下姐姐的尸骨，全凭一对祖传银镯。宋慈取镯细看良久，或有发现，遂假称高人，劝李丁停棺七日再下葬。李丁听从了。宋慈入城后，在茶肆听到议论，棺材店老伙计说李氏尸骨里藏着蹊跷。宋慈当即就去桃花渡作实地察，果然可疑。渡船上，又意外得知向官府报称找到李氏尸骨的正是这位以摆渡为业的船家。

杨易从家里找出一个包裹，重回酒店当众打开，竟是百两白银。借着酒兴，杨易声称昨夜在城南门外将一商人推入枯井，夺得这百两银子。众人都当杨易是酒后疯言。老板邹仁想上前劝说，却被杨易一顿狠话堵了回去。第二天一大清早，童非就去提刑衙门报案。宋慈笑道，世上真有杀人越货还到处张扬之人吗？可出于慎重，还是去城南察看，不想果然从井底捞出一具男尸。而报案的童非一见男尸，大出意外地溜了。验尸中发现尸体七孔内有血迹，十指呈黯黑色，即命英姑张贴告示。杨家大姐到城南认尸，死者果然是其夫崔成。宋慈升堂问杨易，杨易矢口否认自己曾在酒店扬言杀人。宋慈问这一百两银子何来？杨易说这银子本是他姐夫带回的！宋慈带杨易到停尸房，死者正是杨易的姐夫崔成。

嘉州银库一夜间失盗二十万两。据报，库监公孙健与盗贼里应内外，盗走官银。公孙健受审时撞壁而死。朝廷上议论纷纷。吏部尚书薛庭松提议急调宋慈至嘉州，协查此案。宋皇应允。宋慈急赴嘉州途中，嘉州衙门派人人迎其上花船，船上有弹琴女子。宋慈怒而下船，骑驴进城。知州范方一副病态出来见宋慈。二人谈话很不投机。宋慈即去狱中察看，追查公孙健尸体。狱吏胡乱找来一具，被宋慈一眼识破。通判袁捷赶至，责打狱吏一顿，令其找到公孙健之尸。袁捷与宋慈乃同科进士，即约宋去家中小坐。袁捷家境清寒，摆设简朴，请客喝酒，仅让妻子买一只猪耳，炒一把黄豆。其子读书刻苦，其妻贤惠，宋慈十分感叹，认为袁甘于清贫，勤于政事，是难得人才。

宋慈到库监公孙健家查探，见其妻疯疯癫癫坐在门前，不与人交谈。又进得公孙家，见屋内抄搜得十分零乱，未有赃物。案情一时难有进展。宋慈故作闲极无聊，上茶楼听曲。一位弹琵琶的紫玉姑娘，性气高傲，给他留下较深印象。又听人议论嘉州两位官员，对贪财的范方深恶痛绝，对干练廉洁的袁捷大加称赞。是夜，袁捷率部得胜而归，称已剿灭那伙盗贼，且获一图纸，得知被盗之银未在运出城，掩埋在城内，且在州衙附近。袁捷要在衙门内挨家搜查，从官员自家搜起。范方闻言，神色慌乱，表示反对，袁捷坚持己见，宋慈则笑而不语。是夜，范宅内似有掘地的响动。通判袁捷悄然走出家门，与弹琵琶的紫玉幽会于一小宅院内……