故事发生在在日本最南端的鸠海岛上，这里的居民只有49人，唯一的公共设施是一所小学，由于没有生源，再过几天鸠海小学即将废止，平均年龄63.5岁的鸠海岛将来也很可能成为无人岛。为了不让自己的家乡变为荒岛，岛民们急需孩子来这里上学。岛民仲间勇造来到东京，他想把七岁的外孙带回鸠海上学，但由于女儿的坚决反对只好作罢。不久，勇造在东京街头与一个叫做藤泽琉璃的女孩相遇，十一岁的琉璃父亲已故，被母亲寄养在福利院里