爱德华与阿尔查出了『贤者之石』的研究场所是「第五研究所」。照理来说应该已成废墟的这个地方，却有着重重戒备与无数的机关。而袭击爱德华与阿尔的两个黑影，死刑犯48号与66号的真面目是……。