老道害怕武三思利用手中的圣旨长期把持朝政，为达到打击其力量的目的，她派南关月装把陶甘和蓝白救出来。张柬之等人把武三思赶下台，还政于太子，决定实行兵谏，一时之间，京城内刀光剑影杀机四伏。陶甘回到狄村把京城中的所见告诉了武则天，但武则天对此半信半疑。张昌宗得知武则天没死的消息后，惊慌不已，叮嘱武三思一定要斩草除根。上官婉儿潜回京城，见到太子，南关月受老道指使欲毒害被囚禁的太平公主。陶甘赶到救下公主，南关月见罪行败露遂服毒而死，死前留下四句暗语。太子不知太平公主的去向，颖是武三思从中掏鬼，因此派人前去兴师问罪。

武则天入京，命张柬之接驾，这让张柬之意识到一个千载难逢的好机会来到了。南关月临死前的暗语使狄仁杰认为操纵整个案件的最终幕后主使即将显现出来。狄仁杰闻之张柬之前来接驾，料定其必生杀机，就在其前来接驾之时，狄仁杰临危不惧，化解了一场祸患。武则天回到京城，将武三思拉出来受审。张氏兄弟二人自乱阵脚，扭打在一起。此时陶甘领兵找到了他们。

狄仁杰想要引出幕后真凶，可惜意图早被对手识破，遂一无所获。武则天被张氏兄弟的巧言令色所打动，下旨赫免了二人。张柬之对此非常不满，迁怒于狄仁杰。狄仁杰在拜见太子之时无意中看见太子妃的书法，字里行间让狄仁杰有所发现。张柬之终于按捺不住，发动兵谏，皇宫内张易之人头落地，武则天心惊胆颤。千钧一发之际，狄仁杰及时赶到，一场事关皇上安危，江山社稷的大乱终于平息下来。 狄仁杰费尽周折，终于找到了上官婉儿，就在案情将要取得重大进展之时，那只一直躲藏在暗处的黑手伸向了狄仁杰。

多日不见的老道终于亲自出马，欲置狄仁杰于死地。为保狄仁杰，轱辘死于刀下，马荣也身受重伤。皇宫大殿之上，狄仁杰面对皇亲国戚，讲述了自己受命千辛万苦得到的调查结果，从人听到事实真相，无不哑口无言。武则天经一番深思熟虑后，终于决定把皇位传与太子。看到皇位又回到了李氏家族手中，狄仁杰心愿已了，如释重负，但他一想起因这场皇权之争而丧生的一个个无辜的生命，不禁黯然神伤。 翌日，新皇登基，朝中一派生机盎然的景象，而这时狄仁杰已经坐在了赶往狄村的马车上。