无名人正是神农的父亲人王伏羲。神农知道了自己的身世以及伏羲和女娲的关系。伏羲坚持凡人可以自强自立掌握自己命运的观点，深深影响了神农。神农重拾信心，与花神汇合。众人前往中岳寻找最后一处净土。

大毛、二毛为报私仇，引蚩尤领兵围困太古城。危难时刻，红姑娘终于出手击退蚩尤。红姑娘拒绝了成为太古城城主的提议。

龙太子修炼有成，斩杀黑龙练成神兵黑龙剑，带领虾兵蟹将前往中岳。

在中岳，花神等人投宿到朱雀家中。朱雀正是那只吃了仙种的仙鸟。青龙、白虎、玄武三人来与朱雀聚会，被龙太子打伤。神农救治了青龙。朱雀察觉天兵前来捉拿自己，假装翻脸赶走了花神等人。花神半路返回，劝走二郎神。四圣兽拜花神为主。

龙太子趁火打劫，偷袭得手。为救众人，五姑娘答应和龙太子成亲。花神帮助六姑娘逃走去找救兵。

在红姑娘和指导下，句芒和赵公子武艺大增。红姑娘也决定离去。瘟神炽突然出现，带红姑娘去见自己的主人。神秘人魔帝展现出无上法力。红姑娘假装屈服。魔帝赐予红姑娘法力，红姑娘实力大增。

龙太子发现六姑娘逃走，担心夜长梦多，决定立即与五姑娘成亲。

五姑娘受魔帝委派，前来救援花神。六姑娘带着土地灶、王灶婆也赶到。红姑娘被龙太子打落山崖生死未卜。土地拼死带花神等人逃出。

花神等人慌不择路，逃进一个山洞，却发现了山洞的古怪。山洞的主人伏羲现身，开启了洞中禁制。龙太子被挡在洞外。

花神了解到封神洞正是中岳净土的藏所。伏羲告诉众人，女娲交给自己的最后一个任务就是守护中岳净土，对众人下了逐客令。

魔帝救起红姑娘，诱惑红姑娘以付出灵魂为代价得到超过龙太子的强大力量。

神农向父亲提出挑战，以净土为赌注。伏羲答应了神农。花神不忍伏羲神农父子相斗，派出四圣兽，迎战人王伏羲。

红姑娘决定接受魔帝的条件。魔帝派红姑娘引走龙太子，保证花神的安全。红姑娘十分不解。

伏羲打败了四圣兽，向神农展示了凡人的力量。神农与伏羲交手间，在伏羲的引导下彻底领悟了如何从大地中吸取力量，却不慎重伤了伏羲。伏羲得到解脱含笑死去，临终前激励了神农。花神终于取得了最后一处净土。

红姑娘引走龙太子。龙太子见自己不是红姑娘对手，想诱骗红姑娘成为自己的帮手，不料却被红姑娘在感情上加以狠狠报复。

黄帝和蚩尤进行最后的决战，黄帝终于杀死蚩尤，完成了统一。

花神等人回到太古城。句芒和赵公子以为红姑娘已死，十分悲痛。魔帝潜入，似乎在上古之瓶上动了手脚。

黄帝统一中原，请花神前来相聚。花神了解了杜康造酒的故事，并把杜康新酿出的美酒命名为五粮酿。

神农在旧居怀念若兮。红姑娘前来向神农索要天下至毒之药。红姑娘不相信神农的血就是天下最厉害的毒药，从神农手中抢走了巨毒九死草。

宝娘极力撮合二姑娘等人的好事，眼见成功在望，十分欢喜。赵公子从句芒口中得知六姑娘等人仙子的身份，互相鼓励，决定永不放弃。

花神想要去取真水，却发现没有东西可以盛放真水。花神想起了夸父族的圣碗，决定重返北岳。

红姑娘找到龙太子，暗示出复合之意。龙太子大喜，答应陪红姑娘回北岳重游故地。

花神等人途经愚公村，看望了愚公等人，却发现一个外来的疯子长相酷似夸父族人，身上也有夸父族的信物。花神带上疯子来到北岳。已成为首领的蓐认出疯子正是自己的父亲。蓐请求神农救治自己的父亲。蓐父却趁众人不注意偷偷吐出了神农的药丸。

蓐父夜晚失踪，大家急忙寻找。

红姑娘用九死草让龙太子暂时失去法力，要杀死龙太子。逃跑中的龙太子把蓐父抓来当人质。红姑娘痛下杀手，重伤了蓐父。花神见红姑娘为报仇而变得疯狂，拦下了红姑娘。红姑娘和龙太子被魔帝救走。

蓐父醒来，神智变得清醒。蓐父告诉蓐关于夸父族人天生心脏缺陷，夸父都死在了追日途中的情况。蓐感激花神，把圣碗交给花神。

红姑娘受到了魔帝的惩罚。花神这边也发觉救走红姑娘的黑影很像当初在西岳出现的黑影。