1933年抗日战争爆发前夕，华北形势告急，故宫博物院决定将馆藏精品转移，以避战火浩劫。自此之后的15年中，近百万件故宫文物历尽艰辛坎坷，行程数万公里，由北京经上海、南京辗转运抵四川。四川重庆，成群的学生在街小游行，要求政府抗击日寇，还我河山。军统抓获了云海后进行逼供审讯，云海的真实姓名是王全林，他是中共重庆地区地下党的联络人，军统还抓获了王全林的女儿珍珍，他在一旁都看到了，他已经被捕五个小时，面对军统的威胁王全森只好说出一些情报。叶钊在咖啡厅和从延安来的同志接头时发现有特务，他们急忙逃走，他在掩护叶钊时被特务开枪打死，邱同开车将叶钊接应走。

邱同和叶钊逃走后怀疑有内奸，邱同让他去联络站找云海，叶钊向王全林说起接应之事，王全林已经叛变，叶钊还不知情。邱同在开会时对叶钊召集众人开会表示质疑，他们发现可疑人员后急忙彻离，但发现有特务守在门口。叶钊带着邱同离开时邱同胳膊受伤，叶钊让邱同藏好，他将特务引开。王全林向军统汇报说延安来的特派员跑了，他不知道朝天门死人的身份，只清楚特派员叫邱同，邱同来重庆只是路过，他的目的地是峨眉山。

邱同怀疑名单上的同志可能牺牲不少，他安排任务给叶钊，掩护身份是文物店的老板，要以南京文物专家张金石的身份潜入峨眉山的大佛寺，张金石不仅是文物专家，还是被日本人收买的汉奸。邱同让叶钊不要相信任何人，叶钊要寻找那些失散的文物并查出大佛寺的内奸。王全林见到邱同后向他问起来重庆的任务，邱同称任务的纸条已经烧毁，他知道王全林掌握着很多同志的联络方式，王全林面对质问拿枪指住了邱同。

日军得到消息称从北京故宫转移的七千箱宝藏就在四川峨眉山之中，他们也想得到它。峨眉山大佛寺的王教授在造册文物时突然倒地身亡，柳营长赶到后想打开时被拒绝，但他还是强行打开，他向人问起王教授死亡前的情形，专家解释可能是神鬼因素所致，柳营长让他们暂时不得与外界取得联系。峨眉县沈敬斋县长准备把专家王教授的死上报为自然死亡，他得知有新的文物专家过来就放心了。

柳絮飞看到字条后让人追回那封信，他看到信后了解了王怀古死前的想法。军统听说过中共有代号云豹的特工，王全林怀疑邱同可能是云豹，邱同被捕后啥都没交待，他没想到云海会叛变，军统没得到有价值的线索就开枪打死了邱同。叶钊按邱同的命令以张金石的身份赶往峨眉山大佛寺。大佛寺的日本特务正在执行龙脉计划，王怀古没和他们合作。沈婕回到家后沈敬斋很高兴，他送给她新衣服，她没想到报纸上的文章很快就发表了，沈敬斋担心她的安危。

柳絮飞想对王怀古进行尸检，沈县长建议他不要深究，还想把他和沈婕的婚事给办了。沈婕有些事情想不明白就去找闻教授询问，他们的谈话都在监听之中。柳絮飞加强了大佛寺的岗哨工作，他怀疑内部可能有问题，白玉兰看到后她的照片后很生气，沈敬斋从中调解，他让他赶快把那些东西都收起来。

叶钊以张金石的名义在峨眉山下船，同船一人看出他为那七千箱国宝而来。白玉兰的上级让她不要暴露身份，她的实际身份是日本间谍，她要想办法和张金石取得联系。沈姨感觉到中国到了最危难的时刻，柳絮飞没看出她的性格还有这一面，沈敬斋在吃饭时说起白天反对柳絮飞之事，他认为事情没那么简单，有可能会牵扯到更大的利益集团。

沈敬斋晚上接到玉林街金店被土匪抢的消息后就过去了，丢的都是真金白银，店老板很着急，所幸器材完好，沈敬斋是峨眉山军统站长，他的掩护身份是县长。叶钊下船后被军方接走，沈婕带领学生在街上演讲，叶钊看到她站在台上，军警来到现场后一片混乱，叶钊接住了从台上掉下来的沈婕，她被吓了一跳，沈敬斋出现后将她带走，沈婕对叶钊的帮忙表示感谢。

王全林成了重庆地下党组织的最大嫌疑人，他也成了军统一员。柳絮飞给叶钊介绍了大佛寺和那里文物的情况，叶钊不想在下班时间内被干预。叶钊见到了沈敬斋，两人这是第二次见面了，第一次是在混乱的街上。日本特务见到过江龙提起大佛寺的宝藏，大佛寺有一营国军兵力驻守，日本人称只想要所有文物中的一件，还说有内应在大佛寺，过江龙因利益被利用，他看到日本人身上掉的项链，还怀疑他是外国人。

沈敬斋让沈婕以少参与政治活动，她对国民党的看法不好，沈敬斋向她说起在街上遇到的人就是文物专家张金石。白玉兰得知军统工作的重点是抓共产党，日本特务准备从中伺机得利。沈婕去找叶钊表示感谢，还带了特产过去，她以前是重庆女专历史专业的，沈婕想坚持自学，叶钊给她一些建议。柳絮飞见沈婕出来就和她一起去湖边儿散步，她说起在街上叶钊救她之事，她辍学后感觉价值观有些迷茫，听完叶钊的话后明朗开来，柳絮飞让她不要轻信别人之言，她清楚自己应该做些什么。叶钊发现了那个十字架后怀疑是日本人内应放在那里的。

柳絮飞对叶钊进行检查，叶钊的全身被搜查，他在他在身上搜到那条十字项链，柳絮飞还让他脱裤子检查。军统对民主人士进行监听，还掌握了他们全部的资料。柳絮飞认为抓共产党会破坏国共联合抗日，沈敬斋对他的想法有些担忧。

白玉兰时刻盯着大佛寺的专家们，专家们都没见过这么多的文物，他们对于遗失的文物有些遗憾。叶钊是故意戴那个十字项链在身上，他也注视着白玉兰的动向。盛老板也找到过江龙，过江龙说起有人来说谈合作之事，盛老板自称认为国方的人，过江龙想多要几条枪。日军想国快龙脉计划，还起用了新的电台和密码，它藏在张金石身上。

王全林在军统会议上被表扬，他愿意再立新功。叶钊来到教堂和日本特务最得联系，对方要电台和密码本，他的回答应滴水无漏。柳絮飞和沈婕想等抗战结束后再结婚，沈敬斋不想让他去前线，沈婕也想去。叶钊不想把电台和秘密本那么快交到神你手上，他还没有破解，叶钊准备利用柳絮飞来缓解时间。

叶钊在晚上故意弄晕一名士兵，柳絮飞知道后命士兵马上集合，整个大佛寺紧张起来。柳絮飞将专家们请到了会议室，叶钊再次去见神父时说大佛寺戒严，很难将电台和密码带出来。盛老板看到叶钊后追赶出去，但出门后发现他不见了。盛老板被过江龙的人抓起来搜到一张银票，过江龙认为他是军方派来的人，他说教堂的人都有那个十字架。

叶钊准备和组织上取得联系，虽然没查出大佛寺的内应，但神父已经暴露。青龙帮的土匪在夜里去在佛寺打探消息时被枪打死，柳絮飞从他们身上的图案看出来。柳絮飞根据情况对大佛寺进行戒严，任何人不得私自外出，这让叶钊有了不交出电台的理由，但无法和组织上接头，他看到电话后给沈县家找去电话，沈婕接到电话后知道是叶钊，她答应亲自去接他喝茶，两人去了峨眉山茶馆，叶钊在喝茶时说出和组织上联络暗号。

峨眉山茶馆的老董收到接头同志的消息后亲自过去查看，他认识邱同，老董派人盯住叶钊，看他和谁接触。沈婕认为叶钊是风趣之人，他认为女人靠智慧才能比男人更强。叶钊没能联系上组织，他听伙计说完后提出要方便一下，他出去时遇害上了盛老板，盛老板一直在找他，他将一叠钱塞在他手上要走时盛老板向他要枪，他知道他在军队里有路子，还清楚叶钊是冒名顶替，叶钊只好答应下来并相约下次交易，沈婕在远处看到他们在一起。

老董让伙计调查一下叶钊和盛老板，沈婕对当局失去信心，她感觉全力军民应该以抗日救国为主。柳絮飞整日忙于工作，他抽空去看望沈婕，两人谈起书上的内容。盛老板被过江龙的人威胁，他是即想得钱又想保命。大佛寺的教授们都感觉是报国无门，他们的遭遇都差不多。

老董从上级那里知道邱同已经在路上牺牲，他让人断绝和地上下党上的一切联系，并等待时机。沈敬斋回去后对沈婕询问起张金石和柳絮飞，她认为和谁交朋友是自己的自由，沈婕从小学西方文化，沈敬斋让她以后不要去大佛寺找张金石。王玉兰将张金石的情况汇报给神父，神父清楚文人最大的弱点就是胆小，他要让他手上沾上同胞的血。

柳絮飞加强了大佛寺里外的防卫，沈敬斋让他晚上值夜班的时候可以找副官，但柳絮飞还是要亲力亲为，他提出要在藏宝室周围安装德工的防盗门，柳絮飞想通过父亲解决资金问题时被沈敬斋阻止。叶钊在文物里见到了清朝玉玺。

沈敬斋命人对闻教授多加监控，白玉兰看到叶钊给沈婕打电话，沈婕接完电话后坐车去接叶钊，她感觉去陪他喝茶有些不太方便，沈婕将他送到茶馆后就离开了，盛老板如约而至，他向他问起军方朋友的情况，盛老板再次提起枪的事情，叶钊说那没问题，他让他跟着自己去教堂，叶钊清楚有人跟踪，到教堂后两人进了房间，叶钊将盛老板打晕后注射麻醉药时被神父看到，神父交给他一把刀子让他杀死盛老板并拖到后山掩埋。

叶钊等神父出去后用刀子结果了盛老板的生命，然后将他拖到后山掩埋，神父在一旁看到，叶钊故意表现出惊慌和害怕的样子，神父向他问起电台和密码本何时才能带出，他想问出大佛寺是否有同僚，可神父让他和自己单线联系，他会想办法解除大佛寺的戒严。过江龙找胡秘书谈话，胡亦中回去后被沈敬斋问起，他留下这些土匪还有用，胡亦中只好过江龙发去帖子。神父将叶钊杀死盛老板的情况告诉了白玉兰。

军统得知日军的龙脉计划，但不知具体内容。沈敬斋接到王全林被派到峨眉山的电话，他不清楚毛局长是何用意。毛局长派王全林去峨眉是想让他打入到共产党的内部，王全林的体内被注射了吗啡，在他执行任务前还带了两盒。叶钊对日军密码本进行研究，可没有破解，他怀疑密码本中采用了加密手段。

王全林走之前去看望女儿珍珍，她是他唯一的亲人。王全林初次来到峨眉，他不知是福是祸，他选去找沈敬斋报到，沈敬斋对他的到来表示欢迎。白玉兰向神父汇报工作，她也认为叶钊学识渊博。叶钊发现真的密码藏在钢笔中，那本书只是假象。王全林被峨眉山地下党组织盯上，老董命人不断跟踪以打听他的身份。

白玉兰晚上带着混沌去了文物专家那里，她打听着玉玺的详情，了解到有些玉玺下面还有微型地图。叶钊见白玉兰带着夜宵前来，他将她请入房内，那是有名的峨眉山抄手。沈敬斋让沈婕在家里好好准备一下和柳絮飞结婚，她一直把他当哥哥看待，沈婕还没有结婚的打算，她希望父亲能听一下自己的意见。

沈婕希望她爸能理解自己，她想做出对国家有意义的事情。白玉兰向沈敬斋和柳絮飞提出解除大佛寺内部禁令之事，柳絮飞表示反对，他的计划得到了沈敬斋的认可，柳絮飞坚持按自己的想法来办，沈敬斋同意安装铁甲门，但对专家的人身限制还是不用军事管理为好。白玉兰将新的文物造册记录交给沈敬斋，他们认为叶钊真是个人才，叶钊解决到一个重要的问题，他找到了密码和电台波段，只是仍没有破解电文。沈敬斋让胡亦中没要再派人调查柳絮飞。

沈敬斋知道王全林在寻找目标，他派人紧盯他，王全林不想大张旗鼓活动。叶钊去喝茶时见到了神父，老董通过望远镜看到他们在一起，他没见过穿长衫的神父，老董根据情况没有和叶钊接头，他担心叛徒的出卖。柳絮飞想让沈敬斋下命令出兵剿匪，他清楚那些土匪正觊觎大佛寺的国宝。柳絮飞化妆侦查时因救人打死了土匪，随后被成群的土匪追赶。

沈敬斋说出不剿匪的原因，他让柳絮飞要管土匪的事情。王全林到诊所找吗啡时得知只有县医院一家有，沈敬斋派人打听到他的动静，毛局长知道像王全林这样的人会有一个反复期。王全林给自己注射吗啡，盒子里的数量越来越少，吗啡在市面上是违禁品。王全林钭毛局长送的东西转送给胡亦中，他想通过他了解更多的事情。

柳絮飞拿着他妈从香港买回来的衣服送给沈婕，沈婕希望将钱花在抗战上。神父担心叶钊不交出电台会有变故，他让白玉兰扫除障碍，白玉兰知道没那么简单，神父让白玉兰查清楚叶钊的行动。沈婕陪着柳絮飞在街上散步时见到叶钊去了茶馆，在沈婕的提议下他们一块过去打招呼，他们的会面被老董盯着，沈婕感觉柳絮飞对叶钊说的话不太好，她对叶钊的印象很好。

叶钊在街上被王全林发现，王全林怀疑邱同将任务交给了叶钊，他想把情况汇报给重庆。叶钊看完纸条后知道师傅王全林到了峨眉，他还不知道王全林投敌叛变的事情，两人在约见的地点见面，叶钊高兴地和他抱在一起。叶钊将邱同的任务告诉了王全林，他的任务是查清日谍，王全林说邱同还没来得及说出任务就牺牲了，叶钊将神父是日谍的情况告诉王全林，白玉兰也值得怀疑，王全林让叶钊继续潜伏下去，可叶钊清楚文物并不是他的专长，他担心自己暴露。

老林带领地下党组织成员发现王全林和叶钊在一起，他们怀疑叶钊也是叛徒，老董事前知道王全林是叛徒，他建议他们来峨眉山的目的。叶钊不能这么快将电台交给神父，他看到钟表后怀疑可能是收报的时间不对，怀表的指针一直停在九点钟，他打开收音机后听到一组数据，叶钊怀疑密码盘藏在怀表里，试过之后他破解了日军密码，这下可以放心地将电台和密码本交给神父了。王全林通过胡亦中弄到了吗啡，他对他的帮忙表示感谢。王全林向毛局长汇报日本间谍之事，他的电话被沈敬斋监听，王全林在毛局长面前大力夸奖胡亦中，还说沈敬斋在工作上有些怠慢。