共党几人虽获得了黑索金设备线索，但却解不开里面的信息，为此林莎专门趁俞北平不在时拜访俞北平住所。正巧她为徐丹妮新买的钢琴缺少木塞支撑，林莎便借着找木塞的借口进入地下室寻找线索。

何群同郑翊在河边见面，何群告诉郑翊自己觉得俞北平对党国没有问题，而郑翊却道那些特调局人都有私心，俞北平的事也并未如此容易便能甄别。

林莎同唐进义见面，告诉唐进义郑翊他们已经发现了他们的意图，因此他们现在情况很是危险，同时他们也推测出线索恐怕同清城市的图书馆有关。

郑翊来到俞北平的病房，告诉他林莎很有共党的嫌疑，并假意向俞北平为自己以前的肆无忌惮道歉，提出待他伤势好转，两人便联手抓住林莎的把柄。等出了病房后，郑翊的面色沉了下来，严令候在病房外的下属要监控俞北平的一举一动，尤其是同林莎会面时。

林莎找程忠义要了进清城局证物室许可证的签名，顺利查看到了所需的线索内科手册上册，却不料这一幕落入了舒晓梅眼中。郑翊得知林莎果然如她所料，去图书馆查看了线索后，很是兴奋，因为只要坐实共产党插手黑索金的事，比基尼第二阶段计划便能顺利完成。

林莎从清城局得知“归人值落叶，唯将往来信”这两句接头暗语后，同唐进义推测出内科手册下册或许便在市立图书馆中。而与此同时，俞北平知道林莎离郑翊布下的陷阱越来越近，心急如焚，他知道自己必须想一个妥善的办法助林莎度过危机。

办公室里，程忠义看着自己同林莎于相恋时拍下的照片，一边回忆两人从前的点点滴滴，一边郑翊对林莎所下的封锁令在自己脑海里不断回想。在接到郑翊电话后，程忠义赶到郑翊办公室。郑翊向程忠义质问为何隐瞒同林莎交往过的事，并旁敲侧击地警告他。

林莎为掩护自己目的，特地向安德森汇报自己关于内科手册的发现，并提出要去市立图书馆查个究竟，安德森很是支持。同时，安德森提出要林莎跟随自己看望俞北平。随后，林莎到在一家书店买了一套内科手册，郑翊安排监控林莎的下属则是暗中观察，一路跟踪。

安德森带林莎看望俞北平，俞北平趁此机会提出让徐咏仪同林莎去市立图书馆购买自己所需的书籍。林莎同徐咏仪到了市立图书馆后，林莎拿出自己买的那套内科手册，说要还去年那位姓黄的朋友的那套内科手册，并借着借书的时候，道出了那两句暗语。宾妮见来的两位人一位只道暗语，一位持有信物，既知共党同志就在其中，也深知自己已经陷入国党特务的包围中。而事实也正是如此，她们的对话正被郑翊方全程监听到。在将信物成功交给林莎后，郑翊正好带人闯了进来，宾妮情急之下破窗而逃，却被国军几枪击毙……

林莎命令下属全力抢救宾妮，死命抓住这条线索。而林莎和徐咏仪被林莎带回了清城局，林莎表明她们从图书馆所携带的书要送到技术部门检阅，并对她们提出要搜身，徐咏仪无奈同意，而林莎由于携带共党情报，一旦被搜身，后果不堪设想，因此坚决不同意搜身。

医院里，俞北平回忆着他同林莎接触以来的点点滴滴，林莎是他丢失多年的女儿，他怎能忍心见她身陷囹圄。

正在林莎和郑翊等人僵持之际，安德森赶到会议室，告知他们林莎去市立图书馆的行动是受他批准，但郑翊等人则质问林莎为何能对上暗语，并放当时的监听对话给安德森听。林莎镇定辩解，而郑翊紧紧相逼，最后林莎同意搜身。

与此同时，宾妮因伤势过重，抢救无效去世，国军只能失去了这条线索。而徐咏仪回医院后，就把遭遇的事情悉数告知俞北平，俞北平听说林莎要被搜身很是担忧。

郑翊等人并未从林莎身上搜出宾妮给的新书单子，林莎便反过来质问他们诬陷自己，郑翊只能先放过林莎。而此时正在探查宾妮状况的程忠义却拿出了新书单子，并将其点燃冲进了下水道，原来林莎竟然趁乱将新书单子交给了他。

随后，郑翊同安德森交谈林莎的身份问题，但安德森虽同意苏俄插手中国国内战争，但并不因此怀疑林莎，并告知郑翊苏联在大连建立了大型兵工厂。待安德森离去后，林莎因程忠义帮林莎打开过车门，而当面怀疑程忠义，程忠义忙表明忠心，暂逃一劫。

林莎同唐进义接头，告知唐进义自己把新书单子交给了程忠义，之后唐进义让林莎离开此地，但林莎不同意，她不能让宾妮白白牺牲。

南京对郑翊下达命令，要求启动“比基尼”计划第二阶段。郑翊决定启动二阶段，同时也要甄别俞北平。随后，郑翊来到狱中看望王杰，王杰早已在其严刑拷打下屈服，并同意此次出去便帮郑翊查出在清城局的共党特务。为将局做真，郑翊故意将王杰脖子割伤，让他在被送往医院的路上逃跑，王杰依言行事。

俞北平总算出院，在回住所的路上，他再次向下属详细了解图书馆事件，为破郑翊的局做准备。俞北平回家后，林莎等人前来看望，俞北平因为确认了林莎的身份，很是高兴，并劝徐咏仪安心收下林莎送徐丹妮的钢琴。而徐咏仪察觉到俞北平对林莎态度的转变，满腹疑虑。

俞北平和程忠义来到市立图书馆向前台询问当时的详细情况。俞北平趁此机会将他从林莎包中拿到的一支钢笔放入了前台的抽屉。程忠义在搜查时发现林莎的笔，便将其藏了起来，俞北平见程忠义入套，心中暗喜。从图书馆离去后，俞北平约程忠义到凯司令咖啡馆相谈。

此时，何群和郑翊为启动二阶段商量用苏联的设备炸美国战船的相关事宜，好让美军以为苏联介入，从而加入战场。

在咖啡馆里，俞北平将自己推测出来的程忠义为林莎掩护的事呈现在程忠义面前，程忠义忙表明自己并非共党。而俞北平则表明自己对他的信任，同时也道明自己同林莎都不是共党，图书馆事件都是特调局的人为了内斗，要将自己和林莎下台。在商谈过后，趁着程忠义去洗手间的时候，俞北平竟然从桌边的暗格中取出了宾妮的情报……

原来俞北平从宾妮跳楼自杀推测出情报并不在图书馆内，同时，宾妮交给徐咏仪书的编号正好能拼成狗的英文，而凯司令咖啡馆的门前便是狗的雕塑。经过这些信息的整合，俞北平成功推测出宾妮将情报放在了开始林咖啡馆的一二六号桌。

而这此时，何群等人正因王杰的成功逃亡而震怒。而技术处处长张炳坤正受郑翊的命令修复遥控爆炸器，由于缺少部件，他向舒晓梅询问，却遭舒晓梅拒绝。

俞北平回到特调局中，郑翊故意告知他王杰成功逃亡的事情，想引他入局。俞北平提出让郑翊晚上到自己住所吃饭。随后，俞北平从窗户望见张炳坤正同何群正在交谈，张炳坤平时清高，必不会做溜须拍马的那一套，他的异样引起了俞北平的怀疑。

林莎约程忠义见面，程忠义告诉林莎自己已把东西销毁，由于他很是相信俞北平的那套说辞，对林莎毫无怀疑。林莎见此，便正好顺着那套说辞掩护好自己身份。同程忠义分开后，林莎同唐进义见面，告知他目前的情况，而唐进义则告诉林莎通过越狱成功的王杰得知宾妮可能没有死，并决定要同王杰见面。

俞北平根据宾妮的情报到美军港口俱乐部后台，借着见玛丽小姐的托词，通过观察后台的摆设发现了一条通往日军地下仓库的密道，在其中发现了黑索金设备。但是由于这处地方在美军巡逻队的范围内，共党根本无法运输出这批设备，同时，组织对俞北平的甄别也迟迟没有结果，这不禁让俞北平感到焦躁不已。 

林莎在街上遇到徐丹妮，便邀请徐丹妮一同喝茶，而徐丹妮便正好对林莎提出中秋节要请她到自己家吃饭，林莎欣然同意。而徐咏仪见徐丹妮对林莎态度亲昵，很是不快。随后，林莎趁着和徐丹妮到俞北平书房，仔细搜查了俞北平书房一番。

而这时，吴昆才正在家中对何群大发对郑翊的牢骚，随后，被吴昆才邀请来的范自强进门，并送何群夜明珠来讨好他。这三人商谈后准备结成同盟，以在特调局立足。

与此同时，郑翊、林莎同俞北平及其家人一起吃晚饭，在中秋节的氛围下，几人相处和乐融融，看似已化干戈为玉帛。随后，郑翊故意提出宾妮还存活着，俞北平却对此提出了质疑，林莎因此发现了些许异样，她开始怀疑王杰是一个圈套。这时，吴昆才等人也正好提到王杰，他们互相间道明王杰是郑翊安排的一场阴谋。

程忠义自发现何群等人正在研究遥控爆炸器后，就在当晚潜入了技术部，试图获取些情报。而张炳坤则正来到胡晓梅办公室，通过送她手镯，成功得到制造遥控爆炸器的元件。

吃饭间，俞北平接到电话，得知共军已向济南发动全面攻击，郑翊等人听此消息，决定回到办公室，以应对此次事件。等林莎、郑翊等人离去后，俞北平在暗室将林莎同自己家一同照的全家福洗出，看着这张全家福，俞北平心里很是感慨。

回办公室后，郑翊安排下属明日中午十一点在鲜花广场通过王杰抓捕唐进义，并派人通知安德森，好让“比基尼”第二阶段顺利进行，同时也安排局里其他一切正常运行。

而俞北平正在家中回想着郑翊晚饭时所说的话，当时他知道郑翊要引林莎入圈套，特地隐晦地道出王杰的异常，也不知林莎是否能够发现王杰的叛变。徐咏仪因为俞北平对林莎态度转变突然，以为俞北平出轨爱上林莎，一时间伤心不已，暗自垂泪。

第二日，俞北平来到特调局，程忠义因为完全相信了俞北平当初的说辞，便站在了他的那边，将郑翊要抓捕唐进义以及张炳坤等人研究遥控爆炸器的事情悉数告知于他。等程忠义离开不久，郑翊正好进来通知俞北平准备抓捕唐进义。而此时，美方正催着清城局尽快将宾妮的案子结案，好抓到苏联违反雅尔塔协议的把柄。

随后，郑翊、俞北平一行人前往鲜花广场，严阵以待。程忠义按郑翊命令通知安德森到现场一同抓捕王杰。

临近中午，唐进义的身影果然出现在了广场附近。共党察觉不对，便对暴露的国军开了枪，局势顿时一片大乱。事先安排好的国军因此倾巢而出，将鲜花广场团团围住。一名共党为掩护同志，吸引火力击杀了叛徒王杰，之后便被国军乱枪打死。而唐进义则趁乱躲在了俞北平所乘车辆的后备箱，安全逃出。郑翊等人从这名共党尸体上发现了一张图纸，得知共党要修建电台，而安德森提出要将这张图纸带回美方仔细分析后，再做结论。

徐咏仪在逛街时看见了一家侦探事务所，她近期因怀疑俞北平出轨而终日不安，便兴起找侦探杜明达调查林莎和俞北平两人的念头。杜明达得知俞北平身份后，本想退缩，但在徐咏仪的强压下只能接下了这笔生意。

迟又一的妻子带着孩子童童到学校找徐丹妮，告诉徐丹妮迟又一最近在睡梦中总喊她名字，并提出让她多关心迟又一。徐丹妮知道自己同迟又一的事已经被他妻子知晓，一时间愧疚又无措。

唐进义逃出生天后，同林莎在酒店见面。由于唐进义已经暴露，林莎便交给他出城证明让他赶紧离开清城，而唐进义临走前交代林莎，等他走后，宏达电台的音乐节目便会成为共党新的传递情报的方式。

林莎回住所后，想起她在中秋晚上在俞北平书房那本笔记里撕下的那页纸。待她用铅笔涂画出纸上的残留的笔痕后，通过纸上呈现出的那首诗，她惊骇地发现俞北平便是她的亲身父亲，同时，她也知道了俞北平已经知晓她的身份却不与她相认，一时间痛哭出声。

从鲜花广场回来后，郑翊召开会议。下属告知她他们追丢了一名共党，连云海鲜楼的伙计郭福根。此人经查探是共党情工人员，并且此人身份可能比王杰更为重要。与此同时，唐进义已顺利回到共党，并告知组织俞北平在他逃亡时暗中交给了他黑索金设备埋藏地点。组织因此也确认了俞北平的忠心，决定要和俞北平联络打配合。

林莎根据唐进义提供的线索，通过收听宏达音乐节目，来获得组织信息。同时，唐进义也告知了她组织新派下来的联络人会在晚报第四版登出一条寻找侄女的广告，而同联络人的接头暗语是“有没有带乐谱回来，已经在你包里了”。

组织重新同俞北平联络，并对他下达新任务，这让俞北平很是高兴。而在特调局方面，程忠义已站在了他的一旁，这对他获取郑翊那方的情报有很大益处。根据从程忠义处获知的关于张炳坤制作遥控器的消息，俞北平找到舒晓梅，质问她张炳坤从她那边获得元件的事，舒晓梅只能如实交代。

另一面，美方正在分析从共党获得的那张图纸，结果却一筹莫展，只能暂时将其搁置。美国同苏联派观察团来清城秘密商谈三天，安德森安排林莎作为此次观察团的翻译，林莎欣然应允。

清城因美苏谈判而局势紧张，但郑翊觉得这正是他们执行“比基尼”计划二阶段的大好时机。她已经向南京报告，明晚会炸毁美方最大的间谍船玛格丽特号，以引起美苏的矛盾。郑翊等人为这次行动研制了称号为小胖子的爆炸遥控器。此遥控器由于是国军自主制作，很好被美方辨别。为避免美军通过遥控器得知是国军所为，郑翊吩咐下属在今晚将其放在美军港口俱乐部中。美军港口俱乐部正好位于玛格丽特号停靠的三号码头附近，是放置小胖子的最佳位置。

此外，为了避免俞北平搅局，林莎特地跑到俞北平办公室敲打他。而俞北平则早知郑翊的打算，为不让她得逞，俞北平早便计划将通过程忠义从张炳坤处拿到的另一个爆炸遥控器带入今晚美方举办的招待会，以揭露郑翊的阴谋。为此，俞北平将爆炸遥控器放置进了洗手间，无巧不成书，张炳坤也将爆炸遥控器放置在了洗手间的同一个隔间里，好在两者放置的位置不同。

晚上，美苏谈判结束后，美方在俱乐部举办招待会。俞北平受邀前往，通过和安德森的交谈，对美苏谈判有了大概了解。随后，俞北平在美方谈判代表讲话时，来到厕所拿出了爆炸遥控器。而这时，张炳坤也来到了厕所拿爆炸遥控器。好在有惊无险，两人正好交错而过。

林莎告知安德森自己得到情报共党郭福根混进了此次招待会，安德森要求安保人员严密巡查。

商讨结束后，俞北平假意离开会议室，实则躲在门外偷听郑翊等人谈话，从而得知郑翊是故意捏造有共党混入的假象，实则是要借机将玛格丽特号爆炸的事嫁祸给林莎。俞北平听此，便匆匆离去，哪知郑翊等人早知他在门外窃听，此话是故意说给他听的。

在郑翊和张炳坤借搜捕共党的借口带人搜查俱乐部时，张炳坤惊愕地发现自己先前设计的带有局里编号的爆炸遥控器居然出现在了现场，顿时惊慌不已。见遥控器被美军发现，郑翊也是猝不及防，她忙阻止何群启动爆炸遥控器，并让他通知吴昆才启动应急方案。

而与此同时，俞北平正同林莎在俱乐部下的日本地下仓库碰了个正着，原来俞北平便是林莎新的接头人。

吴昆才启动了应急方案，安排一队国军围在港口，不管安德森阻止，对郑翊事先派出的在玛格丽特号上安装炸弹的，也是郑翊本就准备要牺牲掉的国军们全部射杀。为了跟上头交代，安德森只能将郑翊、俞北平等人都押回港口指挥部。而张炳坤知道自己捅了大篓子，忙找关系去跟郑翊求情……

为了让美方同苏联的矛盾更为尖锐，郑翊在安排炸毁玛格丽特号间谍船的同时，也安排了下属去炸毁美方商洛路军火库。玛格丽特号事迹败露后，宋强和张炳坤匆匆赶往军火库，想阻止军火库被炸毁以避免更大的事端。

不料姜平和范自强已经进入军火库，联系他们停止行动已为时已晚。

张炳坤知道今晚的事同自己脱不了关系，便请求宋强帮他脱罪，但宋强却提出让他自己把这事扛下来。在张炳坤诧异之际，宋强一枪将其打死，并将他的尸体放置在了吴昆才家中。

宋德森和林莎一同审问郑翊、俞北平等人，郑翊和俞北平一口咬定这次的行动是吴昆才个人所为。安德森也没有其它有力证据，只能等下属逮捕到吴昆才再做打算。

宋德森下属在吴昆才家发现了张炳坤的尸体，并找到了一个装有许多图纸的纸盒。安德森得知后，正要让下属去探查纸盒中图纸所显示的地址——商洛路军火库，这时，那军火库正好被郑翊安排好的人引燃，从而发生了爆炸。美方由此初步断定此事是吴昆才所为，便放了郑翊等人回去。

俞北平和林莎在一同回去的路上互相交流情报，俞北平告知林莎国军关于“比基尼”计划的第二阶段，并提醒她要谨慎行事。与此同时，郑翊在同何群在回去的路上，道明张炳坤的遥控器出现在招待会现场是俞北平所为，并提出要启动应急方案，找到吴昆才。回到办公室后，郑翊由于计划完全被俞北平破坏，情绪极不稳定。而国军前线战局的连连失利，让她更为焦躁。

而此时，被各方通缉的吴昆才正躲在舒晓梅处。原来吴昆才同舒晓梅私下有情人关系，舒晓梅询问吴昆对今后的打算，吴昆才表现的很是镇定，甚至还同舒晓梅调笑。随后，舒晓梅在外出买饭的时候遇到了何群，忙赶回家让吴昆才躲起来。怎料，何群早便知晓吴昆才躲在舒晓梅家里，吴昆才无奈之下只能出来同他见面。

吴昆才用枪指着何群并质问他为何要栽赃自己。面对吴昆才的激烈反应，何群却是平静如常。在何群的劝说下，吴昆才总算平复情绪，愿意同他交流。

俞北平约林莎见面商谈关于军火库爆炸事件以及郑翊的最终目的，并提出他们近期要以不变应万变。随后，俞北平沉默许久，终于开口对林莎道歉，表明自己想要恢复两人间的亲情，却遭到林莎冷硬拒绝。而两人交谈的画面，正被侦探杜明达全数拍下。

特调局里，范自强向郑翊报告关于炸毁美方军火库的事。郑翊对范自强下达新任务，要求他假装离开清城，实际在清城扮演一个表面为苏联观察团翻译，实则为苏联情工人员的人，李可夫。范自强接受指令。

美方因军火库爆炸事件，受到了清城群众们的排斥，这让他们对罪魁祸首很是恼火。

而南京方，由于“比基尼”计划面临崩盘，郑介民找徐文正商谈此事，同时，提出有两件事亟需解决，一件事是结束清城乱局，另一件事是找个替死鬼将玛格丽特号和军火库的所有责任扛下来，以好向美方交代。徐文正由于不确定俞北平身份，不同意将俞北平推出去，并用自己的性命作担保，要求上头给予两个星期的时间来让俞北平和郑翊解决好此事。

安德森告知林莎苏联谈判小组正在美方安排的哈德逊商务旅店，并提出吴昆才可能同苏联勾结在一起。与此同时，何群正劝吴昆才投奔苏联远东情工局，为党国做出牺牲……