永乐年间，惠帝撤藩，燕王朱棣挥军入京，惠帝失踪，朱棣即位，是为成祖。二十年成祖励精图治，国泰民安。 繁嚣的闹市里，一少年哮喘病犯，一女子为其一针治愈！此女正是平一姑！少年向其子初到京城，跪拜！坊众即蜂拥上前让一姑医病。原来青年乃一姑的儿子平常。母以假医术骗人，赚点小钱！ 赌坊里，平常遇一名肮脏似流浪汉的王九，三人结伴而行。 因街头医一女子，平常假医术被医术高明的农草堂揭穿！ 段天命当街为成祖当前红人太监郑和医病，令平常佩服不已！

平常费尽心思想拜天命为师，赫然发现，原来草堂正是天命之徒。 天命只医官宦贵胄，且不收出身不好之徒！为了扬名声，决定五日后考试！ 平常在天命医馆门外，遇到一女子偷看馆内情况，正是素问！两人发生误会，互相留下不好印象！ 平常在王九暗助下通过考劾，进入了天命医馆。其实天命无心收他为徒，只安排他作杂务。 素问夜入天命医馆，被天常发现。原来素问乃天命女儿。天命喜见女儿，得知素问偶有梦游！婆婆赶来，要带素问离去！天命只感无奈！

天命再三恳求留下素问，但仍被婆婆强行带走。 素问仍常偷偷来探访，众师兄弟当她是宝贝般逢承！草堂亦对素问留下印象。素问情豆初开，对草堂亦有好感！ 平常夜遇素问，被跟平时性格完全不同的素问打个落花流水。 街上骑马者意外受伤，草堂束手无策，王九将其治好！ 天命得知此事惊呆，冷然的谓：他回来了！ 天命寻至王九居处！原来王九正是医神的另一弟子王宵！ 天命向王九讨不死药方，王九推说没有。 王九被一姑等盛情留下，其实一姑只当王九是摇钱树。

王九开起医馆，贫富远近都来求诊！王九对富人冷淡，对穷人赠医施药，令平常跟一姑血本无归！ 黄歧不服王九，带众师弟带来挑衅，结果输给王九，被天命惩罚。 平常被黄歧等耍弄撒药，草堂夜送解药，平常并不领情。 草堂夜回医馆途中遇素问，素问却像不认识般冷然相对，草堂疑惑不解。 平常在天命医馆认识了来送药且只目失明的少女小猪！原来小猪自少便无父无母，由爷爷养大！师兄弟对这个众人称之为不祥人的小猪避之不及！平常却不以为然。

小猪接近平常，平常屡次受伤。小猪只觉平常有趣及心地善良。 灵枢夜来发闷，常去找草堂出来陪伴，只把草堂弄得力竭筋疲！ 平常帮师兄治病人，被天命发现其天份，怒责之。 平常、草堂晚上跟踪素问，被婆婆发现，早晨二人醒来却赤裸郊外。 平常与草堂路遇素问，问及是否有只胞胎姐妹，素问否认。婆婆谓不让二人再惹灵枢。 素问戏弄平常与草堂，二人被婆婆救，婆婆却因此受伤被带至王九处，婆婆在他们的询问中说出了素问的病况。

他们从婆婆口中得知素问、灵枢是同一人，只是性格分裂。婆婆跪求王九医治素问，王九也无医疗方法。 王九忆起离开芍药与师父去炼不死药事，感伤万分，被平常调侃。 平常只觉在天命医馆里，学不到甚麼，他更发现天命外表虽是医学宗师模样，实则喜欢弄权，人亦没有器量，开始有点不满！ 平常奉王九命夜去三里坡采药，巧遇小猪，平常对小猪有了进一步了解。 某夜，平常跟众师兄看星星，竟看到了一条手臂！天命知道，平常在学医方面极有天份。