当年母亲带着张屏来到兰府和兰珏父亲谈事，那时他与兰珏就早已相识。张屏母亲带着兰父来到摩萝村，可随后玄机就带人来此灭村。几人行踪被发现后，兰父让张屏母子先走，张屏母亲看到后面玄机派人追杀，将张屏安置在密林中，交代儿子如果有一天想知道母亲的心病和母亲是谁就去圣湖下寻找答案。随后为了引开追兵，张屏母亲跑向密林中另一方向，最终不幸被杀身亡。

　　王砚找到张屏，将他从镜花水月术中叫醒，张屏醒来就知道了原来母亲并未抛弃过自己，族人也都是好人。张屏告诉王砚圣湖象征着敬畏自然的本心，而摩萝村部族世代研习医术、治病救人，镜花水月术也只是一种祛除心病的医术。王砚认为张屏母亲让他去圣湖水下寻找她的心病，必定意有所指。

　　兰珏带着旭东来到湖中陋室，认为当年辜青章落脚此处，如果他有秘密，最有可能藏在此处。旭东搜寻了一圈，果然在屋中地板下搜到一张图纸，图纸上标注了兰府的位置，兰珏意识到辜青章果然调查过自己。

　　另一边，张屏意识到母亲可能将秘密藏在了圣湖水底，王砚命人帮忙寻找，他们在水中找到一个木盒，木盒中放着皇子出生的玉牒。张屏带着王砚来到家中，想起幼时家中还有一位名叫小龙的哥哥，而小龙在族语中的名字是“青章”。

　　兰珏回到府中，辜青章知道兰珏已经查到线索，索性面对兰珏直接承认十年前来京不是为了科考，起初接近兰珏也是另有所图。辜青章讲述往事，三十年前太后用回生阵调换皇子，而被调换的皇子并没有死，就是他。当年张屏母亲因为会镜花水月术被玄机强行调往咒禁科。张屏在家中找到母亲留下的手札，手札中记载着当年太后用回生阵调换婴儿后，她意外发现玄机抱着一个婴儿形迹可疑的离去。跟踪发现玄机想把奄奄一息的小皇子埋在云霄山上，玄机面对电闪雷鸣心虚逃走，张屏母亲于心不忍之下带着皇子逃出京城。回到摩萝村后在村长的治疗下，小皇子竟然奇迹般被治愈。十年后，张屏母亲见小皇子聪颖好学，于是将他的身世告知，想将他带回京城。可张屏母亲没想到当年掉包皇子是太后密令玄机所为，心机善良的她带着张屏打算先去京城找清正廉明的兰林大人商量此事，却没想到迎来了整个村子的灭亡。

　　当年出于臣子本分，兰林得知消息后便亲自入宫密报太后，而那时太后初尝权利滋味，不甘掉包皇子的秘密泄露，所以下令屠杀摩萝村。而兰林也是在被玄机绑回京城后才知道这一切都是太后的阴谋。而当年兰林并未通敌叛国，此事是太后亲信所为，太后怕牵连自己将此事转嫁到了兰林头上。兰林之所以愿意认下这个罪名，也是为了保全兰珏性命。

　　辜青章表示自己此次回京，就是打算在千秋仪大典上揭露太后罪行，让她跌落权利之巅。他要让那些愚蠢之辈为了这虚妄的权利争个头破血流，他邀请兰珏共赴此盛会。临行前辜青章告诉兰珏，镜湖先生已是过去，明日开始他就是含元殿为太后医治烧伤的辜太医。张屏找到族中药方医治瘴气，这也解决了南征军的苦恼问题。

　　两个月后，张屏重回京城，可他一入京就被金吾卫发现行踪，幸亏陈筹掩护他才未被抓走。张屏想去找兰珏商量复仇一事，可陈筹只关心张屏的安全，所以只想等天亮就送张屏出城。

　　兰珏梦中复仇心切杀了太后，可他也梦到因为太后身死举国大乱，更多的百姓流离失所。惊醒的兰珏想起幼时父亲的教导，对着父亲的牌位彻夜思考自己该如何为父报仇。张屏趁陈筹睡梦中偷偷离开，他在街上趁人不注意给兰珏传信，约定两人明日归义坊内相见。陈筹醒来后发现张屏已经离开，看到张屏为他准备的爱吃的美食和留信，心中张屏表示有些事情他不得不做，一直以来都是陈筹照顾自己更多，如今自己做了一餐美食，希望日后陈筹多加餐饭，务必珍重。

　　次日，兰珏带人来到归义坊，这里许多流民聚集，张屏混在流民之中躲避官兵追查。两人躲避开周围人，找到一所房间谈话。张屏表示自己查到辜青章就是被太后掉包的皇子，兰珏表示此事辜青章已经坦诚，如今辜青章已经成为宫中太医，准备在千秋仪大典上让天下大乱，还要求自己同太后复仇。兰珏虽然知道太后与他们有深仇大恨，可如今辜青章复仇心切，全然不顾无辜之人的性命，若他在大典上引爆局势，轻则朝中动荡，重则天下大乱。

　　如今辜青章筹谋多年就是为了让太后在千秋仪大典上从权利巅峰跌落，他们很难阻拦住辜青章，兰珏认为此时唯一方法就是入含元殿将此事告知太后，让她取消大典，阻止辜青章的行动。但如此一来，太后必定会杀他们两人灭口。兰珏两相对比，还是决定先解决火药，稳定住局面，倘若能活到圣上归来，在设法惩治太后为枉死的人伸冤。

　　次日，张屏假借辜青章太医徒弟的名义混进含元殿，他面对太后将辜青章的身份透露；而兰珏则设法拖住辜青章打探他心中计划。兰珏找到辜青章，坦诚十年前与好友饮酒谈画的日子是自己最恣意的时光，而今他询问辜青章当年是否为自己饮下毒酒，辜青章表示自己当时刚刚得知要对自己斩草除根之人是自己生母，万念俱灰下饮下毒酒。也许是天意他竟然活了下来，后来他才决意复仇。兰珏将当年好友不告而别后自己写的一幅字赠与辜青章，表示自己愿意同他一起复仇。

　　兰珏本想继续打探辜青章的复仇计划，此时有人来报辜青章有人假扮他徒弟身份进入含元殿。辜青章来到含元殿，直接道出张屏儿时身份，并与张屏一同回忆儿时的美好时光。可如今儿时美好的一切都覆灭不见，一切始作俑者就是太后，辜青章表示自己要让太后受到最严厉的惩罚。张屏不认可辜青章的所为，可辜青章表示张屏因为母亲和师父无忧无虑的长大，可他当年在圣湖后山头看书意外逃过一劫，可等他听到巨响回到村中之时所有村民都已经定身而亡。而后听到玄机带人来找带有昙花头饰的男孩，他才知道这些人是来杀自己的。他将昙花头饰藏在一个同龄族人身上，而后苟且偷生，这十年间历尽艰难险阻回到京城，却发现要他死的竟然是亲生母亲。

　　辜青章给了张屏一把匕首，让他杀了太后为母亲和师父报仇。可张屏并未选择如此做，他认为用恨无法治好恨，如今一切都该结束了。辜青章控制张屏杀了太后，此时兰珏赶来，辜青章让他选择，让人意外的是兰珏竟然对外声称是张屏刺杀太后，命人将其拿下。

　　张屏被抓后，辜青章表示一切还依计划进行，他想要拿回属于自己的东西，之后也会将皇位禅让出去，让天下有实力之人都可以竞争，可兰珏认为这会引发朝野震荡，可辜青章并不以为意。

　　柳太傅召集众大臣入宫，他则调出宫中的帝系玉牒。二十年前，他曾亲眼见证皇子玉牒落成，而今帝系玉牒中却是空白，他才相信辜青章口中所说圣上为假是真话。宫中号角声响，柳太傅当众宣告太后伤势恶化突然驾崩，他安排众臣为太后治丧，并提议将千秋仪的大典和太后丧仪同办，以彰显太后的功德。

　　随后柳太傅留下兰珏，他告诉兰珏真龙将在太后丧礼上登基，仪程规制交代由兰珏全权操办。兰珏意识到辜青章在太后丧礼之上借柳太傅之力登基，而后再禅让皇位让天下有实力之人竞相追逐，此刻各路藩王都因参加千秋仪大典而齐聚京中，我朝军队又远在南境陷于战事，京城守备空虚，藩王们一旦因争夺皇位而打起仗，将致天下生灵涂炭。

　　兰珏考虑一番私下约见曹将军，他将一切真相告知，希望在曹将军的帮助下阻拦辜青章登基，曹将军表示兰珏所说和张屏所说一致，而张屏也有未说的秘密，他将张屏带来继续询问，张屏表示今日辜青章杀死太后此举过于异常，他推测辜青章在伴月楼绑走太后后就将其掉包，宫中烧伤的太后本就是假的，今日被刺死的也是假太后，所以真太后必定还活着。

　　曹将军本想让应熹公公前去查看已死太后的遗体确认真假，可应熹公公压根无法近前查看。兰珏认为辜青章既要藏住太后行踪，又要让太后目睹昭德殿发生的一切，满足这些条件的地方唯有千秋仪。可千秋仪外部已经全部封死，而地下有一条修缮用的通道，此通道或许年久失修，部分路段甚至荒废坍塌。为了不走漏风声，张屏决意带着熊将军去寻路。

　　张屏带着熊将军进入皇宫主渠的入口，可此时陈筹也前来此地，他受兰珏托付前来给张屏送东西，也担心张屏安危打算随身保护他。

　　兰珏主持太后丧仪，但也担心张屏那边的安危。张屏带着陈筹和熊将军刚在地下通道找到线索，就被人包围带走。他们被人带到辜青章面前，辜青章认为张屏处处和自己作对，如今他也没法念旧情。张屏本想让熊将军突出重围通知兰珏，却没想到被熊将军反手所刺，张屏不悔所做的一切，这世间虽险恶，也有像母亲一样善良的人。辜青章留下陈筹性命，让他为张屏收尸。

　　太后丧仪最后，柳太傅提出恭迎太后亲生子送太后一程，此时辜青章现身此处，柳太傅告诉众大臣辜青章才是先帝亲封的太子，众大臣纷纷不信此话。子时已至，钟声传来，门外传来一声凄厉喊叫。

　　门外所有人一瞬间都死亡，而太后也诈尸门外，身上披着血书。血书上言三十年前皇子病重，太后假借回生阵法以一民间男婴替之，摩萝族巫女偶然知悉，于心不忍，将奄奄一息的皇子带走治愈。二十年前巫女欲将皇子送回，与中书侍郎兰林商议，怎料太后得知真皇子在世，唯恐事情败露，决意斩草除根下令暗杀亲子。并将摩萝族人全族尽相诛杀，以叛国罪灭兰林满门。

　　柳太傅跪请辜青章玉牒一观，辜青章将幼时随身所带玉牒交由柳太傅一观，众大臣核查玉牒无误，司天监少监核查辜青章掌纹和玉牒上真皇子掌纹并无二致。柳太傅认为理应拨乱反正，拥护皇室正统，他率领部分大臣恭迎辜青章登基。王尚书认为今日太后丧仪与新皇登基同日不合礼制，兰珏现身表示历代礼制中，有二礼并行之先例。

　　随后兰珏当众为辜青章穿上提前备好的圣上登基服饰，他本想趁机杀掉辜青章，却被辜青章察觉，辜青章失望唯一好友竟然想杀自己。柳太傅准备为辜青章加冕，此时陈筹扶着重伤的张屏现身，张屏当众表示并没有换皇子一事，而辜青章也不是真正的皇子。

　　原来张屏并未被熊将军杀死，只是借熊将军之手让辜青章以为自己已经死去。张屏手中拿着真正的皇子玉牒，所以他知道辜青章手中玉牒是伪造的。张屏推测棺材内还有一位太后，而门外的太后根本就是假太后，从始至终就没进过灵柩。辜青章在回生阵上就将太后换成了假太后，而前日被杀的也是假太后，后来假太后被刘公公转到暗渠中，刚刚一番装神弄鬼后，将假太后从暗渠中带出，让其披上血书制造冤魂控诉的假象。而此刻躺在灵柩中的才是被辜青章从伴月楼带走的真太后。曹将军审问给太后入殓的女官，确定真太后就在灵柩中。

　　曹将军命人打开灵柩，果然发现太后还有气息，太后因被施针导致陷入沉睡状态，但其实她意识清醒。拔针后不久太后就清醒过来，可面对柳太傅的质问，太后并未否定辜青章的身份。张屏从太后手掌印信息验证了辜青章手中玉牒是伪造。此时此刻，辜青章并未否认玉牒是伪造，但他质问张屏不是一直查案想要探寻真相吗？如今为何不追寻真正的真相了。张屏却直言辜青章就是镜湖先生，只是一个妄想当圣人的癫狂之人而已。辜青章感慨张屏会说谎了，他已经长大了。辜青章转身告诉太后，今晚全城夜幽昙将为其释放，而他也改良了血雾之毒，夜幽昙开花之时血雾可遍布全城，百姓会在幸福的幻想中全身僵硬而死。

　　张屏认为辜青章无法操纵花开，却没想到他操纵摩萝村陶哨令夜幽昙开花，宫中有人陆续死去，百官惊慌失措，辜青章趁乱带走太后。张屏推测出夜幽昙花开的秘密，可如今皇城中毒雾蔓延，他们要想办法解救百姓。张屏和兰珏等人连忙赶往城中疏通百姓，躲避血雾残杀。

　　辜青章将太后带到高处俯视大雍百姓被血雾笼罩的一幕，太后身为母亲，却最爱权力，舍弃儿子获得了这一切，如今他要让太后目睹百姓身亡。可太后认为权力本就冷酷无情，即便到如今地步她也从不曾后悔。她甚至感谢辜青章做所的一切，因为今夜之后全城人都死之后，就再也没有人知道自己的秘密了。眼见太后执迷不悟，辜青章失望至极，冷漠放任太后于此地被血雾淹没，太后临死前告诉辜青章他的真正乳名叫昙儿。

　　张屏和兰珏等人商讨如何带百姓躲避血雾，张屏想起只要下雨自然能让阻止夜幽昙花粉在空气中传播，而用引雨器将盐撒向高空，能令雨迅速降临。兰珏带着陈筹去疏散百姓，张屏则带着旭东等人前去盐商店铺搬运盐袋。

　　国难当头，士子、官员、百姓纷纷互助，大家一起疏散到百姓前往云霄山暂避血雾。复仇成功的辜青章内心并没有多满足，漫步在街上的他看着百姓纷纷逃亡，意外听到街边被丢弃的婴儿啼哭声，他以为这个婴儿也是被母亲丢弃，本想带着他一同离开，可婴儿的母亲找来带走婴儿，他才意识到这个世界上只有自己的母亲会舍弃自己。苦笑一声，辜青章漫步在血雾中孤单的离去。

　　在众人的齐心协力下，大家将筹集来的盐用炮弹弹向高空，在无数人的期盼下，天降大雨将血雾驱散，百姓纷纷欢呼京城获救。张屏将二十年前兰林赠与自己的兰花香囊回赠兰珏，兰珏非常开心能收获父亲的旧物。

　　次日，百姓纷纷回城，而圣上也凯旋归城。圣上听闻京城遭逢大难，特率精骑快马来援，眼见危难解决，战事无忧，家人团聚，举国欢腾。

　　圣上为张屏送行，表示日后自己会开创新气象，还百姓一片大好河山。张屏并不在意皇帝的血脉真假，能让百姓安居乐业、天下无案可查就是好皇帝。圣上告诉张屏自己之所以派他去宜平县做县令是因为现在京城余波未平，太后余党尚未肃清，张屏性子耿直牵涉其中十分凶险。等张屏外放几年，圣上还期许他之后回来当大理寺卿。

　　随后张屏带着陈筹前往宜平县赴任，陈筹打算日后帮助张屏办案，也期待两人的日子越过越好。王砚调任大理寺卿，命人将案牍库积压的卷宗搬出，他决意一一将这些案子查明。

　　这些年为父洗冤，深陷危局，兰珏怕殃及儿子兰徽，将其寄养在乡下，如今父亲兰林沉冤昭雪，兰珏决定将儿子接回府中父子团聚。而张屏虽然是宜平县的县令，但是闲暇之余还是会带着陈筹来街上卖面。这日，兰珏调任巡抚使，代天子巡狩各郡，如今刚好来到宜平县。兰珏找到张屏面摊，拿出五文钱向张屏买面吃。两人相视一笑，恰如初见场景。