当审判再度展开，地方环保局也被列为被告一方。第三方专业进行的水质鉴定发现流管内确实混浊不清，充斥金属镉，意味着化工厂排放的废水的确具有毒性。由于此事的发生，环保局由于明显失职，现在不止化工厂需要对患病的受害人承担赔偿，环保局也需承担连带责任。
被告方陈述答辩，并没有认同化工厂存在错误的行为，反倒一再强调环保局的检测准确，试图证明化工厂并未擅自排污污染本地的地下水。化工厂和环保局的答辩之声同样强硬，坚称自身是清白的。公益律师朱黎明对此深感愤慨，他坚信在法庭上陈述，根据手头的水质样本，化工厂排出的水中含有大量的镉元素。
技术人员曾进行污染设备的检查，他们发现化工厂的设施虽已启用，但持续运行的时间并不会超过二十个小时。然而，化工厂在当地已经运营超过六年，假如运行时间这么短决不可能完成正常的处理，这充分证明平时的排污是无任何处理的裸排。
而后被告的代理人表示他手头有新的证据，他认为本地村民的疾病与化工厂之间并无关系。尽管法律规定逾期提供证据将不被接受，被告代理人坚持他的证据重要而与本案有直接关系。经过审判长齐衡同意，被告代理人提出了一个机器的使用时间检测表，称过滤机器其实运行了长达二十个小时，是因为操作工正在操作时不小心将数据重置。
齐衡在新的证据面前，不能证明化工厂未使用水处理设施，最后宣布休庭。回到办公室，秘书马拉松越想越气，她坚决不相信被告的陈述，而齐衡叮嘱她，作为执法人员，要相信证据，并不能完全依赖猜测。他还告诉她，案件仍在调查中，相信最新的线索不日便会出现。
朱黎明传达了一个消息，化工厂在法庭文件立案后的几天里，车间加班熬夜不断。而在此期间，化工厂的车间主任秦厚土不幸住进了医院，似乎受伤严重。朱黎明探望了他，由护士口中得知，秦厚土实际上是被重物砸伤，下身完全瘫痪，应该是挖设水管时发生事故。
朱黎明希望秦厚土能够在法庭上作证，证明其实化工厂在检测的那个水管，只是临时切断，然后用速干水泥修复。秦厚土很清楚，前几天化工厂的人送来十万元，只要他保持沉默，不向外界进一步揭露排污的事情，他们家以后的生活和医疗费用厂里将会全力报销。秦厚土问朱黎明若这个选择任由他来做，他会做何选择。朱黎明无言以对，正义与维持生计之间，这些人似乎只能选择其一。
时间又进入了开庭的日子。朱黎明原先以为秦厚土不会献出证词，然则却出人意料，秦厚土坦言化工厂很少使用排污设备。他们一直裸排，水污染直接流向了河里，所以大多数村民都生病。