六年前，当星矢他们还在日本训练的时候，一辉是一个爱护弟弟的哥哥。但是，由於瞬不幸地派到死亡皇后岛修练，於是一辉便代替瞬去这恐怖的地方。不过六年后回来的一辉已变成了充满憎恨的魔鬼。一辉的出现令比赛中断，他还先后把瞬及邪武打伤，这时狼座的那智穿上圣衣，要与一辉决战，不过，拥有惊人力量的一辉使出凤凰幻魔拳，瞬间便把那智的神经摧毁了。一辉的暗黑凤凰军团更把人马座黄金圣衣带离竞技场，星矢等人於是立刻追了出去。

一辉与及暗黑凤凰军团带着黄金圣衣，自竞技场逃跑后不知去向，星矢等人唯有分头搜寻，最后在六年前送一辉去死亡皇后岛的码头找到他们匿藏的地点，而一辉正在试图穿上黄金圣衣。 几乎穿上黄金圣衣的一辉被星矢破坏了计划，於是他命令暗黑凤凰军团带着圣衣离开。星矢、紫龙、冰河、瞬分别击倒了四名暗黑凤凰，夺得人马座黄金圣衣的双腕及双腿四个部分，从他们的口中得知他们只是被一辉的力量所支配，而且暗黑军团还有最强的四人还未现身。 大家知道与暗黑军团的一战在所难免，但是天马座及天龙座的圣衣已经损坏了，紫龙为了修补圣衣，於是带着两件圣衣返回中国。

由於银河擂台赛的突然终止，沙织的城户财团被传媒逼得透不过气来。为了找寻一辉的下落，星矢带着猎犬四出搜寻，而瞬因为怀念着童年时候的一辉，来到了昔日一辉练拳的一棵大树下。瞬发现了白鸟座的十字架标志，同时四周突然下起雪来，暗黑四天王的暗黑天鹅出现了。他向瞬施展了猛烈的攻击，但是被真正的白鸟冰河所阻止，而星矢也跟着猎犬来到了。冰河的冻气把暗黑天鹅击退了。暗黑四天王的暗黑天马、暗黑天龙、暗黑天鹅及暗黑仙女从死亡皇后岛来到了一辉的面前，一辉把黄金圣衣的四个部份交给了他们保管，自已则保管着头部，誓要消灭青铜圣斗士，夺回其餘的四个部份。

一辉的挑战书终於送到青铜圣斗士的手上，定下了决战的日期及地点，而星矢则担心着紫龙的安全。另一方面，紫龙回到庐山五老峰上，从老师童虎口中得知有一个叫穆先生的人，他深居於帕尔米高原上，是世上唯一拥有修补圣衣能力的人。紫龙通过了老师的考验后，带着两件圣衣起行。来到了圣衣坟场的紫龙，受到了亡灵的攻击，幸好紫龙得到老师的提点，安全地闯过了圣衣坟场。紫龙来到穆先生的公馆，遇上了顽皮的贵鬼，同时也见到了穆先生。因为圣衣已经死了，所以连穆先生也无能为力，不过着急的紫龙却愿意牺牲自己的生命，救活天马及天龙的圣衣。

决战的日期终於来到了，星矢、冰河、瞬依约来到杀生谷，但是紫龙还没有回来，不过贵鬼把修补好的天马圣衣带来给星矢。原来救活已死的圣衣是需要大量圣斗士的血液，紫龙为了友情，不惜流出身上过半的鲜血，昏倒在穆先生的面前。星矢为了报答紫龙的友情，决心打败一辉，取回黄金圣衣。星矢在途中遇上了暗黑天马，於是使出天马流星拳把他打败，不过自己也中了黑死拳。另一方面，冰河再次遇上暗黑天鹅，暗黑天鹅明知不敌也不向冰河求饶，令冰河非常敬佩他，於是使出了最强的金光火焰旋风拳把他打败。星矢前进的途中，发现身上中拳的地方发黑，而且像是被火烧一般，抵受不了的星矢最后掉下山崖，昏了过去。

冰河先到达了狮子崖，与一辉决战，可是连金光火焰旋风拳也不能损一辉分毫，而且更被一辉的幻魔拳打中，陷入了恐怖之中。冰河的心臟也受到了重创而倒下了。瞬在途中发现了山崖下的星矢，欲把他救起来，不过由於要拉着星矢，所以被暗黑仙女的锁链攻击。星矢不忍见到瞬被连累，自己切断了锁链掉下深处。悲愤的瞬用星云锁链打败了暗黑仙女，接着要面对的是暗黑天龙。从鬼门关回来的紫龙与暗黑天龙接战，而瞬则爬下山崖救星矢上来。