山本五十六突然驾临，他对芳子的殉国同样痛心。此时紫光二号的情况极其危急，山本五十六十分恼火，如果紫光二号被破，只有提前启用紫光三号。山本五十六要小川拿出对策，小川决定空投间谍，栽赃文为均，内部瓦解密电所。出于种种考虑，他选择了小野平。

临行，山本康夫约见了小野平，他已得知了芳子的死讯，此时他已心灰意冷，做好了必死的打算。看到小野平，山本康夫不禁想起了芳子，他情绪激动地抓住小野平，要他一定活着回来。

紫码二号的破译已经进入了最后阶段，“黑室”中文为均主持四人完成最后的比对工作，而钱德勒却要提前回国，他在这里失去了最爱的女人，同时也没有完成青田秀的嘱托，他将回美国与青田秀见面，告诉她发生的一切。听到此处，文为均也不禁动情，青田秀已经失去了太多东西。

就在此时，厉峰也得到了消息问讯赶到，做好抓人的准备。毛祖和带来了委员长的命令：郭忠良可以抓，但他是破译组的重要成员，要谨慎处置。但林平是忠良之后，不是共产党，不能抓。

钱德勒就要起身回国，文为均将一本自己的日记交给钱德勒让他转交给青国秀。钱德勒告诉他，如果要联系青田秀，他将会尽其所能。

“黑室”内，黄永青与郭忠良交谈，师生二人开诚布公，通过交谈，黄永青了解到郭忠良的真实身份，郭忠良也希望黄永青能了解一下共产党的主张，正在此时，厉峰冲进“黑室”强行逮捕了郭忠良。

调查局内，厉峰对郭忠良采用了最严酷的刑法，但却没有让郭忠良就犯。

厉峰找来徐雅兰，拿出了一组照片，里面是文为均当年在日本参观海军部和密电所的照片。徐雅兰将这些照片藏了起来，没想到还是被厉峰的手下得到。厉峰威胁她，如果不继续与他合作，他就将这些照片交给文为均，然后将罪名推给徐雅兰。

面对文为均，徐雅兰再也无法掩饰，她将自己的身份告诉了文为均，但她却没有想到，文为均早已经知道她的身份，他早已深深爱这了这个女人，但徐雅兰却无法面对自己的良心和情感，终于，她跑进屋里，举枪自尽。

小野平成功抵达重庆，这回还是由惠子接应。小野平这回的计划是诬陷文为均，按照计划，他来到文为均家与文为均联络，将山本康夫写的劝降信交给文为均，还有当年文为均在日本的照片。文为均看出了他的来意，他找来特工将小野平带走。

钱德勒回到了美国与青田秀见面，他将芳子的事告诉了青田秀。本以为钱德勒能带回自己的女儿，却没想到芳子惨遭厄运。

毛祖和拜访文为均，她告诉文为均，虽然调查局不会相信小野平的话，但介于文为均的特殊身份，不得不引起别人的注意。文为均看出了毛祖和的想法，夹杂在几方势力之中，文为均早已厌倦，他终于决定辞职。

调查局对郭忠良的审讯毫无进展，只能按期放人。黄永青和林琴的情感发展也很顺利，二人相约破译紫码二号后确定关系。

文为均决定去美国，临行前他来向黄永青和郭忠良道别。黄永青和郭忠良依依不舍。文为均告诉他们，他的老师兰丝教授告诉他，通过可靠情报，日本将在紫码二号被破后启用紫码三号。

厉峰故意设下圈套，告诉韦国平紫码二号将于今晚被破。韦国平信以为真，将这个消息传给了紫码中心，小川命令惠子今晚行动，并派汉口空军支持，不惜一切代清洗密电所。

这次，韦国平再也插翅难飞，厉峰亲自出马，王浦江的特工将韦国平和胡蒽梅。韦国平自知已无活路，他将一颗子弹留给了妻子，另一颗留给了自己。

根据情报，日本特务将会在今晚袭击密电所，王浦江奉厉峰之命，事先做好了准备。不出所料，惠子带领所有精锐特工倾巢出动，夜袭密电所。王浦江带特工与日本特工展开了激烈的枪战，此时厉峰也带领大队人马赶到。

王浦江掩护密电所成员撤离，为了掩护林琴，黄永青中弹倒下。

日本特工的人数越来越少，惠子并没有像以往一样撤离，这次她抱定了必死的决心，最终，她还是倒在了老对手王浦江的枪下。

所有日本特工都已经被击毙，但厉峰不会放过郭忠良。他要让郭忠良像黄永青一样牺牲在今天的行动中，就在此时，王浦江的枪口突然对准了他。厉峰万万没有想到，身为调查局主任，他最的左膀右臂，一个是汪伪特务，一个是中共地下党员，而郭忠良也没有想到，原来王浦江也是自己的同志。王浦江让郭忠良带着破译的紫码二号先走，自己来处理厉峰。

王浦江在与厉峰对质，装死的惠子突然出去，向二人开火，厉峰中枪倒下，惠子也被王浦江击中，这回她再也站不起来了。王浦江拿枪指着受伤的厉峰，却迟迟没有扣动扳机，就在这时，大队宪兵赶到，王浦江没有了下手的机会。但出乎他的意料，气息奄奄的厉峰并没有揭穿他的身份，大势已去地闭上了眼睛。

陈克再次与毛祖和见面，而这次是在重庆八路军联络站。陈克将郭忠良带回的紫码二号交到他的手中。

紫码二号被破，紫码三号只能提前启动。山本康夫告诉他，如果破译自己的紫码三号，只有依靠密码机，但中国人对密码机的研究几乎为零。而且就算有了密码机，也是不可能破译的，因为他对这组密码加入了两把密钥，而这两把密钥已深藏在自己心中，无论是多伟大的数学家都不可能破译。

高桥拿来了一本杂志，上面有青田秀发表的文章，高桥告诉他可以通过读者来信的方式和她沟通，当然不可以用真实的姓名。

文为均来到美国，在兰斯教授的帮助下破译紫码三号。通过兰斯教授提供的密码机很快找到了第一把密钥，但第二把密钥却迟迟没有进展。据文为均判断，它将可能是几个字母或名字的缩写，他试过青田秀、山本康夫、芳子和惠子的名字，但都不成功，兰斯教授提醒他把自己的名字加上，因为他是山本康夫一生的朋友、对手，他早已经埋藏在山本康夫的内心深处。

文为均加上了自己的名字果然成功了，第二把密钥正是他们五个人名字的缩写，这也意味着文为均破译了紫光在号。

毛祖和和黄永青约见美国驻华武官，通过破译的电报，日本人将于1941年12月7日袭击珍珠港，对方虽然很客气，也表示了感谢，但美国人显然对中国的破译能力表示怀疑。

美国武官与克来因上尉商议后，决定按照程序将中方的通报发往美国。但此时的美国情报机关面对来自各方的情报，已经焦头烂额，无法判断真伪。

终于，1941年12月7日，日本开始袭击珍珠港，并取得重大胜利。这也证实了文为均的判断。

1943年4月18日，山本五十六大将为了鼓舞士气，乘飞机前往前线视察，由于提前破译了密码，美国空军准确进行拦截，山本五十六机毁人亡。日本政府举行隆重的国葬。

第二天，山本康夫回到家乡，在家人的灵位前，这一次，他终于成功地挥刀自尽。

青田秀最终没有跟文为均在一起，他决定一生一世都不离开丈夫，而现在她能面对的只有亲人们的灵位。

1956年，文为均回到中国，郭忠良、陈克、林琴、王浦江等人在机场迎候，他们共同成为新中国密码事业的奠基人。